Predicted mutation | ||||||
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JC | DH1 | 3,702,452 | (GTCATAACGACCGCCTAGGG)1→2 | coding (1442/2244 nt) | fhuA ← | ferrichrome‑iron receptor |
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? | DH1 | = 3702452 | 76 (0.140) | coding (1442/2244 nt) | fhuA | ferrichrome‑iron receptor |
Only 100 of 1071 total aligned reads displayed.
CGAAGAAGGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCGG > DH1/3702283‑3702582 | cgctatagctgaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttatgagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggg < 6:166621‑M1/1‑1 (MQ=255) ctatagctgaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcaagtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggGTc < 6:1225732‑M1/3‑1 (MQ=255) aagaagGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTc > 1:850857/1‑151 (MQ=255) aagGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCAt > 5:1972953/1‑150 (MQ=255) agctgaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggGTCATa > 7:148948‑M1/145‑150 (MQ=255) ggTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAAAACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAAc > 1:1490289/1‑151 (MQ=255) gaagtaaggtgttacaccattatcaaacaggtagttaacaccaccacgccaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggGTCATAACGa > 1:1638246‑M1/141‑150 (MQ=255) aagtaaggtgttacagcattatcaaacaggtagttaacaccaccacgcgaggtaaactgtttgtcatcacgtttatcggtcgtcccggcaacgcggttaagagattcttgatctgcccagtcataacgaccgcctagggGTCATAACGAcc > 2:1741153‑M1/140‑151 (MQ=255) 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cgaccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATc > 1:1971093‑M1/14‑151 (MQ=255) ccgcctagggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGt < 4:526606‑M1/141‑1 (MQ=255) tCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttggc < 2:748387‑M2/151‑124 (MQ=255) cccAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttggcattg < 7:1408744‑M2/151‑128 (MQ=255) gggGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCAcc > 3:1764593‑M1/4‑151 (MQ=255) ccAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttggcattg < 4:1228177‑M2/150‑128 (MQ=255) cAGTCATAACGACCGCCTAGGGgtcataacgaccgcctagggtgaccagcactttatcccactgcgcctgatcctgaacataaacgcccgtttgtttctgtttattcagaatgcggtaagggccggagtttgccggatctttggcattga < 8:29204‑M2/150‑129 (MQ=255) | CGAAGAAGGTTCAAACGATTCGCTATAGCTGAAGTAAGGTGTTACACCATTATCAAACAGGTAGTTAACACCACCACGCCAGGTAAACTGTTTGTCATCACGTTTATCGGTCGTCCCGGCAACGCGGTTAAGAGATTCTTGATCTGCCCAGTCATAACGACCGCCTAGGGTGACCAGCACTTTATCCCACTGCGCCTGATCCTGAACATAAACGCCCGTTTGTTTCTGTTTATTCAGAATGCGGTAAGGGCCGGAGTTTGCCGGATCTTTGGCATTGAAGTCGAAATCGGTATTCACCGG > DH1/3702283‑3702582 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |