| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | DH1 | 3,154,902 | A→T | I274F (ATC→TTC) | kdpB → | potassium‑transporting ATPase B chain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | DH1 | 3,154,902 | 0 | A | T | 98.0% | 1365.1 / 9.5 | 400 | I274F (ATC→TTC) | kdpB | potassium‑transporting ATPase B chain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/5); new base T (187/204); total (190/210) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.28e-01 | |||||||||||
Only 100 of 400 total aligned reads displayed.
GCTGATTGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGATCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGCGTCGGAGTTTA > DH1/3154754‑3155049 | tgATTGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCgg > 8:1076690/1‑151 (MQ=255) gATTGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCg < 7:224763/149‑1 (MQ=255) gATTGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCg < 3:793580/149‑1 (MQ=255) ttGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGt > 1:104069/1‑151 (MQ=255) tGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGt < 1:213884/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGGGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTc > 1:1119470/1‑151 (MQ=255) cccTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGc < 8:1144445/151‑1 (MQ=255) cccTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGc < 5:581119/151‑1 (MQ=255) ccTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGcc > 8:815215/1‑151 (MQ=255) aCTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGa < 8:230831/151‑1 (MQ=255) tATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATg > 3:1106247/1‑151 (MQ=255) aTCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGAt < 1:1249743/149‑1 (MQ=255) cGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAg < 7:1648046/150‑1 (MQ=255) gTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGATCGGCGTCGCCGGGATGAGcc < 1:310866/151‑1 (MQ=255) tCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCg > 2:1148991/1‑151 (MQ=255) tttttACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCCCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGCTGCCGCTGCTGGTGTGTCTGATCCCAACCACTATTGCCGGCCTGTTGTCAGGGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCggc > 8:1624000/1‑150 (MQ=255) ttttACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGa < 5:1413553/150‑1 (MQ=255) ttttACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGGCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCgg < 7:532997/149‑1 (MQ=255) tttACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGAt < 6:54835/150‑1 (MQ=255) tttACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGAt < 5:276283/150‑1 (MQ=255) tttACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATg > 3:1419931/1‑151 (MQ=255) aCTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATTCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTa < 4:1351132/151‑1 (MQ=255) aCTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCt > 8:672010/1‑150 (MQ=255) aCTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGGTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCt < 4:1063684/150‑1 (MQ=255) tGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAgg > 4:940570/1‑151 (MQ=255) gCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGgcg > 4:1913036/1‑151 (MQ=255) gCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGgcg > 2:1632965/1‑151 (MQ=255) caccgagaCGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGGCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTGCGGCGGCGCCGGGATGAGCCGGATGCTATGcgcg < 4:1222424/144‑1 (MQ=255) aCCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGcgcg > 8:1741699/1‑150 (MQ=255) aCCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGcgcg > 5:1558575/1‑150 (MQ=255) cACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAAtgtg > 1:476196/1‑151 (MQ=255) cGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGAt > 3:1806282/1‑151 (MQ=255) gtgtgGACGTTTTCCGCGTGTGGCTGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGTTGGCGCTGNNGGTCTNNNTNNNNNNANNNNNNATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTg < 4:758278/150‑1 (MQ=255) cTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTg > 5:1514916/1‑151 (MQ=255) gggCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGcca < 7:1028365/150‑1 (MQ=255) gTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTATTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGc > 5:1472344/1‑151 (MQ=255) gTTTTCCGCGTGGCGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTTGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGc < 4:1866144/151‑1 (MQ=255) ttttCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCg > 2:229586/1‑151 (MQ=255) ttttCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCg > 4:636920/1‑151 (MQ=255) ccGCGTGGGGCTTTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTTGTGGAGCTGCTGGTCTTTCTGATCCGAACCACTATTTGCGGCATGTTGTCATCGTTCGGCGTCTCCGGTATGAGCCGGATGCTAGGCTCTAATGTGATTGCCACCAGCGGAc < 6:1785364/150‑1 (MQ=255) ccGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGAc < 1:1466556/150‑1 (MQ=255) cgcgTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGt > 2:557123/1‑151 (MQ=255) cgcgTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGt > 7:1858540/1‑151 (MQ=255) ggggggTAATGCATTCATCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTTTCTGATGCCAACGACTATTGGGGGCCTGTTGTCAGAGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGTCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGAAGTGCAGt < 5:894073/150‑1 (MQ=255) gggCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGtt > 8:580541/1‑151 (MQ=255) ggCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTg < 2:1038733/151‑1 (MQ=255) gCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGa < 4:528505/151‑1 (MQ=255) cGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCCGCCTGTTGTCAGCCTTCGGCGTCGCCGGGAAGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGa > 6:1657101/1‑150 (MQ=255) aaTGCAGTCAGCGTACCGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCgg < 4:341061/151‑1 (MQ=255) aaTGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTAATGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCgg > 6:150292/1‑151 (MQ=255) gCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCa < 5:713148/150‑1 (MQ=255) cAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAgg > 3:232000/1‑151 (MQ=255) aGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGATCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGt > 2:1424847/1‑151 (MQ=255) gTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGtg < 5:1946287/151‑1 (MQ=255) gTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGCCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGtg > 8:332999/1‑151 (MQ=255) cGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGtgacgtt > 3:1713530/1‑151 (MQ=255) gTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGtgacgttg > 5:1878996/1‑151 (MQ=255) tAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGtgacgttg > 6:227575/1‑150 (MQ=255) cGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGtgacgttgacgt > 3:1507773/1‑151 (MQ=255) cGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGtgacgttgacgt > 6:1109093/1‑151 (MQ=255) aCTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTg > 5:128160/1‑151 (MQ=255) aCTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTg < 1:1873118/151‑1 (MQ=255) aCTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTg < 8:1333238/151‑1 (MQ=255) ggtggCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCt > 5:516025/1‑150 (MQ=255) ggtggCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTa < 2:1694865/151‑1 (MQ=255) gtggCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTAc < 6:1907121/151‑1 (MQ=255) gtggCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTAc < 2:1239746/151‑1 (MQ=255) ggCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACt < 6:934898/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTg < 6:1738798/151‑1 (MQ=255) gctgctGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGATCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGAt < 7:383144/151‑1 (MQ=255) gctgGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTGCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATa < 6:1353852/149‑1 (MQ=255) ggTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATaaaa < 7:119400/149‑1 (MQ=255) ggTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGCCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCACCGGACCTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAAcc > 5:41807/1‑151 (MQ=255) gtctgtctGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCg > 7:1568874/1‑151 (MQ=255) gtctgtctGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGGCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCg < 1:1611203/151‑1 (MQ=255) ctgtctgATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGc > 8:1889371/1‑151 (MQ=255) gtctgATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCgg < 2:857438/148‑1 (MQ=255) ctgATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAACACCGGCAcc > 3:1284255/1‑150 (MQ=255) ctgATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCAcc > 6:827626/1‑150 (MQ=255) gATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCAt < 5:1005871/150‑1 (MQ=255) ccAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTGAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCTGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCacac < 2:436579/151‑1 (MQ=255) aaCCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTc < 7:813541/151‑1 (MQ=255) aCCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCg < 4:1626578/151‑1 (MQ=255) ccACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCgg > 2:1863882/1‑151 (MQ=255) cACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGt < 3:454612/151‑1 (MQ=255) cTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTa > 1:888325/1‑150 (MQ=255) cTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATAGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGCCACCATCACACTCGGTa > 8:121723/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAAcc < 3:599974/151‑1 (MQ=255) aTTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAAcc < 7:608208/151‑1 (MQ=255) aTTGGCGGCCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAAc < 3:665562/150‑1 (MQ=255) aTTGGCGGCCTGTTGTCAGCGATCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAAcc < 6:1226648/151‑1 (MQ=255) ggcggcCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGt < 2:752078/150‑1 (MQ=255) ggcCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAgg > 2:1350313/1‑151 (MQ=255) gcCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGc > 2:1543139/1‑151 (MQ=255) gcCTGTTGTCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGc < 5:1335199/151‑1 (MQ=255) tgttgtCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGCGTc > 3:270889/1‑151 (MQ=255) gttgtCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGCGTc < 7:951487/150‑1 (MQ=255) gttgtCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGCGTCg < 8:29682/151‑1 (MQ=255) ttgtCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGCGTCgg > 1:689323/1‑151 (MQ=255) gtCAGCGTTCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGCGTCGGAg < 1:1723922/151‑1 (MQ=255) | GCTGATTGCCCTGACTATCGTCTTTTTACTGGCAACCGCCACGCTGTGGCCGTTTTCCGCGTGGGGCGGTAATGCAGTCAGCGTAACGGTACTGGTGGCGCTGCTGGTCTGTCTGATCCCAACCACTATTGGCGGCCTGTTGTCAGCGATCGGCGTCGCCGGGATGAGCCGGATGCTAGGCGCGAATGTGATTGCCACCAGCGGACGTGCAGTTGAAGCGGCAGGTGACGTTGACGTTCTGCTACTGGATAAAACCGGCACCATCACACTCGGTAACCGTCAGGCGTCGGAGTTTA > DH1/3154754‑3155049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |