| Predicted mutation | ||||||
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| JC | DH1 | 3,702,452 | (GTCATAACGACCGCCTAGGG)1→2 | coding (1442/2244 nt) | fhuA ← | ferrichrome‑iron receptor |
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| ? | DH1 | = 3702452 | 94 (0.160) | coding (1442/2244 nt) | fhuA | ferrichrome‑iron receptor | |||||
Only 100 of 1201 total aligned reads displayed.
CGAAGAAGGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCGGA > DH1/3702283‑3702583 | ctatagctgaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgctctgcccagtcataacgaccgcctagggGTc < 4:474205‑M1/3‑1 (MQ=255) agaagGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTc > 4:1566194/1‑150 (MQ=255) atatctgaagtaatgtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaagtgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgctgttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggg > 7:1517542‑M1/147‑147 (MQ=255) atagctgaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggGTc > 7:1914739‑M1/147‑149 (MQ=255) aagGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCAt > 4:1462257/1‑150 (MQ=255) agctgaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagcttcttgatctgccaagtcataacgaccgcctagggGTCATa < 3:641750‑M1/6‑1 (MQ=255) agctgaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggGTCATa > 1:1659697‑M1/145‑150 (MQ=255) agctgaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggGTCATa < 3:2114026‑M1/6‑1 (MQ=255) 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aaCGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggc > 6:1496357‑M2/1‑50 (MQ=255) gcgGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGCCCGCCTAGGGgtcataacgcccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccgg < 8:2214455‑M2/151‑105 (MQ=255) gTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggcgggagt < 4:854914‑M2/151‑108 (MQ=255) cccagtcataacgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTg < 1:1898989‑M1/127‑1 (MQ=255) ttAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtt < 4:200141‑M2/151‑109 (MQ=255) ttAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcacactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccgcagtt < 5:534618‑M2/151‑109 (MQ=255) ccagtcataacgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGa > 6:1053974‑M1/24‑151 (MQ=255) agaTTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccg > 1:334797‑M2/1‑38 (MQ=255) accgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTAACCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGaa > 7:124212‑M1/16‑150 (MQ=255) acgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAAt > 1:1015813‑M1/15‑151 (MQ=255) cgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATc < 6:1750068‑M1/138‑1 (MQ=255) ccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGt < 6:2121956‑M1/141‑1 (MQ=255) cTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttggc < 3:178111‑M2/150‑124 (MQ=255) cccAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttggcattg < 7:699259‑M2/151‑128 (MQ=255) cccAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtctgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttggcattg < 3:921227‑M2/151‑128 (MQ=255) agggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCa > 8:299261‑M1/5‑150 (MQ=255) gGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCgg > 1:1238606‑M1/2‑151 (MQ=255) | CGAAGAAGGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCGGA > DH1/3702283‑3702583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |