| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | DH1 | 3,906,837 | 0 | C | G | 26.1% | 140.1 / 18.4 | 92 | intergenic (+8/‑27) | ECDH1_RS19315/ECDH1_RS19320 | tRNA‑Leu/tRNA‑Leu |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/21); new base G (22/1); total (70/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.93e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTGATTT > DH1/3906694‑3906987 | cAAGTCACCCCCCTCGCTCCAAAAACCACGTTGATATTGGTCGCTCTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCa < 3:1562749/151‑1 (MQ=255)actatcagcctccTCGCTGCAAGAAACTCGTTGTTATAGTTGACTCTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCa < 1:1140156/140‑1 (MQ=11) cacgacccccccTCGCACCAAACACCACGTTTATATTGCTCCCTCTCGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCaa < 8:244004/146‑1 (MQ=18) attgccccccccTCGCACCTAACACCTCGTTGATATTGCTCGCCCTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCaa < 2:320961/147‑1 (MQ=18) ccccccccTCGCACCAAAAACCTCGTTTATAGTCCTCCCAGTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCaaaaaa < 7:1692084/151‑1 (MQ=21) ccccccTCGCACCAACCACATCGTTTAAATTGCTCTCTGTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTGCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAg < 5:35954/151‑1 (MQ=18) cccccTCGCACGTAAAAACACGTTTATATTGCTCGCTCTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGt < 1:3969/151‑1 (MQ=18) ccccTCGCACCAACAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTa < 5:533060/151‑1 (MQ=255) cccTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCTATATCAAAAAAAGttt > 5:520145/1‑149 (MQ=255) ccTCGCAGGAATAACGTCTTTGTTATTGCTCCGCCTCTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAg < 3:233273/151‑1 (MQ=17) ccTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAGTCGGTAATTCAAAAAAAGtttg > 7:896734/1‑148 (MQ=18) cTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCCCACCAAAAAAATTGAAATCAAAAAAAGTatc > 8:516863/1‑148 (MQ=18) cGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTACCCCCCCTCGCACCAAAAAACTAGAAATCAAAAAAAGtttgatc > 7:1545752/1‑145 (MQ=18) gCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAATACGAGAATTCAAAAAAAGtttgttc > 8:205802/1‑144 (MQ=18) gCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAAAGGGGATTTCAAAAAATGtttgttg > 8:1580972/1‑144 (MQ=18) gCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTACTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCAAGCACCAAACAACGCGATATAAAAAAAAAAAAGaaa > 8:1246558/1‑148 (MQ=18) aCCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGTGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTCTTAGTGTACTTACGGACGAGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAATACGGGATATGAAATAAAGtttcttcagt > 1:1184717/1‑142 (MQ=17) cAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAATATGTCGATATCcaaaaaataaacactacagt > 3:1036913/1‑138 (MQ=18) aaaaaaGACGTTTATATTGTTCCCTCTCTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACtgtg < 7:1365919/151‑1 (MQ=18) aaaaaCCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGGAGGCGAAATCAAATAAAGttacttgagtgtt > 3:1799495/1‑139 (MQ=18) aaaCCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAGGAGGGGATATCAATTAATGTTAGTTGCCtgttgt > 7:283174/1‑148 (MQ=18) aaaCCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAGAGGGTAGATCAAAAAAAGTatcatccgtgtgat > 4:441657/1‑138 (MQ=18) aCGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCCCCAAACTAGGGGTGATCAAAAAAAGTTTGATGCCTGTGGGTAGGt > 3:403474/1‑151 (MQ=18) aCGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCCCGCCCCCAAAGAGGCGATATGAAAAAAAGTTAGATGACtgttggtaggt > 7:1379287/1‑143 (MQ=18) ggTTGATATTGCTCGCTCTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTg < 7:761250/150‑1 (MQ=255) tatagttctcgtccTGGGCGAATGTGGCGGAATTGGTAGTCGAGCTAGCTTCAGGGGTTATTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTAAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCTATATC‑AAAAAAGTAAGATGAGTGTGCGAAGGTGGCgg < 3:628482/137‑1 (MQ=18) gATATTGCTCGCTCTTGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCg < 7:763555/150‑1 (MQ=255) gATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAAAGGATAATTCAAAAAATGTAACATGAAtgatttttcatgcctg > 4:930648/1‑137 (MQ=14) tatttctctttgtttgCGAAGGTGTCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCACTCGCACCAAACGAGTCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGa < 4:264454/135‑1 (MQ=18) atTCCTCGATCTAGGCGACGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCGTCAGGTGGTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTGCAAGTCCCCCCCCTCGCACCACCCGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGCTGACTGTGCGAAGGTGGCGGAAt < 3:910187/151‑1 (MQ=18) gctgcgggggggCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTACTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTg < 5:1100961/141‑1 (MQ=255) gctgcacgtgtgCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTTCTGTAATTACGGACGTCCCGGTTCAACCCCCCCCCCTCGCACCAACCGAGCCGATATCATATAAAGTAATATGACTCTGCGAAGGTGGCGGAATTg < 1:1133084/139‑1 (MQ=17) caagttagCGAAGTGGTCGTAATTGGTACACGCGCTACCGGCAGGTGGTATTTTTCGTACGGACGATGCGGTTCAAGGCCCCCCCCTCGCACCACCCGAGTCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGa < 3:873446/144‑1 (MQ=19) aCTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACTAGGGGAATTCAAATATAGTTAGATCCCTGTGGGTTGGTGGCGGATTTGCTTGAcg > 1:969114/1‑151 (MQ=14) gCGAAGGTGGCGGTTTTGTTAGAAGCTGTAGCTTCAGGTGGATGTGGTGTTATGTCACTGGTGTTGCGAGTCGCGCCCCTCGGACCTATCGTTCGGATTTCTTATAAAGTATTCTGTGTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTa < 7:433952/151‑1 (MQ=255) gAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCCCCAAATGAGGGGAGTTCCTAAAATGTTTGATGCGTGTTTTTTGGTGGCGGAATTGGTataagttgtatc > 3:870964/1‑140 (MQ=2) aGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGGTATATCAAAAATAGTTAGTTGCCTGTGGGTTGGTGGCGGAATAggattcagttttagcat > 5:684742/1‑136 (MQ=17) ggAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGGGATTTCCAAAAATGTTAGATGAATGAGGGTTGGTGGCGGAATTGGTTGACGAGGTAGCTTCAGgtgg > 7:451452/1‑150 (MQ=18) aatgtcgctCTAGCTTCTGCTGTTCCTCTTCTTACGGACTTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAACCGACCCGATATCAAACATAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTc < 1:1410628/146‑1 (MQ=25) aGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAGAGGGGAAATCAAAAAAAGTTAGATGAATGTTGTTTGGTGCCGGAATTGTAATAAGGGTTATCATCAGGTTTTAgtgaaa > 7:667149/1‑147 (MQ=9) cgcTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAACTCCCCCCCCTCGCCCAAAACCACGCGATATAAAAAAAAATTATATTAAGGTGTTAAGCTGGCGGAATTCTTATACGGGGATGAATCAGGTTTTAgtgtaaaaaagg > 7:1351866/1‑143 (MQ=9) cTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCACGCACCAAAAGACGCGAAATCAAAAAAAGTAAGATGCCTGTTGGAAGGTGGCGGAATTTGTAGAAGAGGAAGCTTCAGGTGTTAGTGTACtataggcc > 2:615905/1‑144 (MQ=21) gCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCCCCAAAAGAGGGGAAATCAAAAAAAGTAAGATGCCTGTGGGATGGTGCCGGAATGGCTTTACGCGGTAGCTGCAGGTTTTAGTGTCATTAT‑GGCCggg > 7:540218/1‑149 (MQ=18) ttCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAACAGGGGAAATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGGGAAGGTGGCGGAATTGTTATAAGCGCGAGCGGCATGTGTGAGTGTACTTAC‑GGACGTggg > 7:1110307/1‑151 (MQ=21) cAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTggggg > 3:626762/1‑151 (MQ=255) tgtTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGGGATATCAAAAAAAGTTAGATGACTGTTCGATGGTGGCGGAATGGGTAGCAGGGGTAGCTTCATGTGTTACTGTACATAC‑GGCCGTGGGGGttg > 5:248733/1‑149 (MQ=25) tgtTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAATGTATGATGACTGTGGGTAGGTGGCGGAATTGGTTTCCGGGGTAGCTTCAGGTTGTAGTGTAGTTAG‑GGCCGTGGGGGttgc > 5:1520408/1‑149 (MQ=21) ttAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAGAGGGTATATCAAAAAAAGTTTCATGAATGTGGTTAGGTGGCGGAATTGGTAGCAGAGGGAGCATCAGGTGTTAGGGTCATAAC‑GGCCGTGCGGCttga > 1:1753637/1‑147 (MQ=12) ttAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAGAGGCGATATCAAAAAAAGTATGATGCCTGTTTGTAGGTGGCGGAATTGGTTTACGGGGTATCTTCAGGTGTTAGTGTACTTAC‑GGACGTGGGGGttgt > 7:1309278/1‑147 (MQ=25) ttAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGT‑CCCCCCCTCGCCCCCAAAGATGGTATATGAAAAAAAGTAATATTACTTTTGTTATGTGGCGGAATTGGAATACGCTCTATCTACAGGTGTTACTGTAATTAC‑GGACCTGCCCGTTCAAGt > 3:40632/1‑151 (MQ=255) cctgtCCTTACGGACGTGGGGGGTCAAGTCCTTTTTTTATTTCTAATCGACGCGATATCATATAAAGTAAGATTACTCTTCTTTGGTTTCTGTACTGTTATACGATCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTc < 8:849892/149‑1 (MQ=2) tgtTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCCCCAAAAGAGGGGATTTAAAATAAAGTAAAATGACTGTTATTAGGTGCCGGAATTGATATACTAAAAATCTTCAGGTATTAATGAAATTAA‑GGCCGTGGGGGtggaaggaa > 8:1639372/1‑142 (MQ=9) tgtTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAGAGGCGATATCAAAAAAAGTTAGATGACTGTGGGTAGGTGGCGGAATTGGTATACGCGCGAGCTTCAGGTGGTACTGTACTTAA‑GGAAGTGGGGGTTCAAGtac > 5:921424/1‑148 (MQ=25) 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gTCCCCCCCCTCGCACCAAAGGAGGGGAGATCATAAAAAGTATGATGAATGTGAGAAGGTGGCTGATTTGCTATACGAGATAGCTTCAGGAGGTAGTCTAATTAA‑GGACGTCGGGGTTCAAGGCACAACCCTGGCCCCAACTTTCTTTaat > 6:1299129/1‑149 (MQ=255) ccccccccTCGCACCAAACGAGGGGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCGTTAC‑GGACGTGGGGGTTGAAGGCCCCCCGCGGGCCCCGAGTATGTTttcttc > 4:995234/1‑151 (MQ=18) ccccccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTGGCCCCAATTATGTGttcttc > 1:1742167/1‑151 (MQ=255) cccccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTTTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGGCACCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTcc > 5:1557098/1‑151 (MQ=255) cccccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGGTCAAGTGCCCCCCCTCGCACCCATTATCTTTACTTcc > 5:1235150/1‑151 (MQ=255) cccccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GCACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGGACCAATTATCTTTACTTcc > 3:864130/1‑151 (MQ=255) cccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTccgt > 8:273277/1‑149 (MQ=255) cccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGGCCCCCCCCGCGCCCCAATTATCTTTTCTTGCtt > 5:1665809/1‑151 (MQ=255) ccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCttt > 8:1101629/1‑151 (MQ=255) ccccTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGGTCAAGTCCCCCCCCGCGCACCAATTATGTTTACTTCCtgt > 7:449952/1‑149 (MQ=255) 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aaaCGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTttcttc > 2:1640815/1‑151 (MQ=255) cGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCtt > 1:1445289/1‑151 (MQ=255) gAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTGACGGCCCCCCCCGCGCCCCAATTATCTTTACTTCCGTTCTTGGTTCTTCCTTg > 1:469488/1‑151 (MQ=21) gAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTGCCCCCCCGCGCCCCAATTATGTTTACTTACTTTCTTGTTTCTTCCttt > 5:700682/1‑150 (MQ=255) gAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCttt > 2:456401/1‑150 (MQ=255) gAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCACGCACCAATTATCTTTACTTCCTTAGTTGGTTCTTCCTTg > 1:496790/1‑151 (MQ=255) aGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTAATTACTTTCTTGTTTGTTCCTTg > 6:92348/1‑150 (MQ=255) aGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTAATTACTTTCTTGTTTATTCCTTg > 2:505534/1‑150 (MQ=255) ggCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCCACTGGCCCCCCTCGCCCCAATTATCTGTAGTTCCGTTCTTGTTTGTTCCTTGAt > 5:372214/1‑151 (MQ=21) cGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTGCCCCCCCGCGCCCCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTGAttt > 5:1671783/1‑151 (MQ=255) cGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCCATTATCTTTAATTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTGAttt > 2:1782153/1‑151 (MQ=255) cGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCACGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTTGTTGTTCCTTGAttt > 6:331865/1‑151 (MQ=255) | CAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTAC‑GGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCTTGATTT > DH1/3906694‑3906987 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |