| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | DH1 | 3,944,733 | T→C | I75T (ATT→ACT) | mdtM → | multidrug resistance protein MdtM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | DH1 | 3,944,733 | 0 | T | C | 98.3% | 1942.3 / 8.8 | 525 | I75T (ATT→ACT) | mdtM | multidrug resistance protein MdtM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/7); new base C (255/257); total (258/267) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.60e-01 | |||||||||||
Only 100 of 526 total aligned reads displayed.
CGTATCTGTCGACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAATTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTGCCACCGTTGGTTATGT > DH1/3944583‑3944880 | tATCTGTCGACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTg > 4:1666032/1‑151 (MQ=255) aTCTGTCGACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTgg > 2:755970/1‑151 (MQ=255) aTCTGTCGACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTg < 7:1330593/150‑1 (MQ=255) tCGACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGc > 5:253773/1‑150 (MQ=255) cGACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGc > 2:499586/1‑149 (MQ=255) cGACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGc > 2:1456482/1‑149 (MQ=255) cGACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAg < 4:1310600/151‑1 (MQ=255) cGACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAg < 3:1833916/151‑1 (MQ=255) gACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAgg < 7:1070038/151‑1 (MQ=255) gACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAgg > 7:255980/1‑151 (MQ=255) aCGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGc > 6:1633423/1‑151 (MQ=255) aCGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGc > 7:667386/1‑151 (MQ=255) aCGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGc > 2:1022648/1‑151 (MQ=255) ggATCTGATGCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCg < 8:215470/151‑1 (MQ=255) ggATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCg > 1:1933044/1‑151 (MQ=255) ggATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTCGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGACCTCGCCGCAGGCCg > 4:1203123/1‑151 (MQ=255) gATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCgg > 8:546403/1‑151 (MQ=255) gATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGt < 7:910273/147‑1 (MQ=255) cAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGGCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTa < 1:1777034/151‑1 (MQ=255) gggATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCgggg < 6:1191359/151‑1 (MQ=255) ggATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGgc < 4:692013/151‑1 (MQ=255) gATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGgcg > 2:378358/1‑151 (MQ=255) aTCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCATTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCCGGgcgc > 1:306807/1‑151 (MQ=255) tCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCt > 6:404557/1‑151 (MQ=255) aaTGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAAttt < 6:1804711/151‑1 (MQ=255) aaTGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAAtt < 1:1021078/150‑1 (MQ=255) gtgGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTa < 1:1585759/151‑1 (MQ=255) tgGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTAc > 3:1505926/1‑151 (MQ=255) gTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGc < 1:1257549/151‑1 (MQ=255) tGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGcc > 8:406860/1‑151 (MQ=255) gATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCt < 3:1774760/151‑1 (MQ=255) aTTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTg > 1:120788/1‑151 (MQ=255) ttAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCTCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTgcg < 7:203923/150‑1 (MQ=255) ttAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTgcg < 6:738656/150‑1 (MQ=255) tAATGCCGACGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGcgcc > 8:1049163/1‑151 (MQ=255) aaTGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGcgccg > 1:39583/1‑151 (MQ=255) aaTGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGcgccg < 2:1738237/151‑1 (MQ=255) aaTGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGcgcc < 4:366865/150‑1 (MQ=255) aaTGCCGATGTCAGGCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTCTCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGcgcc < 8:754898/150‑1 (MQ=255) gCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTATACCCTTGCCTGCGCcgcg < 6:602990/150‑1 (MQ=255) gATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACa > 6:224180/1‑150 (MQ=255) aTGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAAt < 7:1631768/151‑1 (MQ=255) aTGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAAt > 6:989952/1‑151 (MQ=255) aTGTCAGGCTGGCCGCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCTCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAAt < 7:1811790/151‑1 (MQ=255) aTGTCAGGCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAAt < 5:370588/151‑1 (MQ=255) ggTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATg < 6:1713799/150‑1 (MQ=255) gTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGt > 8:1103443/1‑151 (MQ=255) cAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGtt < 2:1211966/150‑1 (MQ=255) cAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTc > 8:1193240/1‑151 (MQ=255) cAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCGGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGACCTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTc < 3:1426439/151‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTc < 5:623326/151‑1 (MQ=255) aGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTca < 7:1718775/151‑1 (MQ=255) tCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTcac > 2:1806954/1‑150 (MQ=255) ggCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACaa < 5:1145317/149‑1 (MQ=255) ccccTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTc < 8:1815468/151‑1 (MQ=255) cccTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCt < 4:777995/151‑1 (MQ=255) ctgctgCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCCCACCGTCTAt > 2:1932358/1‑151 (MQ=255) ctgctgCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTAt > 5:1314664/1‑151 (MQ=255) 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cGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGacac > 2:991508/1‑149 (MQ=255) cAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGttt > 8:807768/1‑151 (MQ=255) ctctATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCtt > 4:300242/1‑150 (MQ=255) tctATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTAt > 7:435305/1‑151 (MQ=255) aTCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATcgc > 3:40521/1‑151 (MQ=255) 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ggTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTc < 5:988453/151‑1 (MQ=255) ggTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTc > 5:1738963/1‑151 (MQ=255) gTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCa < 4:978776/151‑1 (MQ=255) aTGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAg < 2:1525269/150‑1 (MQ=255) ggCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGc < 4:1448462/151‑1 (MQ=255) gTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCAcc > 2:1621668/1‑151 (MQ=255) tACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCAcc > 4:559690/1‑149 (MQ=255) cAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAATTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTa < 5:1554746/151‑1 (MQ=255) cAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGt > 2:328240/1‑150 (MQ=255) gTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATc < 1:1470071/151‑1 (MQ=255) ggCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCt < 2:601388/150‑1 (MQ=255) gctgctGGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTAAAGGGGAGCTAATTTTTAACCTTGCCTGCGCAGCCCCAATGTTAACAAAGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGt > 1:696603/1‑151 (MQ=255) ctgctgGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGtt > 3:1647305/1‑151 (MQ=255) ctgctgGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGtt > 1:969421/1‑151 (MQ=255) tgctgGGGCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGTGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGttt > 2:269405/1‑151 (MQ=255) gggCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTg > 7:1481756/1‑151 (MQ=255) gggCCGCTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTg > 1:1662923/1‑151 (MQ=255) ccGCTGTCCGACAGAACGGGCCGCAGGGCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTGCCa < 8:1643549/151‑1 (MQ=255) cTTTCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTGCCACCg > 5:1891116/1‑151 (MQ=255) ttCCGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTGCCACCGtt > 8:1881499/1‑151 (MQ=255) cGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACAGAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTGCCACCGTTGGt < 5:78879/151‑1 (MQ=255) cGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTGCCACCGTTGGt < 4:1925080/151‑1 (MQ=255) cGACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAAGTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTGCCACCGTTGGt > 4:107336/1‑151 (MQ=255) gACAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTGCCACCGTTGGtt > 3:832860/1‑151 (MQ=255) cAGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTGCCACCGTTGGTTAt < 1:496970/151‑1 (MQ=255) aGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTGCCACCGTTGGTTATg > 1:842799/1‑151 (MQ=255) aGAACTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGGATCTGTTTTATTGCCACCGTTGGTTATg > 1:1390822/1‑151 (MQ=255) | CGTATCTGTCGACGGATCTGATCCAGCCTGGGATCATTAATGTGGTACGTGATTTTAATGCCGATGTCAGTCTGGCCCCTGCTGCCGTCAGTCTCTATCTTGCTGGCGGTATGGCGTTACAGTGGCTGCTGGGGCCGCTTTCCGACAGAATTGGCCGCAGGCCGGTGCTGATTACCGGGGCGCTAATTTTTACCCTTGCCTGCGCCGCGACAATGTTCACAACGTCTATGACACAGTTTCTTATCGCGCGTGCAATTCAGGGCACCAGTATCTGTTTTATTGCCACCGTTGGTTATGT > DH1/3944583‑3944880 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |