Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | DH1 | 936,293 | 0 | T | . | 29.0% | 346.9 / 154.1 | 144 | intergenic (‑27/+7) | ECDH1_RS04620/ECDH1_RS04625 | tRNA‑Met/tRNA‑Met |
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.34e-02 |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
TCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATT > DH1/936157‑936443 | gcgtgaaaattctttGGTGGCGGGGGCCGGATTTGACCGCACGCCCTTCGGGATATGAGCCCGACGAGCTACCAGTCTGCTCCACCCCCCGTCACCGTACTGC‑TTTTCTTGATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACcg < 3:367297/137‑1 (MQ=11) aCCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑ATTACTTCATCAAATTATAATTCGTTGAGGGGGCAGTATTTGAACAGACGACCTTCGGGTTATGAGCCAGACGACCTACCAgac > 8:135237/1‑149 (MQ=11) gacCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCAGCCAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCGACCAGCCTGCTcc > 3:718395/1‑151 (MQ=255) cccgaGCTACCATTCTTCTCCACCCCGCGGCACCGTCCTGA‑TTTCCATCAGGAAATTTAGTTTTGACGCGGGGTCTTGATATCAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑Tgcg 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catcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATc > 8:1458591/1‑151 (MQ=255) catcaAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGTA‑TTCGCAGAATACAACGATCGATAATTCGTTCAACCTTTTTTTTAACACGATcc > 3:995725/1‑150 (MQ=11) atcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATc > 8:1353309/1‑150 (MQ=255) atcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATc > 2:1104495/1‑150 (MQ=255) atcaAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCGGGA‑ATCGCACTATACTACAATCGAGTTTTCCTTCACCCTTGGTTTTAaccacctcac > 4:2129767/1‑144 (MQ=11) atcaAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGCGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCAGTA‑ATCGCAATCTACTCCACAATCTTTTTCATTCAACCGTAAATTTAACCCCATCAc > 4:1474735/1‑151 (MQ=2) caAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTGTTTTTTACCCCGATCACg > 2:477517/1‑151 (MQ=255) caAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACg > 2:1383841/1‑151 (MQ=255) atcttttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACg < 8:340830/147‑1 (MQ=255) aaaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 2:1680349/1‑151 (MQ=255) aaaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 1:1382021/1‑151 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 2:1299025/1‑150 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 6:409552/1‑150 (MQ=255) aTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAt > 1:1590302/1‑151 (MQ=255) ttttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAtt > 6:1318388/1‑151 (MQ=255) | TCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGA‑TGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATT > DH1/936157‑936443 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |