| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | DH1 | 2,238,049 | Δ3 bp :: repeat_region (+) +5 bp :: Δ1 bp | coding (157‑161/216 nt) | essQ → | Lysis protein S homolog from lambdoid prophage Qin |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 2238049 = | 2 (0.010) | 372 (0.990) | 209/300 | 0.0 | 99.5% | coding (157/216 nt) | essQ | Lysis protein S homolog from lambdoid prophage Qin |
| ? | DH1 | = 2410568 | NA (NA) | noncoding (1334/1335 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
| * | ? | DH1 | = 2238053 | 2 (0.010) | 364 (0.970) | 203/300 | 0.1 | 99.4% | coding (161/216 nt) | essQ | Lysis protein S homolog from lambdoid prophage Qin |
| ? | DH1 | 2409238 = | NA (NA) | noncoding (4/1335 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
CTTTGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < DH1/2238197‑2238049‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCT < DH1/2410568‑2410419 TTGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGT < 5:49877/148‑1 TTGTCCTGTAAGGATACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAATTAAAGATTTGTCAGT < 6:1158159/148‑1 TGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGAT > 5:800224/1‑151 TGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGA < 1:966570/150‑1 CCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTG > 2:646141/1‑151 CTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGC > 4:1415790/1‑151 GTAGGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCC < 2:913466/151‑1 AAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCT > 4:713831/1‑151 GGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTAT > 7:892218/1‑151 GCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTAT > 1:151657/1‑150 CTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATAT > 2:1217984/1‑151 TACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATT > 8:183114/1‑151 ACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTT > 7:1276541/1‑151 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ATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATC > 6:335653/1‑150 TTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATAGTTCCAGACATCTGTTATCAC > 3:294207/1‑151 TCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCCCT > 4:921288/1‑151 TCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACT > 2:555421/1‑151 CAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTA < 4:1153210/150‑1 CAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTT < 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8:361007/150‑1 CGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTAT < 4:545795/148‑1 GCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGG < 3:1006759/151‑1 CCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGC < 8:244575/151‑1 TTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCC > 6:43213/1‑150 TACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCA < 6:1272645/150‑1 CCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGT < 3:1210123/151‑1 GTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTT < 3:79997/149‑1 CTTCTTTAATCTTGAATTAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATA > 1:324157/1‑150 TCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAAT < 8:838731/150‑1 TCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAA < 8:748987/149‑1 TTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTC > 2:1164358/1‑151 TTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGC < 6:793432/149‑1 TAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCG > 6:1214216/1‑151 TAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTC < 4:33027/150‑1 AATCTTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCG > 1:48787/1‑150 TTGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC > 3:191829/1‑151 TGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCC > 1:1439637/1‑151 TGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGC < 4:1060579/150‑1 TGAAATAAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAAC < 5:74317/148‑1 AAAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC < 1:201250/150‑1 AAGATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCA > 5:1413335/1‑150 GATTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGG < 6:383619/151‑1 TTTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTACCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTT > 2:1065342/1‑151 TTGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTT < 2:152314/150‑1 TGTCAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTC < 6:977045/150‑1 CAGTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTG < 8:1063287/151‑1 CTTTGTCCTGTAAGGCTACAGTTACCGTAACTTTATTCTCAAAATTACGGACTCCTTTCACAACCAGTTCATAGTCTTGAGTCATTGGATTACTCTCCTCTCGCAGCCTTACGCCTGTCTTCTTTAATCTTGAAATAAAGATTTGTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < DH1/2238197‑2238049‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTTGCT < DH1/2410568‑2410419 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |