| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 1519086 | 406 (0.690) | 45 (0.110) | 35/220 | 32.4 | 14.1% | coding (71/186 nt) | ECDH1_RS07485 | hypothetical protein |
| ? | DH1 | 1519282 = | 249 (0.580) | coding (787/900 nt) | yfaD | transposase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 432 total aligned reads displayed.
GCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATTAA > DH1/1519135‑1519431 | aGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGAGAGTTCCGATGATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCCGCACAATCTCACGTTCAAAGAGCTGCTAAAGAATGAGCCAATCAATTTTAATGGCTTTTTTATGCATACGTTCCTgccac > 7:606880/1‑150 (MQ=255) aGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGAATCAGTCAGTAGGGTTGTCGCCAGCAAAATATCACGTAAAAACACCTGATAAATAATGAGCAAATCAATTTTAATGGCTTGTTAATGCAAAcgatccaaccac > 3:253558/1‑140 (MQ=255) cAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCAAAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCATCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTAATGCATACCTTCCTgccagcc > 4:1235784/1‑151 (MQ=255) aaTAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAACGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTgccagcc > 5:547351/1‑150 (MQ=255) aaTAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTgccagcc > 2:1688220/1‑150 (MQ=255) aGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAAtt > 1:1077071/1‑151 (MQ=255) aTTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGAt > 8:1369029/1‑151 (MQ=255) ttAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATg > 7:1519870/1‑151 (MQ=255) tAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGc > 6:995055/1‑151 (MQ=255) aaTCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGcc > 2:854467/1‑151 (MQ=255) ctctcCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCtt > 3:1802888/1‑151 (MQ=255) ccTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTg > 1:1569210/1‑151 (MQ=255) cTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGc > 3:92636/1‑151 (MQ=255) tttAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCg > 1:1857283/1‑151 (MQ=255) tttAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCg > 8:153409/1‑151 (MQ=255) tAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCATCCAATTTGATGCCATTCCTGCCGt > 8:1086986/1‑150 (MQ=255) aaTGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGt > 5:155166/1‑149 (MQ=255) gataggctgccatatCCGCTTCGCTGAGGTGGGTGGGCGCCAGCACATTGTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGcc < 5:2109812/139‑1 (MQ=18) gACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCg > 4:405050/1‑151 (MQ=255) gttctatCGGCTTCTGTGAGCTGGGTGGGCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCaa < 1:749609/147‑1 (MQ=25) ggAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCa > 5:805588/1‑150 (MQ=255) gAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAAt > 4:1366297/1‑151 (MQ=255) aaTATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAAt > 6:1914092/1‑150 (MQ=255) atatCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAAt > 2:640286/1‑149 (MQ=255) atatCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAAt > 5:1097002/1‑149 (MQ=255) atatCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAAt > 6:1059422/1‑149 (MQ=255) tatCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGt > 3:1741150/1‑151 (MQ=255) tatCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGt > 6:347788/1‑151 (MQ=255) tatCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCACCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTCCCAGCCAATTTCATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGt > 2:416677/1‑151 (MQ=255) gCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCAtt > 7:2077836/1‑150 (MQ=255) gCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCAtt > 4:1120545/1‑150 (MQ=255) aTCAGTGACTTGGCTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTCCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCATGCCAGCCAATTTGATGACCTTCCTGCAGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTaa > 4:779901/1‑150 (MQ=37) cAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAAtct > 6:1495321/1‑151 (MQ=255) cAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACATTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAAtct > 4:52483/1‑151 (MQ=255) aGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAAtctc > 5:1338352/1‑151 (MQ=255) gttaggtgggtgggCGCGAGCACATTGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAAtctct < 1:1417804/145‑1 (MQ=18) ggccggtgggcgggcGCCCGCACAATGGCACGTTCAACGCCCTGCTCCAGCATTCGAATAGCAATTTTAATGTCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAAtctct < 2:308132/137‑1 (MQ=21) tGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAAtctctc > 2:156566/1‑151 (MQ=255) 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aacgCCCTGCTCCAGAATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCa < 7:2257227/148‑1 (MQ=255) aGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAAt > 6:1990984/1‑151 (MQ=255) gctacagaattttcAAAGCATTTTTAATGTCTTGTTCATTCTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACg < 6:248787/138‑1 (MQ=25) gCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACg > 7:904676/1‑151 (MQ=255) cTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACgg > 6:1280003/1‑151 (MQ=255) aacAGCATGCTCAATGCAATTTTAATGCCTTGTTCAATCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACggg < 8:295555/149‑1 (MQ=25) ccAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGt > 5:686041/1‑151 (MQ=255) attgtcataGCTATTTTAATCTATGGTTCTTGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAAc < 5:166946/143‑1 (MQ=25) aTGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACTTGTGaaa > 6:109253/1‑150 (MQ=255) aTGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTGGATGCATAGCTTGGAGCCACGAAATTTGCTCTTCTTAGCTCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAAc < 3:1043920/151‑1 (MQ=255) tGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACg > 3:2006167/1‑151 (MQ=255) cgcAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACggg > 1:2081328/1‑151 (MQ=255) cAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACggg > 3:2046161/1‑149 (MQ=255) cAAAGCAATTTTAATGGCTTCTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACgg < 1:548684/148‑1 (MQ=255) gCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTAt > 7:1716417/1‑151 (MQ=255) 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4:2089528/146‑1 (MQ=255) cATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGAt < 2:1319152/150‑1 (MQ=255) cATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGAt < 5:630068/150‑1 (MQ=255) aTGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATATCTCCTTTTGTAGTGGTGAACCTTCGCCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATa > 8:216411/1‑150 (MQ=255) tGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCGATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAAt > 5:1800696/1‑151 (MQ=255) tGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAAt > 3:1425033/1‑151 (MQ=255) 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tACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATTaa > 5:2278792/1‑150 (MQ=255) | GCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATTAA > DH1/1519135‑1519431 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |