| Predicted mutation | ||||||
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| RA | DH1 | 3,154,902 | A→T | I274F (ATC→TTC) | kdpB → | potassium‑transporting ATPase B chain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | DH1 | 3,154,902 | 0 | A | T | 97.9% | 1333.3 / 9.0 | 386 | I274F (ATC→TTC) | kdpB | potassium‑transporting ATPase B chain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/5); new base T (184/193); total (187/199) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.25e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 386 total aligned reads displayed.
GCTGATTGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGATCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGCGTCGGAGTTTA > DH1/3154754‑3155049 | gctgATTGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTc < 4:868270/151‑1 (MQ=255) ctgATTGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCCCTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCg > 3:1457803/1‑151 (MQ=255) gagtGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGc < 1:1538664/148‑1 (MQ=255) 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cTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCg > 2:246367/1‑151 (MQ=255) cTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGAt > 5:1510596/1‑151 (MQ=255) tATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGATCGGCGTCGCCGGGATg > 5:1826179/1‑151 (MQ=255) aTCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATg < 1:1732936/150‑1 (MQ=255) aTCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATg > 3:1361806/1‑150 (MQ=255) 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tATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAAc > 8:1325932/1‑151 (MQ=255) aTTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAAcc > 7:673196/1‑151 (MQ=255) aTTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAAcc < 5:1155752/151‑1 (MQ=255) ggcCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAgg > 7:580480/1‑151 (MQ=255) ccTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGCg < 5:476309/151‑1 (MQ=255) 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cAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAAGCGTCGGAGtt > 1:1298243/1‑151 (MQ=255) aGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGCGTCGGAGttt < 2:1169701/151‑1 (MQ=255) | GCTGATTGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGATCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGCGTCGGAGTTTA > DH1/3154754‑3155049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |