| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | DH1 | 2,238,049 | Δ3 bp :: repeat_region (+) +5 bp :: Δ1 bp | coding (157‑161/216 nt) | essQ → | Lysis protein S homolog from lambdoid prophage Qin |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 2238049 = | 30 (0.050) | 567 (0.970) | 241/300 | 0.0 | 94.8% | coding (157/216 nt) | essQ | Lysis protein S homolog from lambdoid prophage Qin |
| ? | DH1 | = 2410568 | NA (NA) | noncoding (1334/1335 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
| * | ? | DH1 | = 2238053 | 30 (0.050) | 592 (1.010) | 256/300 | 0.0 | 95.0% | coding (161/216 nt) | essQ | Lysis protein S homolog from lambdoid prophage Qin |
| ? | DH1 | 2409238 = | NA (NA) | noncoding (4/1335 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Only 100 of 567 total aligned reads displayed.
TCTTTGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < DH1/2238198‑2238049‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCT < DH1/2410568‑2410419 TCTTTGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGT > 3:1246031/1‑151 TTGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGG < 6:176533/150‑1 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> 3:1055601/1‑151 CTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGC > 5:79667/1‑151 CCTTTCTCAAGCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTAGTCTCCTCTCGCAGGCTTACGCCTTTCTTCTTTAATCTTGAAATATAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCC < 4:1385364/150‑1 TTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC > 5:921657/1‑151 TTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGC < 8:1963922/150‑1 TCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTG > 1:2256451/1‑151 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5:2299452/1‑151 TTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCT > 2:1760302/1‑151 TTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGC < 5:1933713/149‑1 AATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCa > 1:1109742/1‑149 AATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCG < 8:751057/150‑1 ATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGA > 1:1618780/1‑150 CTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACG > 7:1630354/1‑151 CTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACG > 5:2172061/1‑151 TGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACG < 8:27447/149‑1 TGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAAC < 5:2026545/148‑1 TGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAAC < 8:1451842/148‑1 TGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAA < 1:102227/147‑1 TGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATATCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAAC < 6:1543932/148‑1 aatTAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGCTATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTC > 6:1416992/4‑151 AATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCT < 2:840977/151‑1 ATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTG > 4:576124/1‑151 ATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTG > 8:1732815/1‑151 AAAGATTTGTCAGTGGTTTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC > 7:2259965/1‑150 AAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC > 4:115522/1‑150 AAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC > 4:1492178/1‑150 cATTTGGCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGG < 4:1666170/150‑1 TTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGACCGCCTCTGCAAGGTTC > 7:2078174/1‑151 GTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTT < 6:45833/151‑1 CAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG > 2:1651667/1‑151 CAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT < 5:1469894/150‑1 AGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC < 7:1452771/151‑1 AGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGC > 2:259395/1‑151 TCTTTGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < DH1/2238198‑2238049‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCT < DH1/2410568‑2410419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |