| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | DH1 | 2,238,049 | Δ3 bp :: repeat_region (+) +5 bp :: Δ1 bp | coding (157‑161/216 nt) | essQ → | Lysis protein S homolog from lambdoid prophage Qin |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | DH1 | 2238049 = | 2 (0.000) | 504 (1.040) | 235/300 | 0.0 | 99.6% | coding (157/216 nt) | essQ | Lysis protein S homolog from lambdoid prophage Qin |
| ? | DH1 | = 2410568 | NA (NA) | noncoding (1334/1335 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
| * | ? | DH1 | = 2238053 | 2 (0.000) | 502 (1.040) | 222/300 | 0.1 | 99.6% | coding (161/216 nt) | essQ | Lysis protein S homolog from lambdoid prophage Qin |
| ? | DH1 | 2409238 = | NA (NA) | noncoding (4/1335 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Only 100 of 504 total aligned reads displayed.
TCTTTGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < DH1/2238198‑2238049‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCT < DH1/2410568‑2410419 CTTTGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTG > 7:443526/1‑151 GTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATT < 3:189507/151‑1 GTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATT < 6:1293056/151‑1 GTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGAT < 5:1831900/150‑1 gCTGTAAGGCTACAGTTACCGTATCTTTATTCTCAAAATTTCGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTGTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCTGTGGTTTTG < 8:1079982/150‑1 CTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGC > 5:556837/1‑151 GTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGC < 6:458681/149‑1 TAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCC > 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7:1096803/150‑1 GCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGG < 3:710065/151‑1 CAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGA < 1:358382/151‑1 CAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGG > 4:393826/1‑150 AGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGAT > 4:1289547/1‑151 AGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTCTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATCCGGAT > 2:50062/1‑151 gaCTTACGCATGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATG < 8:1227386/149‑1 CTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCC > 1:1035348/1‑151 TTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCC > 5:867949/1‑150 aACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTAGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCA < 8:1313303/149‑1 TACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCA < 5:1207206/150‑1 CGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGAGAGAGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTC > 4:327063/1‑151 GTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTAT < 4:1867835/151‑1 TCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATA < 2:257146/148‑1 TTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCT > 5:1117024/1‑151 AATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGc > 5:78964/1‑150 CTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACG > 3:982360/1‑151 TGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCC > 2:1616481/1‑151 GAAATAACGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCT < 6:1709727/151‑1 AAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTC > 7:1585370/1‑151 AAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTC > 2:153657/1‑151 AATAAAGATTTGTCAGGCGAATTGCCCCTATATATCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCT < 4:736216/151‑1 ATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTG < 4:1704095/151‑1 AAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC < 7:1252835/150‑1 TTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTT < 5:943992/150‑1 GTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCT > 1:947305/1‑151 GTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCT < 8:77358/151‑1 TCTTTGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < DH1/2238198‑2238049‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCT < DH1/2410568‑2410419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |