New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 1519086 | 232 (0.620) | 37 (0.140) | 32/220 | 20.3 | 19.6% | coding (71/186 nt) | ECDH1_RS07485 | hypothetical protein |
? | DH1 | 1519282 = | 133 (0.490) | coding (787/900 nt) | yfaD | transposase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
CAAAAATGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1518897‑1519086 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccagcatgcgcaaagcaattttaatggcttgttcatgcaTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATT > DH1/1519282‑1519429 CAAAAATGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTT < 8:23338/151‑1 CAAAAATGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTT > 1:993872/1‑151 AAAAATGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTC > 4:178879/1‑151 AAAAATGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTC > 5:810146/1‑151 AAAATGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCC > 5:256564/1‑151 AAATGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCC > 7:77305/1‑150 AAATGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCAGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCA < 1:1360640/151‑1 AATGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAc > 4:455138/1‑150 TGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGC > 8:1304557/1‑150 TGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGC > 5:330532/1‑150 GGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAATCGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCA < 2:516361/150‑1 GGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTCGTTATTAGATGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAACCCCTGTTCCAGCAT > 2:196387/1‑151 GGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGATTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATc > 7:205722/1‑150 GCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGC < 7:332105/151‑1 GCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGC < 5:502525/151‑1 CCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCG > 5:353021/1‑151 CCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCACGCG < 1:945932/151‑1 ACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCA < 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GTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATG < 7:617534/151‑1 TATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGG < 7:1112086/150‑1 TATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCACAAAGGAAGATTAAacgg > 5:965512/1‑147 ATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCT < 3:158600/151‑1 ATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCT > 3:317525/1‑151 ATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATAGCT > 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CAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGG > 4:901308/1‑149 CAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTGTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGG > 6:1204077/1‑149 cGCAAGTTTAATCGCATGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTA < 4:887738/150‑1 CAATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATC < 3:1443385/151‑1 AATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACATTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCG > 2:837121/1‑151 ATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGC > 7:434331/1‑151 ATTTTAATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGC > 1:225271/1‑151 AATGGCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCAT > 2:425902/1‑151 tcacaccttctaaaATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATT < 3:1041796/136‑1 tcacacGTTCTTTCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATT < 4:551910/144‑1 GCTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCA < 1:1256552/151‑1 CTTGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGC > 5:1084675/1‑149 TGTTCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGCACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGC > 2:695802/1‑150 tcttttATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGA < 6:588584/144‑1 TCATGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGC > 6:389199/1‑147 catagATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGGCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATA < 1:275344/146‑1 attATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATA < 8:1208710/146‑1 TGCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATA < 5:832660/149‑1 GCATACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATT > 6:66973/1‑151 CAAAAATGGGCCACGCATAAAAGGTAGTTATTGATATCAAAGGCCCATGGGGATCGGCTGTGGGCCTGTGTTAATTAGTGGTTATTCGCTGCCAGATCGGCTTCGCTTAGCTGGGTGGCCGCGAGCACCTGGTCACGATCAAAGCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1518897‑1519086 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tccagcatgcgcaaagcaattttaatggcttgttcatgcaTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATT > DH1/1519282‑1519429 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |