Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | DH1 | 839,095 | Δ1 bp | coding (1001/1434 nt) | bglA ← | 6‑phospho‑beta‑glucosidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | DH1 | 839,094 | 0 | T | . | 98.8% | 2217.2 / 18.5 | 488 | coding (1002/1434 nt) | bglA | 6‑phospho‑beta‑glucosidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/2); new base . (227/253); total (232/256) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.70e-01 |
Only 100 of 504 total aligned reads displayed.
CACTTTGTCGTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCCTTCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGATGTTAAATCCGCGACGCTC > DH1/838944‑839240 | cACTTTGTCGTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCCt > 2:111112/1‑151 (MQ=255) acctgggcGTAAGCGCCAAAACCGGCTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCACAGGGCATCGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCCGTCAGACGCTTTAACATACGGGGGTGGTACGCCGCCtc < 2:725773/144‑2 (MQ=255) aCTTTGTCGTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCCtc < 4:1369073/151‑2 (MQ=255) tttGTCGTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCCtca > 6:1053886/1‑148 (MQ=255) tttGTCGTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCCtca > 2:1411167/1‑148 (MQ=255) ttGTCGTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCAAAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCCtca < 3:760014/149‑3 (MQ=255) tGTCGTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCCGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCCtcaaa > 3:1877383/1‑146 (MQ=255) gTCGTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCaaaa < 1:738362/150‑1 (MQ=255) cGTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCa < 7:1249775/151‑1 (MQ=255) cGTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCa < 7:355616/151‑1 (MQ=255) cGTAAGCGCCAAAACCGTTATCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCa < 1:1674850/151‑1 (MQ=255) gTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCag < 8:1687453/151‑1 (MQ=255) aaccgcCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGCCCACTCAAAACGCTCATACAGTTCCCAAACTTCATAACGAAGACCTACTCGATCAATATCCCACCCCCACACACATGCTATAACATAAGCCTAAGGAACCCT‑CCCTCAAAACCaga > 6:381314/4‑150 (MQ=255) aGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCag > 2:572327/1‑148 (MQ=255) gcgcCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCag > 6:698846/1‑147 (MQ=255) cAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGatcgca < 4:841880/151‑1 (MQ=255) cAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGatcgca < 7:1204983/151‑1 (MQ=255) aaCCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGatcacatcg > 3:1205909/1‑151 (MQ=255) ccGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGcc > 5:855746/1‑151 (MQ=255) cGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCg < 3:130537/151‑1 (MQ=255) gTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCgg > 8:55920/1‑151 (MQ=255) tttCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTg > 7:1670742/1‑151 (MQ=255) ttCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTg < 4:249342/150‑1 (MQ=255) cGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTgccg < 8:1420240/151‑1 (MQ=255) cGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTgccg < 5:1764202/151‑1 (MQ=255) aaaCAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCg < 7:1357728/150‑1 (MQ=255) aaCAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGc < 5:956136/151‑1 (MQ=255) aGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACCCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCtt > 6:1932477/1‑151 (MQ=255) ctctGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGc > 6:1987421/1‑151 (MQ=255) gATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCa < 6:1348527/148‑1 (MQ=255) aTAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTgg > 6:625315/1‑151 (MQ=255) aaCGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTc < 6:1228022/151‑1 (MQ=255) aaCGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTc < 6:871843/151‑1 (MQ=255) aaCGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTCGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGt < 3:1748662/150‑1 (MQ=255) gCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATCGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATg < 4:1843949/151‑1 (MQ=255) gCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATg < 1:272697/151‑1 (MQ=255) gCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATg < 2:128887/151‑1 (MQ=255) cTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGt > 8:1849906/1‑151 (MQ=255) cATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTa > 2:258124/1‑150 (MQ=255) aTACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAAt < 7:1810057/151‑1 (MQ=255) aTACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTGTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAAt > 3:1001610/1‑151 (MQ=255) aCAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCCTTCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAAt > 6:7951/1‑150 (MQ=255) aGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCt < 2:610963/151‑1 (MQ=255) 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gCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTAAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAAc < 8:748253/151‑1 (MQ=255) cAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGCTCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGACAcc > 3:1808803/1‑151 (MQ=255) aacctGCATAGCGCAGACCAACTGGACCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTGTGGTACGCGGCC‑TCAAACCCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCa < 4:1683164/147‑1 (MQ=255) aaaGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAAcc > 1:1432567/1‑150 (MQ=255) aaGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCa > 3:1401010/1‑150 (MQ=255) aGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAg < 7:1585939/151‑1 (MQ=255) gTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGa < 7:1887771/151‑1 (MQ=255) gTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGa < 5:489473/151‑1 (MQ=255) gCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCTGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCTTCGCCGGTGCCGCCTTGGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGAt < 1:1754046/150‑1 (MQ=255) aGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATc < 6:259869/150‑1 (MQ=255) 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gCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATc < 8:429112/150‑1 (MQ=255) ccAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCa < 8:1343769/151‑1 (MQ=255) ccAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCa < 2:1935292/151‑1 (MQ=255) aGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATcc > 1:405028/1‑148 (MQ=255) cccctctgagttgatttAACATACGCGTTTGTTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCAGCGCGGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAAGCAAGATAATCGGAGGTGGCTTCACGCAGGTCATCCAGATc < 8:1506939/137‑1 (MQ=255) ccccAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTGCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATc < 7:490707/151‑1 (MQ=255) ccAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGc > 7:1020694/1‑151 (MQ=255) aGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCg > 6:1148974/1‑151 (MQ=255) gCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCAt < 5:697919/151‑1 (MQ=255) ttATCATACTGTTTTGGTACGCTGCC‑TCAAACCGAGAGATCTCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCAGTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATGGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCAttt < 5:381629/150‑1 (MQ=255) ttAACATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCAttt < 7:253707/150‑1 (MQ=255) aaCATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTg < 8:296976/150‑1 (MQ=255) aaCATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGa < 3:913432/151‑1 (MQ=255) aCATACGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGAt > 3:1522777/1‑151 (MQ=255) aCGGGTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGATGtt < 1:483857/150‑1 (MQ=255) gggTTTGGTACGCTGCCTTCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGATGTTa > 5:1353704/1‑150 (MQ=255) ggTTTGGTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAACATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGATGTTAAAt < 8:838914/151‑1 (MQ=255) gTACGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGATGTTAAATCCGCGa < 1:1143974/151‑1 (MQ=255) aCGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGATGTTAAATCCGCGACg > 7:731671/1‑151 (MQ=255) aCGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGATGTTAAATCCGCGACg < 5:1052428/151‑1 (MQ=255) aCGCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGATGTTAAATCCGCGACg > 1:135553/1‑151 (MQ=255) gCTGCC‑TCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGATGTTAAATCCGCGACGCt > 5:1964265/1‑151 (MQ=255) | CACTTTGTCGTAAGCGCCAAAACCGTTTTCGACAATAAACAGCGGCCTCTGATAACGCTCATACAGTTCGCAAAGTGCATAGCGCAGACCTACTGGATCAATCTGCCAGCCCCAGTCAGATGCTTTAACATACGGGTTTGGTACGCTGCCTTCAAAACCAGAGATCGCATCGCCGGTGCCGCCTTCGGCCTTCACTGCATTGGTCATGTAATAGCTGAAACCAAGATAATCGCAGGTGCCTTCACGCAGCACATCCAGATCGCCGTCTTCCATTTTGATGTTAAATCCGCGACGCTC > DH1/838944‑839240 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |