| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 245504 | 32 (0.090) | 397 (1.060) | 213/300 | 0.0 | 63.9% | coding (618/1500 nt) | pitA | Low‑affinity inorganic phosphate transporter 1 |
| ? | DH1 | 4010290 = | 417 (1.110) | intergenic (‑543/‑84) | yjhB/insG | MFS transporter membrane protein/transposase | |||||
Only 100 of 820 total aligned reads displayed.
GTATTTCTTTGCTTTTCTGTATACCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTC > DH1/4010140‑4010440 | tggcattcatgttcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggct < 1:1078829‑M2/1‑1 (MQ=255) ttGCTTTTCTGTATACCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCg > 2:1269081/1‑150 (MQ=255) catgttcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCg > 7:202681‑M2/143‑150 (MQ=255) tGCTTTTCTGTATACCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGAt > 1:846865/1‑151 (MQ=255) atgttcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGAt > 3:400051‑M2/142‑151 (MQ=255) atgttcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGAt > 7:850554‑M2/142‑151 (MQ=255) atgttcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGAt > 2:234375‑M2/142‑151 (MQ=255) gttcaccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagcacggcTAATGCCGATc > 5:1199223‑M2/140‑150 (MQ=255) tttCTGTATACCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAAt < 8:1144326/141‑1 (MQ=255) accacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTa < 3:174355‑M2/16‑1 (MQ=255) accacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTa < 1:420722‑M2/16‑1 (MQ=255) ccacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTaa < 6:406707‑M2/17‑1 (MQ=255) cacgaagcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAg < 3:836851‑M2/18‑1 (MQ=255) aCCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCa < 5:601179/151‑1 (MQ=255) gcctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAg < 4:1297526‑M2/24‑1 (MQ=255) ccTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAg < 8:231182/151‑1 (MQ=255) cctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGt > 2:1413121‑M2/127‑151 (MQ=255) cctgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGt > 3:573770‑M2/127‑151 (MQ=255) cTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGt > 1:492213/1‑151 (MQ=255) tgctggcgcgacgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTg > 1:117466‑M2/125‑151 (MQ=255) tataCCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAATTAAGGATCAGTTGACCGATcc > 1:149005/1‑149 (MQ=255) acgccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAg < 4:636390‑M2/37‑1 (MQ=255) gccaatcaataccaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgcagatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTg < 6:1156281‑M2/39‑1 (MQ=255) 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accaacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAg < 4:183929‑M2/49‑1 (MQ=255) aaaCAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGa > 6:1212976/1‑150 (MQ=255) aacataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAAt > 8:1072871‑M2/100‑151 (MQ=255) acataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATc < 2:133314‑M2/53‑1 (MQ=255) cataaccagaccaatgcctttctgaccatcgttcgcgccgtgcgaaaacgccacgccgatagcggaaaggatcagcgcaatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATcc > 2:585138‑M2/98‑151 (MQ=255) 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aTCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAAc > 8:540079/1‑151 (MQ=255) tAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACt > 5:881978/1‑151 (MQ=255) aaCAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACtt < 8:868685/151‑1 (MQ=255) aaCAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACtt < 8:1372040/151‑1 (MQ=255) aaCAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACtt < 6:1040114/151‑1 (MQ=255) 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aatacgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTg > 3:239442‑M2/20‑151 (MQ=255) acgcgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGt > 2:958470‑M2/17‑151 (MQ=255) cgtccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGGTTCCGGAGTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAAc > 7:716373‑M2/14‑151 (MQ=255) tccagaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAAccc > 7:1461058‑M2/12‑151 (MQ=255) agaacggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACt > 3:1117127‑M2/9‑151 (MQ=255) ccAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTg < 1:790576/151‑1 (MQ=255) cggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACt < 4:947286‑M2/147‑1 (MQ=255) ggcTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACtt < 2:890825‑M2/148‑1 (MQ=255) gATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACtt < 3:1352456/151‑1 (MQ=255) gATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGA‑TTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTtc < 8:799139/151‑1 (MQ=255) aTTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATATGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTtc > 5:477508/1‑151 (MQ=255) tAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTtctc > 5:294369/1‑151 (MQ=255) | GTATTTCTTTGCTTTTCTGTATACCTTTATACCTGTTATACCAGATCAAAAAACAAGCAATCCACATAACAAAACGCGTTTTGTTACTGATGTCACAAATTGAGCATATTTTTGTAGCTGATAGTTTGTTACAAACACCAGAACCAAGATTAATGCCGATCAGTTAAGGATCAGTTGACCGATCCAGTGGCTGTGTAAGAATCCGGAAACGCTCACTTGTTTCCGGATTTTTTTATGCACATTGGACAGGCTCTTGATCTGGTATCCCGTTACGATTCTCTGCGTAACCCACTGACTTCTC > DH1/4010140‑4010440 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |