New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | DH1 | = 1355505 | 440 (0.880) | 73 (0.170) | 32/260 | 11.6 | 20.4% | noncoding (54/348 nt) | repeat_region | repeat region |
? | DH1 | 3099693 = | 190 (0.440) | noncoding (58/76 nt) | ECDH1_RS15360 | tRNA‑Lys | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
CTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099543‑3099842 | tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCATGATGACTCGACTTCGTCTCTCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt < 2:236885/149‑1 (MQ=255) tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt < 3:612894/149‑1 (MQ=255) tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTc < 7:236187/150‑1 (MQ=255) 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gggATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGCGCCCTTGCTAACGAAACGATATCCTTCACGTTATCTACCAGTAAACACAATTAAATTTGTTGTTAGTTCAGGATTCGaa > 8:787926/1‑150 (MQ=21) ggATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAAcc < 4:14051/151‑1 (MQ=255) gagtctgctgcCTCAATCATTCAGCATGGGGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCGCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCt < 3:968579/146‑1 (MQ=25) aTTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAGTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCGTTCACGTTCTCTACCACTAACCACCTTTAAATTGGTCGGTCGTTCAGGATTCGAACCTg > 7:483990/1‑151 (MQ=255) aagctgcCTCCCTCATTGACGATGGGCGGTCGGGCAGTACGACTCCACGTCGGCTCCCCCTTCGTGCCTTTGCTTACTCAACGTTATACTTCACGTTCTCTACCAGTAAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCg < 3:813471/148‑1 (MQ=16) aTGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATAACAGTAACAAACTTTAAATTGGTGGGTCGTTCAGGATTCGAACCTGcc > 8:34787/1‑149 (MQ=21) ggtgcCTTCATCATGCATTATGGTCGGTCTTGCAGGAGGAGTCCACGTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTGTCTCACGCAACGTTATACTTCAAGATCTCTACCAGTCAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAcc < 3:118477/149‑1 (MQ=18) tgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCATCGGGCCGTTGATAACGCAAGGTAAACCTTCACGTACTCTACCAGGTCACACGGTTAAATTGGTGGGTCTTGCAGGATTAGAAACTGCGCCCa > 1:793555/1‑150 (MQ=21) gcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAAACTGCGACCAAt > 5:561391/1‑151 (MQ=255) ccTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGCCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGATAAATACCAGTAAAAACATTTAAATTTGTGGGTAGTGCAGGATTCGAAACAGCCACCAAtt > 2:1247558/1‑151 (MQ=21) cTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTg > 3:1325727/1‑151 (MQ=255) cTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCAGTTGCTAACGCAACGTTATCATTCACGTTATATACAACTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAGCAATTg > 5:603239/1‑151 (MQ=18) ttAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGGAGGATTCGAACCTGCGACCAATTg > 4:1945360/1‑150 (MQ=255) aTCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACCTGCGACCAATTGAtt > 1:1331079/1‑150 (MQ=255) tCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCATCACGTACACTAACAGTAAAGACCTGTAAATAGGTGGGTCGTGCACGCATCGAACCTGCGAAGAATTGATTa > 1:584630/1‑150 (MQ=21) tCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCATTCACGTTCTCTACCAGTAAACACGTTTAAATTTGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAtaa > 6:831289/1‑148 (MQ=255) tCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTATAGCAGTAAGCACATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCaaagcaatacacgg > 1:223580/1‑139 (MQ=18) cAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTAACAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAAACAGCGACCAATTTATTAAAAGTc > 3:105427/1‑151 (MQ=255) cAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCGCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGAAGGATTCGACCCTGCGCCCACTTGATTTATAGTc > 1:401023/1‑151 (MQ=21) aGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCATTCACGTTATCTAACAGTAACAACCTTTAAATTGGTTCGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTTATTAAAAgaa > 3:1556963/1‑148 (MQ=18) aGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCAGTTGCTAGCGCAACGTTATCCTTCACGTTCGCTAGCAGTATGATCGTTTAAATTGGTTGATCGGGCACGATGCCAACCTGCCACCACTGGAAGAAAAGta > 1:1153252/1‑149 (MQ=12) aGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAATACCTCTCGCCCTTCGGGCAGTTTATAACGCAAAATTATACATAACTTTATATAACAGTAACAAAATTTAAAATTATGGGTCGTGCAGGATTCGAACCAACGACGAAATGAtttattgtcg > 8:1952568/1‑143 (MQ=12) ggcgggccggTCTTGCCCGAGGACTCGCCTTCCGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCaa < 3:1522037/143‑1 (MQ=18) ggggggTCGTGCAGGATGACTCGAGCTCGGCTCGCCCTTCGGGCAGTTGCTCACGCAACGTTATACTTCACGTGCTCTACCAGTAAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACt < 7:1698493/146‑1 (MQ=18) ggggCGTGCAGGAGGAGACGAGGTCGTCTCGCGCAGCGGGCCGTGGCTAACGCAACGTTATCCCTAACGAGCGCTTCCAGGCAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGctct < 7:799650/151‑1 (MQ=17) tGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACATGCGAACAATAGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAAc > 6:1861093/1‑151 (MQ=255) gCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACt > 3:483285/1‑151 (MQ=255) cAGGATGACTCGACTTCCGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTg < 3:1911816/151‑1 (MQ=255) aCTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGATATCTACCAGTAACAAACTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACATGAGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGATaa > 2:550787/1‑150 (MQ=18) tCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCCTACCTTCGACCAATTGATTAAAAGTGAACTGCTCTACCAACTGATCTAACg > 3:710380/1‑150 (MQ=255) 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accTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAgg > 7:1201776/1‑150 (MQ=255) ttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTggg < 8:121049/137‑1 (MQ=255) ttAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATg < 1:958063/149‑1 (MQ=255) acaTTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAACTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGCGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACt < 5:86489/148‑1 (MQ=255) caTTGGGGGGGCGTGCAGGATTCGAACCTGCTACCAATTGACTAAAACTCAACTCCTCTACCAACTCAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGGCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcg < 1:1015663/150‑1 (MQ=25) gttttctgttctaagATTCTAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACCGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgctt < 2:1769680/136‑1 (MQ=37) ggtgtgtctttcattaTTCGAACCTGCTACCAATTTATTAAAATTCAACTGGTCTACCATCTGAGCTAAATACCAATACGTTTGTTAACTGAAAGATTTTTACTCTTGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgcttc < 6:1461862/136‑1 (MQ=25) ggtggGTCGTGCAGTATTCGAACCTGCTACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGATCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgctta < 7:980094/151‑2 (MQ=255) gtggGTCGTGCAGGATTCCAACCTGCGAACAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGATAACGACCCATAAGGGTGTTACATGAAAGATATTTACTCGGCGCCAATATTTAAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtctcttcc > 4:750781/1‑150 (MQ=21) tggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGtt < 1:712796/84‑1 (MQ=255) gggTCGGGCAGGAGTCGAACGTGCGACCAATTGATTAAAACGCAACAGCTCTACCACCTCCGCTACCGCCCCATACGGGTGTTACCTGAACCAGTTTTACTCTCGGCCCATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgcttcgct < 3:1027625/151‑1 (MQ=25) gatctgTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAATTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgcttcg < 4:1011149/144‑1 (MQ=255) cGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAGCCATACCGGAGAGAGCTGAACGAGATTTACGCCGGGCCAAGGGTTAAGATTGGTGCTTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGcc > 3:1938330/1‑151 (MQ=18) cGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAt > 1:1624712/1‑70 (MQ=31) ggtcAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGccc < 7:1014217/148‑1 (MQ=255) acggATTCTAACCTGATATCAATTTATTAAAACTCAATTGCTCTACAATATGCTCTAACGATCTATACGGTTTTTACCTGAAAGTTTTTTACTCTGGGTTAATCTTTAAGCTTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTa < 2:1841500/148‑1 (MQ=19) aGGATTCGACCCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCGCTACCAACTTAGCTTACGTCCCATACGGTTTTTACCTGATCGTTTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCCACg < 6:347772/151‑1 (MQ=25) aGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACg > 4:1281513/1‑151 (MQ=255) ggATTCGAACGTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACgg < 8:1045311/151‑1 (MQ=255) ttCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTGTAAGATTGGTGGGTCGTGCAg > 7:1268453/1‑122 (MQ=255) tCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGcc < 5:231746/150‑1 (MQ=255) | CTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099543‑3099842 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |