Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | DH1 | 2,019,390 | T→A | I381N (ATC→AAC) | ydjK → | MFS sugar transporter membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | DH1 | 2,019,390 | 0 | T | A | 98.0% | 1513.0 / 7.4 | 407 | I381N (ATC→AAC) | ydjK | MFS sugar transporter membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (6/2); new base A (217/182); total (223/184) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.92e-01 |
Only 100 of 410 total aligned reads displayed.
GGTGTGGGGCTATTAATCCTGATTGCGGTGCTCGGATATATCTATTCACTGCAAACCAGTATGTTGCTCATAACGTTGATTGGTTTCTTCCTGATTACTTTCGTCTATATGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAATCTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTATTCTTCTGGGGGCGGTTTCAAT > DH1/2019242‑2019537 | ggTGTGGGGCTATTAATCCTGATTGCGGTGCTCGGATATATCTATTCACTGCAAACCAGTATGTTGCTCATAACGTTGATTGGTTTCTTCCTGATTACTTTCGTCTATATGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACt < 7:754737/151‑1 (MQ=255) gtgtGGGGCTATTAATCCTGATTGCGGTGCTCGGATATATCTATTCACTGCAAACCAGTATGTTGCTCATAACGTTGATTGGTTTCTTCCTGATTACTTTCGTCTATATGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTg < 3:709946/151‑1 (MQ=255) ggCTATTAATCCTGATTGCGGTGCTCGGATATATCTATTCACTGCAAACCAGTATGTTGCTCATAACGTTGATTGGTTTCTTCCTGATTACTTTCGTCTATATGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGAc < 4:277881/151‑1 (MQ=255) 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atatatCTATTCACTGCAAACCAGTATGTTGCTCATAACGTTGATTGGTTTCTTCCTGATTACTTTCGTCTATATGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCATGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTg > 5:1961238/1‑151 (MQ=255) tatatCTATTCACTGCAAACCAGTATGTTGCTCATAACGTTGATTGGTTTCTTCCTGATTACTTTCGTCTATATGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTgg > 2:1823346/1‑151 (MQ=255) atatCTATTCACTGCAAACCAGTATGTTGCTCATAACGTTGATTGGTTTCTTCCTGATTACTTTCGTCTATATGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGc < 5:13108/151‑1 (MQ=255) atatCTATTCACTGCAAACCAGTATGTTGCTCATAACGTTGATTGGTTTCTTCCTGATTACTTTCGTCTATATGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGc > 8:285072/1‑151 (MQ=255) tatCTATTCACTGCAAACCAGTATGTTGCTCATAACGTTGATTGGTTTCTTCCTGATTACTTTCGTCTATATGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCg > 1:1195697/1‑151 (MQ=255) 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atGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGc < 8:815762/150‑1 (MQ=255) atGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCg > 3:1895022/1‑151 (MQ=255) tGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGt > 8:1773369/1‑151 (MQ=255) gTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGtt > 5:1252773/1‑151 (MQ=255) aCGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTa < 5:1785377/150‑1 (MQ=255) aCGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTa < 7:519050/150‑1 (MQ=255) aCGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTAc < 1:1579954/151‑1 (MQ=255) cGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACg < 1:43301/151‑1 (MQ=255) gTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACgg > 2:203368/1‑151 (MQ=255) gCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAg < 8:1218671/150‑1 (MQ=255) tATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCt > 5:1675326/1‑151 (MQ=255) ccTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTAt > 7:1149553/1‑151 (MQ=255) cGGCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTAttct < 4:1893848/151‑1 (MQ=255) gCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTAttcttc > 3:1102017/1‑151 (MQ=255) gCAGTGTATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTAttcttc < 5:867940/151‑1 (MQ=255) gtgtATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTATTCTTCTgg > 3:1081473/1‑151 (MQ=255) tATGTCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTATTCTTCTggggg > 4:74490/1‑151 (MQ=255) tCCCTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTATTCTTCTGGGGGCGGt > 7:925781/1‑151 (MQ=255) cTGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTATTCTTCTGGGGGCGGTTTc > 3:1442718/1‑151 (MQ=255) tGAAAACTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTATTCTTCTGGGGGCGGTTTc > 8:1124642/1‑150 (MQ=255) taaaaCTGGCCTACAGAGGCAAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGACGTTGCAGTGCTGATCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTATTCTTCTGGGGGCGGTTTCa < 4:1663655/149‑1 (MQ=255) aaaaCTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGCCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCAGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGCAGTCTTTATTCTTCAGGGGGCGGTTTCAat > 8:425759/1‑151 (MQ=255) | GGTGTGGGGCTATTAATCCTGATTGCGGTGCTCGGATATATCTATTCACTGCAAACCAGTATGTTGCTCATAACGTTGATTGGTTTCTTCCTGATTACTTTCGTCTATATGTACGTTTGCTATGCCTCGGCAGTGTATGTCCCTGAAATCTGGCCGACAGAGGCCAAACTCCGTGGCTCCGGTCTGGCGAATGCGGTAGGGCGAATCAGTGGTATTGCCGCACCTTATGCCGTTGCAGTGCTGCTCAGTAGTTATGGCGTTACGGGAGTCTTTATTCTTCTGGGGGCGGTTTCAAT > DH1/2019242‑2019537 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |