| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | DH1 | = 3099542 | NA (NA) | noncoding (268/268 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
CTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGG > DH1/3099392‑3099690 | accctggggcATGTTCGATTCTTTGAGTATAGGATATAGCAAAACTGCTCATTTAGGGAGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccatac < 1:289527/143‑5 (MQ=11) aaCCTGCTGCAGGTTCTAATATTTTACTATCGAATATATCAAAAAAGCTCTTTTTTGGTGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTg < 4:1140860/151‑1 (MQ=11) ccTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCg > 5:81388/1‑151 (MQ=35) ccTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCg > 7:394379/1‑151 (MQ=35) gtgctgcTGGTTCGAATCTTTGTGTAGCGCTTATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGGGCAGCATTCCAACCTGCGACCAATTTATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACCACCCCTTGCgg < 6:606954/150‑1 (MQ=11) gctgctGGTTCGATTGTTTGAGTATAGGAGATCGCAAAACTTCGCGATTAGGGCGCTTTTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccatacgggt < 1:1899945/150‑9 (MQ=11) gctgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCggg < 4:1996987/150‑1 (MQ=38) gctgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCggg < 8:1337985/150‑1 (MQ=38) gcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGAtt < 2:1168579/150‑1 (MQ=40) gcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGAt < 3:1209782/149‑1 (MQ=39) cAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTCATTAAAAGTCAACTCCTCTACCAACTGACCTAACGACCCCtacgggggtta > 3:98040/1‑140 (MQ=11) cAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTAt < 3:101381/151‑1 (MQ=40) aGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccataccggtgttaac > 7:838030/1‑137 (MQ=255) ttCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATTCCggtgttacctgg > 5:1360975/1‑141 (MQ=255) tCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGGCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTAtgctg < 1:2012179/150‑1 (MQ=255) ggAATCTTTTAGTATCGGATATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGTTAGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccat < 6:1751004/133‑3 (MQ=11) cGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTAtgctgc < 1:58817/150‑1 (MQ=255) cGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGcc < 4:690687/151‑1 (MQ=255) 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aaaaaGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTg < 3:2001636/151‑1 (MQ=255) aaaTCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCa < 4:280012/151‑1 (MQ=255) ttAGTGCGCTTTTTTACATTGGTGGGGCGTGCAGGAGTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTTCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACt < 5:699452/150‑1 (MQ=255) ttAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACt < 3:1970843/150‑1 (MQ=255) aGGGCGCTTTTTTACATTGTTGGTTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTTATTAAAAGTCAACTGCTCTACCATCTTAGCTAACGACCCCTTTAGGGATTATGCTGCGTTTCTCATTTAGTATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCg < 4:939460/150‑1 (MQ=18) 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ttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGtct < 5:1576074/150‑1 (MQ=255) tggtggGTCGTGCATGATTCGAACCTGCGACCAATTCATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGCATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTc < 7:52285/150‑1 (MQ=255) ggtggGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCg < 6:2020363/150‑1 (MQ=255) ggttggggCAGGCTTCGATCTTGCGACATATTGATTAAATGTCATCTTCGGACGCAATTGAGCTATCGACCAGTTCATCTATTATGCTGCGTTTATGTTTTAGTATGGTGGGGCGTGCAGGATGAGTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGcc < 4:459801/144‑1 (MQ=9) gTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGt < 5:1942233/151‑1 (MQ=255) 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tGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggtg > 1:1141340/1‑151 (MQ=255) tGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggtg > 5:619854/1‑151 (MQ=255) gAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggtg < 2:957048/150‑1 (MQ=255) aGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTggg > 8:914505/1‑151 (MQ=255) aGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCATTCACGTTATCTACCAGTAACAACCTTTAAATTGGTggg > 2:1653615/1‑151 (MQ=255) gCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCGTTAAATtggttggt > 3:868760/1‑151 (MQ=255) gaaCGACCCCTTGCTGCATTATGCTGCCTTTCTCATTCAGTATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCg < 5:899233/150‑1 (MQ=255) aaCGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAATACCTCTCGCAATTCGCGCCTTTAAAAAATCAACGTAATCATTCACAATATATAAAAGTAAACACATTAAAAATGTTGGGTCGt > 6:3685/1‑151 (MQ=255) ccGACCCCTTCCTTGATTATGCTGCCTTTATCTTTCAGTTTTGTGTGTCGTGCAGGTTAACTCGACTTCGTGTCGCCCTTCGGGCGGTTGCTATCGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTg < 6:1348649/150‑1 (MQ=25) caCCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCa < 8:2076933/150‑1 (MQ=255) aCCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCCCGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGc > 1:365073/1‑149 (MQ=255) ccccTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAgg < 7:1633890/151‑1 (MQ=255) | CTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGG > DH1/3099392‑3099690 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |