| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 3099328 | 385 (0.800) | 60 (0.140) | 33/260 | 33.7 | 17.7% | noncoding (54/268 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 3099693 = | 223 (0.530) | noncoding (58/76 nt) | ECDH1_RS15360 | tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
CTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099543‑3099842 | cTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt > 3:720889/1‑151 (MQ=255) ttGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTc > 2:229904/1‑151 (MQ=255) ttGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATAACAGTAACCACATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAATc > 7:855855/1‑151 (MQ=255) tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt < 5:675281/149‑1 (MQ=255) tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCCACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt < 1:259940/149‑1 (MQ=255) cGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACAACCTTTAAAATGGTGAGTCGTGCAGGATTCGa > 4:310521/1‑150 (MQ=255) cGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCCTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTATAGCAGTAAGAACATTTAAATTGGTGCGACGTGCAGGCTTcaa > 3:1280370/1‑148 (MQ=21) cGGGATTATGCTCCCTTAATCATGGAGGCTGGGGGGTGGTGCAGGAGGACTATAGTTCGGCTCGCCCTTGGTGCATTTGCTAACGCAACGTTATCCTTAACTTTCTCTACCAGTAAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGaa < 6:1748011/151‑1 (MQ=25) aTTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTg < 7:1820857/151‑1 (MQ=255) aTTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTAAATAGCAGTAAAAACGTTTAAATTAGTGGGTAGTCCACCATGCGAACATg > 7:1732375/1‑151 (MQ=18) ttATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTAACAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGc > 5:235045/1‑151 (MQ=255) ttATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCACTTCGCGCCGTTGCTAACGCAAAGTTATCCTTCACGTTAAATAACAGTAACAACATTTAAAATCGTGGGTCATGCAGGATTAGaaaa > 4:463685/1‑146 (MQ=21) tATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATACTTCACGTTCTATAACAGTAAACACATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACCTGcc > 6:1295367/1‑150 (MQ=25) tgctgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATAGCAGTAAGATCTTTTAAATTCGTGTGTCCTGAAGGCTTAGAACCTGAGAc > 7:1100123/1‑151 (MQ=18) gctgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTACGTCTCGCCCTTCGGGCAGTTGCTAACGCAACGTTATACTTCACCTTCTCTACCAGTAGACAACTTAAAATTTGTGGGTAGTTGAGGATAACACCCTGCGAcc > 8:1614964/1‑151 (MQ=18) ctgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATACTTCAACTTCTATAACAGAAAACACCTTTAAAATGGTGGGTAGTGCAGGATTAGAAACATCGAcc > 8:400011/1‑150 (MQ=21) ggcCTTAATCATTCCGCATGGGGGGGCGTGCAGGAGGACTCGACTTCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTCACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCaa < 1:375800/150‑1 (MQ=21) gcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTAAGAACCAGAAACCAGCGTTAAATTAGAGGGTCTTGAAAGATTAGAAGCTCCGACCAAt > 4:1518557/1‑151 (MQ=18) gcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCAAGTTGTCTACCACTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTAGTGCAGGATTAGAACCTggtagcaat > 7:1670604/1‑143 (MQ=21) gcCTAAATCAGTCAGGAGGGTGGGGCGTGCAGGATGACGCGACTCCCTCTCTGCGTTATGTCCGTTCCTAACGCAACGTTATCCTTCTCTTTGTATTCCAGTTAACACCTTTTATTTTGTGATTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCa < 7:547501/149‑1 (MQ=12) ccTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCgccaaagg > 5:1796576/1‑144 (MQ=255) ttAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTAAACTTCACGTTAAAAAGCAGTAAAAAAATTTAAATTGGTGGATCGTGCAAGATTCGATGCTGGGAAAAATTg > 2:619100/1‑150 (MQ=17) tAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAGTTCGTATCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTCCCAGTAACCCCCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGCTTCGCGCCTGCGccctcgtgat > 5:462537/1‑144 (MQ=21) tAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAt > 7:1032871/1‑151 (MQ=255) tAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGCCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATAGAGCAGAAATAACTGTTAAATGGGGGGGTCGTGCAAGATACGCACAGGCCACCACttta > 1:1453631/1‑148 (MQ=12) aaTCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAtt < 3:169705/151‑1 (MQ=255) aaTCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCCACCAATTGAtt > 3:853410/1‑151 (MQ=255) attgagcttcgtggGTCGTGCAGGACGACTCCACTTCCTCTCGCCCTGCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATACTTCACCTTCTCTACCAGTAACCACCTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTaaaa < 1:1816753/141‑1 (MQ=18) atgcagcctgggggGTCGTGCAGGATCACCCGACATCCTCTCGCCCAGCGGGCCGTCGCTCACGCAACGTTATCCTTCACCTTCTCTACCAGTACCCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTaaaa < 7:314091/143‑1 (MQ=17) cAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGt > 8:129831/1‑150 (MQ=255) aGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAGTTCGTCTCGCCCTTCGGGCAGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTAACAGTAACCACCTATAAAGAGGTGGGTCGTGCAGGATTCGACGATTCGAGCAAATTAATAAAAGTcc > 3:1516010/1‑150 (MQ=18) aGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTc > 8:1182417/1‑150 (MQ=255) ggATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTAACAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAAGTGATTAAAAGACa > 5:270964/1‑150 (MQ=255) gctggtggGTCTTTGATTATGACTCGAGTGCGACTCGCCCTTCTCGGCTTTGCTTACGGAACTGGATGCTTCATGGTATCTTCTAGTACGCAGCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAAc < 5:1815225/149‑1 (MQ=9) gATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCACTACCAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATGCGAACATGAGACCAATTGATTAAAAGTCAAc > 5:579547/1‑151 (MQ=255) gATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATCTAACAGTAACAACATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACCTGCGAACAAATTATTAAAAGTaaa > 4:219668/1‑150 (MQ=18) cGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTAccc > 3:1820960/1‑150 (MQ=255) gTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAAGCTGCGAACAATTGATTTAAAGTCCACTGCTCTACCa > 3:1273626/1‑150 (MQ=255) tGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAAATGGTGGGTCGTGAAGGAGTCGAACCTGCGCCCAATTGATTTAAAGTAAAATGCTCTACGAAc > 7:1211696/1‑151 (MQ=18) gATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGc > 7:1330280/1‑151 (MQ=255) aCTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTTACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGGATGATTAGGAACTGCGCCCAATTGATTAAAAGTCAAATGCTGGACCCACGGAgaaaac > 7:349346/1‑146 (MQ=18) cTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTGTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATGGATTAAAAGTCAACAGCTCTACCCAATGAGCTatgg > 1:1128541/1‑148 (MQ=18) gACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGACCCTGCGACCAATTGATTAACAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTACCGAcc > 3:329615/1‑151 (MQ=255) 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cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACAAACTGAGCTAACGAcccctgaggttg > 2:713515/1‑142 (MQ=255) cGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTAAATAACAGAAAAAGAATATAAATTAGTGGCTCGTTCATGATTAAAACGTTGTACAATTTTATTTAAAGTCAAGTTCGCAAGAAAATTAGATAAAGACCCATACGGgtg > 2:1162734/1‑151 (MQ=255) gCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTATACCAGTAACCCCCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGCACCTGCGCCCAATTTATTAAAAGTCAACTGCTCTACGAACTGCCCAACCGACCCCTACGGgtgg > 3:889469/1‑150 (MQ=18) tCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAACTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccgaagggggggtgaat > 2:566489/1‑136 (MQ=18) gggCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAc > 3:675951/1‑132 (MQ=255) gggCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCaacagataggaagatc > 4:1183459/1‑135 (MQ=255) ggCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGaa < 2:1468949/151‑1 (MQ=255) gCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTGAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTgga > 5:377697/1‑148 (MQ=255) ctttGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTa < 4:1054367/121‑1 (MQ=255) cGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTGATTAAAAGTCAAATGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGaa > 7:464815/1‑148 (MQ=255) 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cGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGc < 6:222235/151‑1 (MQ=255) aTCCTTCCCGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTg < 5:1135920/88‑1 (MQ=255) aTCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTg > 6:1135177/1‑88 (MQ=255) aTCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACCTAAGAGCAAATTATTAAAAGACAAATTAAATAAAAAATGAGATAACGAACCAAACCGTTTTTAAATTAAAAAATTTTACTCGGGGCCAAt > 8:832633/1‑151 (MQ=255) tCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATAGATTAAAACTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAAAAAAAACGGTGTTACCTCAAAAATTAAAACTCCGCGCCAATc > 8:609030/1‑151 (MQ=18) tCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGACCCTGCGACCAATTTATTAAAAGTCAAATGCTCTACCAACTGCGCTAACGACCAATAAGGCTCTTACCTTAAATATTTTTACTCGGGGACAATc > 6:730140/1‑151 (MQ=255) tCACGTTCTCTACCAGTACCCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCtt < 1:1537268/149‑1 (MQ=255) cACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTaa < 5:974738/151‑1 (MQ=255) cACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTa < 4:685884/150‑1 (MQ=255) aCGTTATCTACCACTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTAcc < 3:60038/88‑1 (MQ=255) cGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAACAATTGATTAAAAGTAAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCAATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTa > 4:1761632/1‑148 (MQ=255) tctcTACCAGTTAGCTCCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGAtt < 5:220259/150‑1 (MQ=255) ctctACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCAAAACTGAGCCCAATAGATTAAAAGTAAACTGCTCAACAAACTGATCTAACCACACATACGCGTGTTAAATTAAAAATTTTTACTCGGGGCCAATGTTTAAGGTtgg > 6:65826/1‑151 (MQ=21) aCCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATtggtg < 5:1301184/149‑1 (MQ=255) aCCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATtggtg < 1:1480229/149‑1 (MQ=255) agttagcttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTc < 6:874597/140‑1 (MQ=255) aggccgcttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCg < 1:504671/141‑1 (MQ=255) tAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGACCCTGCGACCAATTGATTAAATCTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGt < 5:1347622/150‑1 (MQ=255) tAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAGCAATTGATTAAAAGTAAAATGCTCTACCAACTGAGATAACGAAACATACGGGTGTTACCTGAAAAATTTTTACTCGGGGCCAATATTTAAGATTGGTTGGTCGtt > 2:928424/1‑150 (MQ=25) ttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGGTTTAAGGTTAAGAATTATTCTAGGGGCCATTCTAGAAGAttgttgctacagtcaggat > 2:1666226/2‑137 (MQ=2) cTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGctct < 1:1336190/64‑1 (MQ=35) tttACATTGGTGGGTCTTTCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTAGCAACTGAGCTAACGACCCATACGGTTGTTAACTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTTAGATTGGTGGGTCGTGCAGGAt < 7:1909056/149‑1 (MQ=21) tttACATTGGTGGGTCGTGCATGATTCGAAACAGCGAGCAATTGATTAAAAGGGAACAGCGCTACCCACTGACCTAACGCCCCATACGGGTGTTAACTGAAACATTTTTACTCGCGGCCTATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGAt < 1:1766066/149‑1 (MQ=21) ttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAAATGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTTTTAACAGAAAGATTTTTAATCGGGGCCACTCTGTTGGATTGTTGCGTCggggagagaagg > 8:1760888/1‑140 (MQ=17) ttAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAt < 1:1157243/45‑1 (MQ=35) tAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGACAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGAc < 1:908612/150‑1 (MQ=255) aaTTGGTGGGTCTTTCATTATTCGAACCTGCTACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCTGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcg < 2:1489305/151‑1 (MQ=25) aaTTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAAGTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTAGTCGGGGCCATTCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcg > 5:1564922/1‑151 (MQ=255) gtcttctgatgtaGGATTCGAACCTGCGACCAATTTATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgctt < 6:1596873/138‑1 (MQ=255) ggtggtctctgccgATGCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgcttcg < 5:1699729/138‑1 (MQ=255) tggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACt < 6:1798079/102‑1 (MQ=255) ggTCGTGCAGTATTCGATCCTGCGACCTATTGATTTTATTTCATCTTCTGTAACAACTTAGCTAACGACTCATACTTTTTTTATTTGAAATATTTTTACTCTTGGGAAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTtcgctc < 2:1378729/151‑1 (MQ=255) gTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACCGGTGTTAGCTGAAAGATATATAATAGGGTCGAGTCTGTAGGATTCTTCCTCCCTGCAGTATCACTCGCTtcgctctacc > 7:246803/1‑147 (MQ=9) gTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAGTTAAGGTCAACTGGGGTAACTCCTGAGATAAAGCGCGATACGGGTGTTAGAGGAATGATTTTTAATAGGGGCCAGTGTTTAAGCTTGGTGGGTCGTGCCGGCTGCCTCGCGTCGCTCGccg > 5:126904/1‑150 (MQ=255) tGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACAGGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAACATTGGTGGGTCGTGCACGATGACTCGCTTCGCTCGACCt > 5:1754148/1‑151 (MQ=255) gctaGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCt < 8:738510/148‑1 (MQ=255) | CTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099543‑3099842 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |