| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 1355505 | 502 (0.950) | 83 (0.180) | 47/260 | 29.3 | 20.2% | noncoding (54/348 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 3099693 = | 220 (0.480) | noncoding (58/76 nt) | ECDH1_RS15360 | tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
CTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099543‑3099842 | tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGTGTCGTTCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCTTTGCTAACGCAACGTTATACTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTc < 6:1991220/150‑1 (MQ=255) tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTc < 8:1194709/150‑1 (MQ=255) gCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCg > 3:157838/1‑150 (MQ=255) cGGGATTATTCTGCCTTAATCATTCATGATGGTGGGTCGTGCAGTATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCAGTTTCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGaa < 8:1642987/151‑1 (MQ=255) ggATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACATCGTAACACCCTACGGTACGTAAATAACGCAAAGATATCATTAACTGTCTCTACAAGTACAAACATTT‑AAAATAATGGGTCGTGCAGGATTCGAAcc > 4:1192461/1‑151 (MQ=255) gATTATGCTGCCTTACTCATTGTGGTTGTTGGGCCGGCGAGGATCACTCGCCTCCTGCTCGCCCTGGGTGGATTTTCTAACTCAAGGTTATACTTAACCTTCTCTACCAGTAAGCTCCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCt < 3:1936903/151‑1 (MQ=255) aTTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTg < 6:685223/151‑1 (MQ=255) tctgctgcCTTAATCATTCAGGATGGGGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGc < 7:1834112/148‑1 (MQ=255) tATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATAGCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGGCGTGCAGGATTCGATGCTGCg > 7:905477/1‑151 (MQ=25) aTGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCgc > 1:1006807/1‑150 (MQ=255) tgctgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCTTTGCTACCGCCACGTTATGCTTCACGTTATCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCCGGATTCGAACCTGCg > 3:843024/1‑149 (MQ=25) tgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCa > 7:693410/1‑150 (MQ=255) gcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGCGCAGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATACCAGTTAGAACCTTT‑AAATAGCTCGGTCGTGCACCATTCTAACCTCCgcacaa > 1:1761868/1‑145 (MQ=18) gcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGACCTTAGGGCCGTTGCTAACGCAACTTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAAt < 3:1003018/151‑1 (MQ=255) ttAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTg > 6:1664885/1‑150 (MQ=255) ttAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATATCAGAAACCAAGATA‑AAACTGGTGCGGACTGCACCATTAGAAAATGCGACGAATTg > 1:1416410/1‑150 (MQ=17) tAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTTGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACCTGCGACCAATTGAt > 8:1005230/1‑151 (MQ=255) tAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGGTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTg < 4:683247/149‑1 (MQ=255) actcctccAGGTTGGTGGGTCGTGCTGGCTGACTCTACCTAGTCTCCCCCATCGGGGCTTTTCTAACGCTACGTTATCCCTCACGTTCTCTACCAGTTAGCACCTTT‑ACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGAt < 2:29785/143‑1 (MQ=17) atcccccaggcggggCCGTGCACGACGACTCGCCCTCGTCTCGCCCTTATTTTATTTTCTAACGCTACGTTATCCTTAACTATCTTTACCATAAAACTCTTTTAAAATTGGTGGG‑CGTTCAGTTCTCGAACCTGCGACCAATTGATTaaaa < 2:462630/139‑1 (MQ=255) aTTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGTATTTATTTAATTATTCTGGGCCTTCGGTGAGTTTCTAAATTATTTTTATGCTTCACGTTCTCTACGAGTTTCCTATTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTaaaa < 2:607969/151‑1 (MQ=9) aTTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAGCGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTAGCAGTAAGCACGTTT‑AAAATGGTGGGTCGTGCAGGCTTCGCCCCTGCGACAAAGAGATTaaa > 5:1928485/1‑150 (MQ=21) tCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAg < 7:1179982/150‑1 (MQ=255) cAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGt < 3:1864475/150‑1 (MQ=255) tggtggGTCGTGCAGGATGACTCGAGTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGGTACGGCAAGGTTATGCTTCACGTTCTCTACCAGTAAGCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGGTTCGACCGTGCGCCCTCTTGATTTAACGTGAGCTg > 5:867500/1‑151 (MQ=18) tggtggGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTTCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTTGTGGGTCGTGCACGGTTCGAACCGGCGCGCCATTGTTTAAAAATAAACTg > 7:63879/1‑151 (MQ=18) ggtggGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGGTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTg < 3:688120/150‑1 (MQ=255) tggGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTGGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGgtc > 5:1802059/1‑151 (MQ=255) tggGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGctc > 5:150633/1‑151 (MQ=255) tggGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGGTATCGAGCAGTGACCACCGTA‑AAAGTCGTGGGTCCTCAAGGATGCGAAACTGAGAGCTAGTGATTACAAGTCAACTGct > 1:1544779/1‑150 (MQ=17) ggATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTGATTAAAAGTCGACTGCTCTCCCCACTg > 1:1090844/1‑149 (MQ=255) ggATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTg > 6:949357/1‑149 (MQ=255) gACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCGTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCGCAATTGATTAAAAGTCAACTGCGCTACCAACTGAGCTa > 5:960610/1‑150 (MQ=255) cTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGGTCTCTACCAGTAACCCCCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAAGTGATTAAAAGGCCACTGCTCTACCAACTGAGCTAACg > 1:1973509/1‑151 (MQ=18) gACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcc > 5:577212/1‑151 (MQ=255) gACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCCACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcc > 5:679171/1‑151 (MQ=255) ttCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATAACAGTAAAAAACTTT‑AAATTGGTGGGTCCTGCAGGATTCGAACCTGCGAAAAATTTATTAAAAGTCAACTGCTGAACCATATGAGGTAActaaaca > 2:1342337/1‑144 (MQ=17) tCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAt < 4:1129448/150‑1 (MQ=255) 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tt‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGc < 4:95286/59‑1 (MQ=35) acaTTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATAc < 6:926608/82‑1 (MQ=17) aaaTTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTATTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGATGGGTCGTGCAGGATGACtc > 4:1011423/1‑151 (MQ=255) ttttattgtttcggtcAGGATTCTAACCTTCGTACATTTTAATAATATTCAACTGCTCTACCATCTGAGGTAAATACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGTTTTTTACTCGGGGATAATCTTTAAGTTTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtc < 8:148646/135‑1 (MQ=255) caTTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATTCGGGTGTTAACGGGACGTATTTTTGTCGGGGCGAGGCTGTAGGAGTGGTGGGTGGTGGAgtggggcagt > 5:538522/2‑142 (MQ=2) accagctgcgTCGTGCAGGCTTCGATCTTGGTTTCAATTTATTTAACGTCAACTGCTCTCCCTACTGAGCCACCTTAGCATACGTGTGTTACCGCAATGATTTTTATTCTGGGACAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcg < 3:1191105/142‑1 (MQ=255) aaTTGGTGGGGCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCa < 4:467815/141‑1 (MQ=255) tggtggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCGTACGGGTGGTGCATGAGAGATGGTTCCTCCGGCCCACTCGTTATGATTGGGGTGGGGTGCAGGCTGACtgcct > 3:1339248/1‑146 (MQ=9) tggtggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAAAAGGGTGGTCAGTGAAAGATAGAACCTCCGGCCCAATCGTTTATAGGGATGGGTAGTGAAGGATGTCttgctt > 2:1046480/1‑151 (MQ=2) ggtgtGTCGTTCAGGATTCGAACCTGCTTCCAATTGTTTATTATTAAATTGTTCTTCCAACTTAGCTAACTACACATATGTTTGTTATCTGATAGTTTTTTACTCGGGTCCTATCTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgcttc < 6:1526913/151‑1 (MQ=16) ggtggtttgttcattaTTCTAACCTGCGACCAATTTATTAAAATTCAACTTCTCTACCAACTGAGCTACCGTCCCATACGTGTGTTACCTGAAATATTTTTACTCGGGGGCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgcttc < 4:1749639/136‑1 (MQ=25) gtggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAAt < 4:807989/113‑1 (MQ=255) gtggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCttt < 1:562571/117‑1 (MQ=255) gggggTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAATTTTTTTTTTATTCATACTGAGATAACGTACAATAAGTGTTTTATTTTAAATATTTTTATTCTGGTCGATTTTTTTATATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgcttcg < 6:867054/149‑1 (MQ=9) tggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTATAATTCATCTGGTCTTTCAACTTAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACGTGATAGATTTTTACTCGGGGGGAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgcttcg < 3:2043317/150‑1 (MQ=25) gggTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCAAAGGTGGTTTAATGCAAGATATTTACTCCGCCCCCATCATTAAAATTGGTCGGTAGTGCAGGATGAAtcgaatccct > 8:426538/1‑144 (MQ=9) gTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGccc > 5:105681/1‑151 (MQ=255) gTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACCGGTGTTACCTGAAAGATTTGTACGAGGGGCCAATCTGTAAGATtggt > 1:293262/1‑119 (MQ=18) ggCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTATACCAACTGATCTAACGACGCATACGGGTGTTACCTGAACGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCt < 3:450821/150‑1 (MQ=255) gCAGGATTCGAACCTGCTACCAATTGAGTAAAACGCAACTGCTCTACCCACTGAGCTCACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAACATTTTTACTCTGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTa < 1:848935/151‑1 (MQ=37) gCAGGATGCGAACCTGCGACCAATTGACAAAACGTCAAGTGGTCTACCAACCTACCTAACGACCCATACGGTTGTTACCTGAACTCTTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTa < 3:1774816/151‑1 (MQ=37) ggATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTa < 6:1262758/89‑1 (MQ=255) tCGAACCAGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTAAGATCTTACCTAACGACCCATACTGGTGTTACGTTAAATATTTTTCGTGGTGACAAATGTTTAATTTTGTTGTGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGcc < 5:565135/150‑1 (MQ=19) | CTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTT‑AAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099543‑3099842 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |