| Predicted mutation | ||||||
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| JC | DH1 | 3,702,452 | (GTCATAACGACCGCCTAGGG)1→2 | coding (1442/2244 nt) | fhuA ← | ferrichrome‑iron receptor |
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TCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCGGATTGTACAGATTGAGCAGT > DH1/3702302‑3702601 | tacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTg < 7:446651‑M1/22‑1 (MQ=255) tataGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtc < 6:91935‑M2/150‑4 (MQ=255) acaccattataaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggGGCATAACGACCGCCTAGGGTGAc > 1:621971‑M1/128‑151 (MQ=255) 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ggggtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttggcattgaagtcgaaatcggtattcacc > 8:1165155‑M2/1‑3 (MQ=255) ggTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCGGATTGTACAGATTGAGCAGt < 4:996556/151‑1 (MQ=255) | TCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCGGATTGTACAGATTGAGCAGT > DH1/3702302‑3702601 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |