New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | 1355966 = | 186 (0.390) | 243 (0.520) +CTTC |
53/292 | 28.1 | 57.3% | noncoding (76/76 nt) | ECDH1_RS06685 | tRNA‑Val |
? | DH1 | = 3099542 | NA (NA) | noncoding (268/268 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 349 total aligned reads displayed.
CTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAT > DH1/3099392‑3099692 | caaACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCt > 1:126151/1‑151 (MQ=33) caaACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCt < 6:1038148/151‑1 (MQ=33) aatccTGGTGCTGGTTGGAATGTTTTAGTATAGGATATAGCAAAAATGCGCTTTTAGGTCGCTTTTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccata < 1:1373345/148‑4 (MQ=11) aaaCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCtt < 3:1840365/151‑1 (MQ=33) aaCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGGGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTg < 5:485290/151‑1 (MQ=21) aCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGc < 5:633268/151‑1 (MQ=35) aCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGc < 7:1036963/151‑1 (MQ=35) ccTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCg < 1:1101400/151‑1 (MQ=35) tgctgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGACCTAACGAcccaaaccggt > 6:1746450/1‑143 (MQ=9) gctgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCgg < 3:225155/149‑1 (MQ=37) gctgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCgg < 6:1708891/149‑1 (MQ=37) gctgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGGCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCggg < 8:1711583/150‑1 (MQ=38) tgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccatacgggtgtt > 5:722684/1‑140 (MQ=9) gcATGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGAtt < 1:1658041/150‑1 (MQ=255) gcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccataccggtgtt > 4:1700062/1‑139 (MQ=9) gcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccaaaccggtctt > 8:1842089/1‑139 (MQ=9) cAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTTAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGAATTAt > 8:412332/1‑151 (MQ=255) cAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTAt < 2:903113/151‑1 (MQ=40) 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aTCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCtt > 2:241438/1‑150 (MQ=255) ttGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAAt < 3:1758939/149‑1 (MQ=255) tGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGGCCAATTGATTAAAAGAAAACTGCTCTACCAACTGAGCAAACGACACCCTGCGGGATAATGATACCTAAATCAt > 8:574848/1‑151 (MQ=14) tGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCa < 3:1004015/150‑1 (MQ=255) tGAGTATCCCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCa < 1:860977/150‑1 (MQ=255) 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gCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTTGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGAtg < 8:1583478/151‑1 (MQ=255) gCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTc < 5:1504772/151‑1 (MQ=255) aaaaaaGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGTTTAGGCTGACTTAATCATTCAGGAGCGAGGGTCGt > 5:1644250/1‑151 (MQ=17) aaaaaaGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGt < 1:544319/151‑1 (MQ=255) aaaaaaGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTCCGAACAAATTATTAAAAGTAAACAGATATAACAAAAGAGATAAAGACCCATTGCGGCATAAAAATAAAAAAAACATTCAGGATGGTGGGTCGt > 4:1805267/1‑151 (MQ=2) aaaaaGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTg < 8:773751/151‑1 (MQ=255) aaaaGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTACAACCTTCGAACAATAGATTAAAAGTAAAATGCTATACCAACTGAGCTAACGACACCTTTAGGGATTATGGTGAATAAATAATTCaccatagaatgtatat > 2:602422/1‑135 (MQ=2) aaGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAg < 8:1069913/151‑1 (MQ=255) aaGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAg < 4:670446/151‑1 (MQ=255) agggttattttttACTTTGGTGGTTCGTGCAGTATTCTATCCTGTGACCAATTGATTAAATGTCAACACCTCTACCATCTGAGCTAACGACCCCTTGATGGATTATGCTCCCTTAATCATTCAGTTTGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑Cg < 4:241003/143‑1 (MQ=21) aGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACAGCTCTACCAACTGACCTAAACACCACAAGGGGGATTAAGCTGGCTAAATCATAGAGGAAGGTGGGACGTCCAGGATGAAT‑Cg > 3:302206/1‑150 (MQ=14) aGGGCGCGTTTTAACATTCGTGGGGAGCGCAGGATTCGAACCGGGTTCGAATTGATTTAACGTCAACTGATCTAACAACTGCCCTAAGGACCACTTTATGGACTATGCTTCGTCTATCATTCAGTATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGa < 5:1232624/151‑1 (MQ=255) cgcTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTc < 7:435471/151‑1 (MQ=255) cgcTTTTTTACATGGGGGGCTCGCGCAGCATTCGAACCTTATAGCAAATGATTACAAGTCATACGCTCTCGCCTATTTGCTAAGGACGCCATCCGGGATCACTCCGGATCTATTATTCAGCTTGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTc < 3:1637662/151‑1 (MQ=255) gcTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAACAATTGATTAAAAGTCAACTGATCTAAAAAATGAGCTAACGACCCATTGCGGGATTATGCTGCATTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCg > 2:820914/1‑151 (MQ=21) 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ctACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGTGTCGTGCAGGATTACT‑CGCATTCGTCTCACACTTCGCGCACTAGCTAACGCAACGTTATGCATCACGGTCACAAGCAGAAAAAACCttg > 8:1342148/1‑149 (MQ=255) ctACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGGTGTCTA‑CATGAAACACCTTTa > 1:271705/1‑150 (MQ=25) ctACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑AGACTAAGTCTCGCACTTCGGCCAGTAGCTAACGCAACTTTATCCTTCACGTTAAATAACAGTaaaaaacata > 2:1653391/1‑142 (MQ=25) tACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATCTAACAGTATCCAACtata > 1:408389/1‑150 (MQ=255) aCCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTaaa < 1:826158/151‑1 (MQ=255) aCCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTa < 7:386515/149‑1 (MQ=255) gAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggtg < 2:152868/150‑1 (MQ=255) gAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggt < 7:1139568/149‑1 (MQ=255) aGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTggg < 8:674911/151‑1 (MQ=255) gCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGCCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTATACCAGTAAGCACGTTTAAATTggggggg > 3:648086/1‑150 (MQ=255) gCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGt > 5:574294/1‑151 (MQ=255) cTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGGTATATAAGAGTAACACCCGTTAAAtgtgagggac > 5:1092328/1‑142 (MQ=21) aaCGACGCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTc < 8:179843/149‑1 (MQ=255) aaCGACCCGTTGAGGGAATATGCTTCCTTAATCATTCAGTATGTTGGGTCGTGCTGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGt < 4:346879/151‑1 (MQ=25) aaCGACCCCTTGCGGTATTATGCTGCCTTTATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCg < 6:1181516/150‑1 (MQ=255) aaCGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTc < 6:830040/149‑1 (MQ=255) aaCGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTc < 3:728915/149‑1 (MQ=255) aaCGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTc < 1:1837749/149‑1 (MQ=255) aaCGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCg < 3:765192/150‑1 (MQ=255) cGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAGCGCAGCGTAAACCTTCACGTAAGCACCCACTAACAACGGTTAAATTGGTGGGTCGTgg > 5:1413065/1‑150 (MQ=21) gACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGc > 2:329129/1‑150 (MQ=255) ccTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATCTACCAGTAACCAACTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAggct > 7:160572/1‑149 (MQ=255) | CTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACT‑CGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAT > DH1/3099392‑3099692 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |