| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | DH1 | 1,618,508 | T→A | I6N (ATT→AAT) | psuG → | pseudouridine‑5'‑phosphate glycosidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | DH1 | 1,618,508 | 0 | T | A | 99.0% | 1569.1 / ‑1.2 | 418 | I6N (ATT→AAT) | psuG | pseudouridine‑5'‑phosphate glycosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/2); new base A (216/198); total (218/200) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 425 total aligned reads displayed.
GGTAGACGGAATGCCGTTTGCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAATTTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAATTGAAGTTGAAGAAACTAT > DH1/1618360‑1618655 | ggTAGACGGAATGCCGTTTGCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAatt < 3:63434/151‑1 (MQ=255) tAGACGGAATGCCGTTTGCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTcc > 2:1457153/1‑151 (MQ=255) aGACGGAATGCCGTTTGCCGAATCTGTCCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTCTGAATACACCAAAAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTcc < 8:291065/150‑1 (MQ=255) aCGGAATGCCGTTTGCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTAAGTGCAGAACGATGAATGTCTGAATTAAAAAATTcccat > 3:1381012/1‑149 (MQ=255) gAATGCCGTTTGCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGa > 4:1368607/1‑150 (MQ=255) gAATGCCGTTTGCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGa > 4:1612753/1‑150 (MQ=255) aaTGCCGTTTGCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGTGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAat < 6:1367643/151‑1 (MQ=255) ccGTTTGCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAattatt > 3:480690/1‑151 (MQ=255) gTTTGCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTAc < 3:1583568/151‑1 (MQ=255) gTTTGCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTCAATTATTAc > 7:588412/1‑151 (MQ=255) gCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACaaa < 1:1552224/150‑1 (MQ=255) gCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACaaa < 6:1787423/150‑1 (MQ=255) ccGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAAtt > 8:1078392/1‑151 (MQ=255) ccGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAAtt > 5:867936/1‑151 (MQ=255) ccGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAAtt < 8:679753/151‑1 (MQ=255) cGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAAttt < 2:1095808/151‑1 (MQ=255) cGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAAttt < 6:1495800/151‑1 (MQ=255) gAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATACCCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTc < 5:214430/151‑1 (MQ=255) gAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAAttac < 6:1045272/151‑3 (MQ=255) gAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTc < 2:1784516/151‑1 (MQ=255) gTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCgg > 4:1799725/1‑150 (MQ=255) gTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCg < 6:436118/149‑1 (MQ=255) ttCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGa > 2:1649864/1‑150 (MQ=255) tCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGaat > 3:179181/1‑150 (MQ=255) cGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGt < 2:870226/151‑1 (MQ=255) gTTTCGCACAGGGATTTTCTTCAATGGCTCTCTCCTGTTAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTg < 6:120092/151‑1 (MQ=255) gTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTg > 7:309968/1‑151 (MQ=255) gTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTg > 1:479205/1‑151 (MQ=255) gCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGa < 7:1365134/151‑1 (MQ=255) cacaGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGAc > 8:1212060/1‑151 (MQ=255) caGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGc > 5:520933/1‑151 (MQ=255) aGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCt > 5:326799/1‑151 (MQ=255) aGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCACCGGAAGTGCAGGACGCt > 4:58342/1‑151 (MQ=255) tGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaa > 5:1159190/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCAATGGCGCTCTGCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCAAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaaa < 3:1192293/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaaa < 5:1593095/150‑1 (MQ=255) tCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaaaaa < 8:1562055/150‑1 (MQ=255) cGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaaaaaac < 2:519995/151‑1 (MQ=255) cGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaaaaaac > 6:793433/1‑151 (MQ=255) cGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaaaaaac > 4:285755/1‑151 (MQ=255) cAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaaaaaacaaa < 3:404477/151‑1 (MQ=255) aaTGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaaaaaacaaa > 8:765218/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaaaaaacaaaaa < 3:996545/151‑1 (MQ=255) aTGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaaaaaacaaaaa < 5:567338/151‑1 (MQ=255) aTGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTaaaaaacaaaa > 2:1575558/1‑150 (MQ=255) gcgcTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAAcc > 7:712420/1‑151 (MQ=255) tctcCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGTACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGCCGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGtt > 1:785031/1‑151 (MQ=255) ccTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGtt < 8:394999/148‑1 (MQ=255) ccTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTtgt < 8:227858/150‑1 (MQ=255) ccTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTtg < 8:573909/149‑1 (MQ=255) aaTACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCt < 7:1871009/150‑1 (MQ=255) aaTACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTg < 1:1842767/151‑1 (MQ=255) aaTACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTg > 8:1802649/1‑151 (MQ=255) aTACACCATTAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTgg < 4:1207609/151‑1 (MQ=255) acacCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGaa < 1:662396/151‑1 (MQ=255) acCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAAtg > 2:253288/1‑150 (MQ=255) acCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATc > 6:724991/1‑151 (MQ=255) acCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATc < 3:252471/151‑1 (MQ=255) acCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATc > 1:1274758/1‑151 (MQ=255) ccAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCg > 1:1659419/1‑151 (MQ=255) cAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGa < 7:901677/151‑1 (MQ=255) cAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGAGCTGGAATCg > 8:1682409/1‑150 (MQ=255) aaTAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGAc > 6:601205/1‑151 (MQ=255) aTAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGAcc > 4:1513952/1‑151 (MQ=255) aCCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCatt < 1:1091413/151‑1 (MQ=255) aCCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCatt < 2:986778/151‑1 (MQ=255) ccGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCattatt > 1:100268/1‑151 (MQ=255) ccGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCattatt > 2:126218/1‑151 (MQ=255) ccGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCattatt > 1:1952587/1‑151 (MQ=255) cGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTAttt > 4:1872108/1‑151 (MQ=255) gATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTtc > 8:1946900/1‑151 (MQ=255) gATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTtc > 7:1087477/1‑151 (MQ=255) ttGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTCGCGCTCGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATg > 4:841125/1‑151 (MQ=255) ccAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCg < 4:495383/151‑1 (MQ=255) cGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTcc > 7:1551302/1‑151 (MQ=255) atCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACaa > 1:433137/1‑150 (MQ=255) atCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGGCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACaa < 1:362717/150‑1 (MQ=255) tCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACaaa > 2:1927358/1‑150 (MQ=255) gTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATg > 7:1264244/1‑151 (MQ=255) aGTGGAGATCGCAGAATGTCTGAATTATAAAATTGCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAAGAAAAAACCGGTTGTGGCGGTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGccc < 6:270887/151‑1 (MQ=255) ggAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGa < 3:821269/151‑1 (MQ=255) gagaACGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGAc < 2:463616/151‑1 (MQ=255) aCGCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCa < 5:1296443/151‑1 (MQ=255) gCAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAt < 5:96230/151‑1 (MQ=255) cAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAtt < 6:984490/151‑1 (MQ=255) cAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAtt > 1:141732/1‑151 (MQ=255) cAGAATGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAtt < 3:1909419/151‑1 (MQ=255) aaTGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAGTTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttgaa < 5:1043830/151‑1 (MQ=255) aaTGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttgaa < 4:1555161/151‑1 (MQ=255) aaTGTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttga > 8:14111/1‑150 (MQ=255) ttCTGAATTAAAAAATTCCCCTTAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCATGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttgaagt < 2:1832139/149‑1 (MQ=255) gTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttgaagtt < 7:1664069/151‑1 (MQ=255) gTCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttgaagtt > 4:305658/1‑151 (MQ=255) tCTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttgaagttg > 6:1977062/1‑151 (MQ=255) cTGAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttgaagttg > 7:262294/1‑150 (MQ=255) ttaaTTAAAAAATTCACCTGAATTATTAAAAAATTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttgaagttga < 4:662921/148‑1 (MQ=255) gAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttgaagttgaa < 7:34679/150‑1 (MQ=255) gAATTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttgaagttg < 2:838233/148‑1 (MQ=255) aaTTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAAttgaagttgaag < 6:1698093/150‑1 (MQ=255) aTTAAAAAATTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTCGCGCTGGACTCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTACCCACAAAATGCACAGACCGCAATTGAAGTTgaaga > 4:1282544/1‑150 (MQ=255) | GGTAGACGGAATGCCGTTTGCCGAATCTGTTCGTTTCGCACAGGGATGTTCGTCAATGGCGCTCTCCTGTGAATACACCAATAACCCCGATTTATCGATTGCCAACGTTATATCGTTAGTGGAGAACGCAGAATGTCTGAATTAAAAATTTCCCCTGAATTATTACAAATTTCCCCGGAAGTGCAGGACGCTTTAAAAAACAAAAAACCGGTTGTGGCGCTGGAATCGACCATTATTTCTCACGGGATGCCGTTCCCACAAAATGCCCAGACCGCAATTGAAGTTGAAGAAACTAT > DH1/1618360‑1618655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |