| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 1355966 = | 187 (0.440) | 207 (0.500) +CTTC |
55/292 | 25.9 | 53.2% | noncoding (76/76 nt) | ECDH1_RS06685 | tRNA‑Val |
| ? | DH1 | = 3099542 | NA (NA) | noncoding (268/268 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
ACGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < DH1/1356115‑1355966‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTT < DH1/3099542‑3099436 ||||| CGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑C > 8:1340812/1‑150 AACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑Cgt > 5:1664519/1‑148 GAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGtg > 8:286708/1‑149 AACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑Cgtactct > 3:444334/1‑144 CAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑Cgtactcgcc > 3:707127/1‑142 gttccgacctggaGTTGACTGATTTTTAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACGTCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCT < 1:1604185/138‑1 CTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTAGGGTAGTT > 6:34919/1‑147 CTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTACTGTCGTTAGa > 6:1213185/1‑149 agatatTGCGTTTAGGCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGAGTCGATCCGGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGT < 3:103973/145‑1 AAAATGCGTTGAATCATATAGAACTCTCCCTATAAACCGACTCCACCCCCCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTT < 3:1549613/150‑1 AAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCTCCCAACAGCTTCGTGTAGTagaatacgggg > 4:1555007/1‑140 ATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTAGGGTCGTTAGCTAAGTTGGTt > 7:1045111/1‑150 TGCGTTGACTGATTTTTAACTTTCAGTATAATGCGAGTCCACCCGCCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTG < 3:353051/147‑1 TGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCCTGTCGTTAGat > 2:1607203/1‑139 TGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTACGGTCGTTAGaaaagtag > 4:353495/1‑139 cCGTTGACTCATTTTGAACTCTCGCTATAATGCGACTCCACACCGCGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGA < 5:1560761/150‑1 CTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGTGTCGTTAGATCAGTTGGTTGAGCAGTTt > 1:1154468/1‑150 CTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGATAAGTTGGTAGAACAacgg > 1:422332/1‑147 TCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CATAGTTTCGTTAGATAACTAGGTAGAGCAGgtt > 8:803049/1‑147 CATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACCCAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGT < 5:678752/135‑1 gcttcagatcttcgCTATAATGCGTGTACACCCAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACT < 3:1304452/137‑1 TTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTACACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTT < 5:1214776/150‑1 TTTGAACTATCCCTTTAATGCGAGTCCACACCGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTT < 5:35012/150‑1 AACTATCCCTATAATGCGACTACTAACTTAGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAAT < 2:829641/151‑1 ccgttcttttTAATGCGAGTCCTCACTTCGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAAT < 2:36460/140‑1 CTCTCCCTATAATGCGACTCCACACCGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAG < 6:453090/120‑1 ccgagtTAAAGCGACTCCACCCCTCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT < 7:3724/144‑1 CCCTATAAAGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCA < 8:1044609/147‑1 tTAATGCGACTACACACAGAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGT < 4:1238796/148‑1 ATAAAGCGAGTCCTCCCACCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTC < 6:51801/150‑1 aaaGCGACTCCACCCAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGC < 5:1446253/147‑1 AATGCGACTCCTCACGGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCA < 3:146197/151‑1 catatcgCAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGA < 7:1616740/144‑1 CTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTAGGGTCGTTAGCAAAGTTGG > 5:78838/1‑112 ccacccttaGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAA < 2:1069221/141‑1 aactGCGGTGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGTGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCT < 2:490758/147‑1 CACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATC < 1:357519/149‑1 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gggtaggcAGAGCTCCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAA < 3:194648/143‑1 CAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAA < 6:633427/151‑1 CAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAA < 7:1062068/151‑1 CAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAA < 1:573767/150‑1 CAGCGGGGACCGCACCTCCCTTACACGGCGGGGGTCGTCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTA < 1:747158/149‑1 GCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAA < 6:682850/151‑1 GCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTC < 3:1405884/79‑1 GCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCCGGTCGTTAGCTC > 4:1406614/1‑79 CTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAA > 1:493721/1‑150 CTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAA > 8:848034/1‑150 CTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAA > 4:787180/1‑150 CTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAA > 1:881318/1‑150 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CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATGACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCGTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGC < 4:1342315/150‑1 CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCCATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGG < 1:1459649/149‑1 CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCG > 4:157745/1‑151 CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGC < 8:554920/150‑1 CCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGC < 6:729997/150‑1 CCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGC > 1:1290059/1‑151 CCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGC < 5:159475/151‑1 TACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTT > 5:1375093/1‑151 TACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCT < 5:11881/149‑1 TACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCT < 6:1453271/149‑1 TACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGACATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCT < 6:1657575/149‑1 ACACGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTT < 3:1086581/150‑1 CAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑C‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAA > 6:998258/1‑129 CAACGAGGGGCTCCGCGGTTCGATCGCGTCATGACCCACCA‑C‑ACGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAA < 5:999447/129‑1 AAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑CTTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTT < 4:220356/151‑1 agCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAT < 5:433262/44‑1 CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAA > 2:124699/1‑60 ||||| ACGAACGAACAATTTCTTTAGAAAATGCGTTGACTCATTTTGAACTCTCCCTATAATGCGACTCCACACAGCGGGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < DH1/1356115‑1355966‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATGTAAAAAAGCGCCCTAAAGGCGCTTTTTT < DH1/3099542‑3099436 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |