| Predicted mutation | ||||||
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| JC | DH1 | 3,702,452 | (GTCATAACGACCGCCTAGGG)1→2 | coding (1442/2244 nt) | fhuA ← | ferrichrome‑iron receptor |
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Only 100 of 998 total aligned reads displayed.
CGAAGAAGGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCGG > DH1/3702283‑3702582 | gaagaaGGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGt > 5:1890138/1‑151 (MQ=255) aagaagGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTGTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTc > 6:390152/1‑151 (MQ=255) aagGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATa < 3:908136/151‑1 (MQ=255) 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gcccagtcataacgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCAtt > 8:676340‑M1/26‑151 (MQ=255) gcccagtcataacgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTGTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCAtt < 1:170941‑M1/126‑1 (MQ=255) ccagtcataacgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTg < 4:1300310‑M1/127‑1 (MQ=255) cagtcataacgaccgcctagggTTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGaa > 8:549110‑M1/23‑151 (MQ=255) aaGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttg < 5:551067‑M2/151‑111 (MQ=255) aaGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagttt > 5:1316890‑M2/1‑41 (MQ=255) gtcaaaaggagcgcgtagggGTCATAACGACCTCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCGCACTGCGCCTGATCCTGAAGATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTATGGGCCGGAGTTTGGCGGATCTTTGGCATTGAAGt > 2:1144224‑M1/21‑151 (MQ=255) gaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCg > 2:85873‑M1/13‑151 (MQ=255) accgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCgg < 7:1343934‑M1/140‑1 (MQ=255) ccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGt > 7:951336‑M1/11‑151 (MQ=255) cgcctagggGTCATAACGACCTCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTa > 4:1378556‑M1/10‑151 (MQ=255) gcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGAGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTAt < 8:474710‑M1/143‑1 (MQ=255) cctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTAtt > 7:233717‑M1/8‑151 (MQ=255) ctaggggTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCAAACTGCGCCTGATCCAGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATCCCCTAAGGGCCGGAGTTTTCGGCAGCTTAGGCAATGAAGTCGAAATCGGTAtt > 4:752875/7‑150 (MQ=255) gCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttgg > 4:1865349‑M2/1‑25 (MQ=255) cccAGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCAc < 1:904381/151‑1 (MQ=255) gTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCgg > 8:428277/1‑150 (MQ=255) | CGAAGAAGGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCGG > DH1/3702283‑3702582 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |