| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 1519281 | 391 (0.670) | 73 (0.140) +AACCTTCTAATT |
51/276 | 32.1 | 16.9% | coding (788/900 nt) | yfaD | transposase |
| ? | DH1 | 1519282 = | 391 (0.670) | coding (787/900 nt) | yfaD | transposase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
AGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1519245‑1519281‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATT > DH1/1519282‑1519429 |||||||||||| AGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGTCAATCTCCTCA > 1:1867620/1‑150 GCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTAAGCAATAGTCATTAATCTATCCTTTTGTAGTGCTGAACGATCCTCAAACTCATCAAT > 4:1898128/1‑151 ATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTGTGGTTACGGATCAGCAATCTCCTggata > 5:797660/1‑145 TGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTTTAGTGGTGAAC > 1:2163091/1‑129 ctAAGCAATTTTAATCGCTTGTTCATGCAAACCTTCTTATATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTC < 2:942185/136‑1 CAAATCAATTGTCATAGCTATTTTATGCAAACCTTCTACTATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGG < 3:1902924/151‑1 CAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTGTGGTGAAGGTTCGGCAATCTC > 1:944633/1‑138 CAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGATCTGCAAACTCCTCAATAAAACGGGTGA > 5:1978744/1‑150 CAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTATCCTTTTGTAGTGGTGAACGATCAGCAAAATCCTAAATAAAACTGGTG > 4:1248661/1‑149 CAATTATAATGGCATTTTCAAGCAAAACTTCAAAATTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTG < 3:1251903/149‑1 ATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGATCTGCAATCTCATAAATAAAACTGGTCAAAC > 2:55373/1‑151 TTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTGTGGTGAACGTTCAGCAATATCATGAATAAAACGGGTCAAACG > 7:337725/1‑151 TTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGACGGTTGGGCAATCTCATCCATAAACGTGGTGAAACGG > 5:621796/1‑151 TTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGAGCTGAACGT > 3:1463478/1‑118 ttcATGGCTTGTTTATGGAATCCTTCTTATATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTC < 4:1203617/93‑1 TAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGA < 4:1521550/112‑1 AATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGACCGTTCGTCAATCTCATCAATAAAACTGGTGAAACGcg > 3:1276815/1‑147 ATGGCTTGTTTATGCAATTGTTCTATTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGG < 6:1975048/151‑1 TGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACG < 7:24015/136‑1 TGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAAAATCCTCAATAAAACt > 8:23962/1‑135 cGCTTGTTCATGGAAAGCTTCTTATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACG < 1:1183382/134‑1 GGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTTTAGTGGTGAACGTTCTGCAATCTCATCAATAAAACt > 2:1180306/1‑134 CTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTTAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACTGGTGAAACGGGAGGTATC > 3:1484160/1‑151 CTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGTCAATCTCCTGAATAAAACGGGTGAAACGCGAGGTATC > 6:769151/1‑151 CTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCT > 5:689250/1‑120 CTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCT < 6:687922/120‑1 TTGTTCATTCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTT < 4:1511252/110‑1 TTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTT > 3:1514995/1‑110 TTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGACCGTTCGGCAATCTCCGAAATAAAAGGGGTGAAACGGGAGGTATCc > 6:436155/1‑150 TTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGG > 4:911194/1‑142 TTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGG < 3:913458/142‑1 TTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGACCTTCCTGCCGTAGCCG > 6:176093/1‑66 TTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGACCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTATAGTGATGAACGTACGGCAATCTCCTCAATAAAAGGGGTGAAACGCGAAGTATCc > 8:1430711/1‑150 ttttaATGCAAATGTTCTATTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCG < 4:1273536/145‑1 attttattctctagTTCTACTATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATC < 6:796107/135‑1 TGTTCATTCTAACCTTCTATTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCA < 6:1907035/79‑1 TGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTAGTCAATCTCATCAATAAAACTGGTGAAACGGGAGGTATCGC > 3:2131158/1‑151 TGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGGGAACGATCGGCAAACTCCTAAATAAAACGGGTCAAACGGCAGTTATCGC > 6:874537/1‑151 TGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGC < 5:1119638/71‑1 TGTTCATGCAAAACTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACG < 5:2106315/140‑1 GTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCC > 6:1760359/1‑151 GTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGAGGTGAACGATCGGCAAACTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGCGAGGTATCGCC > 5:1460707/1‑151 GTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCT < 8:1244192/120‑1 TTCATTCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGT < 3:1609122/106‑1 TTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTTAACGTTCGTCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCG > 1:615958/1‑151 TTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGT > 4:1605132/1‑106 TCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATC < 3:1976511/82‑1 aATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCG < 3:2207368/106‑1 CATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGACCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCG > 4:2201650/1‑107 attcaatcgTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCAT < 2:141168/142‑1 ATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACTGGTGAAACGGGAGCTATCGCCGCAT > 1:141577/1‑151 ATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGTCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGCGAGATATCGCCGCA > 4:349918/1‑150 ATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATC < 4:850629/144‑1 TGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGG > 3:1741709/1‑95 TGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTG > 6:932186/1‑94 TGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGG < 4:1737412/95‑1 TGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTG < 5:934027/94‑1 tCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTT < 5:1612308/59‑1 GCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTG > 6:2274565/1‑96 GCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTG < 5:2278818/96‑1 gacagcttcttcaTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGC < 6:789174/138‑1 CAAAGCTTCTACATTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAA < 3:1995863/130‑1 AAACCTTCTACTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAA < 1:2196284/96‑1 AAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAA > 2:2190729/1‑96 AAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGT > 2:1391029/1‑90 AAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGT < 1:1394491/90‑1 AAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGACCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCG < 5:366842/102‑1 AAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGACCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTATAGTGGTGAACGTTCG > 6:366103/1‑102 AACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTGTGGTGAACGTTCGGCACTATCATCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCGTCATTCCAc > 3:619038/1‑150 ACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTtgtca > 7:610765/1‑98 ACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTCGTGAACGTTCGTCAATCTCCTAAATAAAACTGGTGAAAAGGGAGTTATCGCCGAATTGCAGC > 2:1997590/1‑151 ACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTTGGCA < 8:609592/103‑1 ACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGC < 4:1480473/151‑1 CCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGC > 5:2241937/1‑150 gttctttTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGGCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCA < 6:2279036/143‑1 CTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATC < 8:1450288/104‑1 TTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTTTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGC > 4:1209995/1‑148 tctttaTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGA < 5:223358/144‑1 tcaaaaTTAGCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGACCTTCCTGCCGAAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCTGCAATCTCCTGAATAAAACGTGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGA < 7:1924123/144‑1 TCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTC > 3:355929/1‑107 TCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTC < 4:355233/107‑1 CTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGATCG > 3:1780626/1‑95 tacTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCG < 5:2155466/91‑1 aAATATACCTTCCAGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAA < 4:617668/150‑1 TAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCG > 6:2151515/1‑94 acTTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAA < 5:876274/148‑1 AATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCATCAATAAAACGGGTGAACCGGGAGGTATCGCCGCATAGCAGCAGATAAT > 2:1812414/1‑151 AATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATA < 5:437036/149‑1 ATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGACCGTTCGGCAGTCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCAATGCAGCAGATAATT > 3:2143724/1‑151 ATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGT > 5:2296274/1‑115 ATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTATAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATT > 4:2016939/1‑151 ATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCA > 1:804211/1‑50 ATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATT < 4:2138228/151‑1 ATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCA < 2:802158/50‑1 TTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGCAACGGGAGGTATCGCCG > 5:1659294/1‑133 TTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCG < 6:1656110/133‑1 TTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAAGCTCATCAATAAAACGGGTGAAACGGGAG > 5:1894711/1‑123 TTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGGAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAAT > 8:1734742/1‑95 TTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAG < 6:1891185/123‑1 TTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAAT < 7:1738294/95‑1 |||||||||||| AGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1519245‑1519281‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATT > DH1/1519282‑1519429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |