New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 1355505 | 385 (0.910) | 58 (0.160) | 32/260 | 33.0 | 18.3% | noncoding (54/348 nt) | repeat_region | repeat region |
? | DH1 | 3099693 = | 184 (0.500) | noncoding (58/76 nt) | ECDH1_RS15360 | tRNA‑Lys | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
TTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099544‑3099842 | ttGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTc > 3:918637/1‑151 (MQ=255) tccGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGCTGGGGGGTCGTGCAGGATGACTCGACGTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt < 4:45162/147‑1 (MQ=255) tGCGGGATTATGCTGGCTTTCTCATTCAGGTGGGTGGGTCGTGCAGGATGACGCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt < 6:1588785/149‑1 (MQ=25) tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGTGTCGTGCAGGATTCg > 1:1503433/1‑151 (MQ=255) gCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACCCAGCGTTATCCATCACGTGCTCTACCCGTAACCCCCTGTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCg > 5:798269/1‑150 (MQ=25) ccgggcttcggatgcCTTCATCATTCAGGTTGTGGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTCCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCg < 5:391172/138‑1 (MQ=21) gggATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAAc > 8:37284/1‑151 (MQ=255) ggATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAAcc > 7:512717/1‑151 (MQ=255) gATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCATTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCt > 3:305464/1‑151 (MQ=255) ttATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTGAGTACCAGTGAGCAGCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGTACCTGc > 6:498299/1‑151 (MQ=25) cgtgttgctttctaaTTGAGGCTGGTGGTTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGATAACGCAACGTTATCCTTCACCTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCg < 1:117964/136‑1 (MQ=18) attctccgttAATGATGCAGGATGGTGGGGCGTGAAGGATGAGGAGACTTCGCCTGGCCCTTCGGGACGTTTCTAACGAAACGTTATCCTTAACGTGCTCTACCAGTAAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCg < 7:1102037/142‑1 (MQ=21) aTGCTGCCTTAATCATTCCGGATGGTGGGGCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCTTTTCTAACTCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGa < 4:808123/151‑1 (MQ=25) aTGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCATTCGGGCCGTTGCTACCGCAACGTTATCCTTCACGTTAAAAACCAGAAAAAAAATTTAAATAGGTGGGGGGTGCCGGGTTGGagcgggcg > 6:897309/1‑143 (MQ=12) aTGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAATTCGTCTCGCCCATCGCCCATTTGCTAACGCAAAGTTATCCTTCACTTTAAATAACAGTTTCAACATTTAAAATCGTGTGACCTGCTGGATTCGAAACAGCgt > 8:1296347/1‑150 (MQ=12) tgctgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATTACTAGCCTTCGTCTCGCCATTCGGGACGTTTCTAAAGAACCGTTATCCTTCGCGTTCTAGAGCAGTAAAAAAATTTAAATTGGTGGGTCGTGCCGGGttgggcgctgcgcc > 1:955231/1‑139 (MQ=255) gctgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTATACCAGTAACAACATTTAAATTGGTGGGTAGTGAAGGATTCGAACATGCGAcc > 6:1293655/1‑151 (MQ=21) gcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATCTACCAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGACCCTGCGACCAAt > 3:807900/1‑151 (MQ=255) gcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCAGTTGCTAACGCAACGTTATAATTCACGTTCAATAACAGTAACAACATTTAAATAGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGAGACCaa > 6:739232/1‑150 (MQ=21) ccTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAAtt < 8:76160/151‑1 (MQ=255) cTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGCGCCGTTGCTAACTCAACGTTATCCTTAACGATATATAACAGTAACAAAATTTAAATATGTAGGTCGTGAAGAATTAAAAACTGAGACCAAttt > 2:921740/1‑150 (MQ=16) cTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAATGCCTCTCCCAAATCAGAACGTAACAAACTCAACGTTATAATTAAGGTTCACGAAAAGTAACCACAGTTAAATTGCTGGATCATTAAAAAATAGAACCGGCGCCCAATTg > 2:511734/1‑151 (MQ=255) ttAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCCCGTTAGCTAGCAGTATGCACGTTTAAATTGGTGGGTCCTGCATGATTACAACCTGCCACCAAtttt > 7:456239/1‑149 (MQ=21) ttAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCATCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAAAGTTATACTTCACGTTATATAGCAGTAACAAAATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAAGAGGCGACCAGTTgt > 2:1498841/1‑150 (MQ=18) tAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAGTAAGAAACGAACTTCGTCCAGTTGCTAAAGAAACGTTATCAATCACGTTCTCTACCAGTAACCACCATTAAATTAAAAAATCGTGCAGGATTCGAACCTGCGGCGAATTGAt > 2:785431/1‑151 (MQ=255) tAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACCTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGa < 1:606838/150‑1 (MQ=255) tgaGGCTGGGGGGTCGTGCAGGAGGACTCGACTTCGGCTCGCCCTTGGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTGCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAg < 7:1435142/148‑1 (MQ=18) cAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCGACACGTTAACTACCAGTAACCACCTATAAATTGGTGGGGCGTGCAGGATTCGAAAATGCGACCAATTGATGaaacggg > 7:816797/1‑147 (MQ=18) cAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCCTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCAGCTGCTCAGCCAGTACGCAACTTAAAATTTGTGGCTCGTTGAGGATAGCACGGTGCGCCCAATAGATTaaaaaa > 4:837547/1‑148 (MQ=9) cAGGATGGGGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTGGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGt < 7:372454/150‑1 (MQ=255) aGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAAATGagggaacgtcc > 1:1426189/1‑141 (MQ=255) aTGGAGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACt < 1:557433/151‑1 (MQ=255) ggtgggtgGTTCAGGATGACTCGAGCTCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTCACGAAACGTTATACTTAAAGTGCTCTACCAGTCAGCTCATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGc < 7:279253/151‑1 (MQ=17) gtggGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGct > 8:151634/1‑151 (MQ=255) cGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTAcc < 1:1083502/150‑1 (MQ=255) cAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGGTATATAACACTAACCACCTGTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGAGAACAATTGATTAAAAGTaaaattataaaaaaactg > 8:1025366/1‑136 (MQ=17) ggATGACTGGAGTTGGTCGCTCCGTTCTTGCAGTTTCTAACGAAACGTTATAGTTAACTTTCTCTACGAGTTAGCATTTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGa < 5:761644/150‑1 (MQ=9) aTGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTCCCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTGGCACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCGGTACCAACTGatgg > 7:1538620/1‑148 (MQ=18) cccggACTTCGGCTCGCCCTGCGGGCGGTTGCTAAGGAAAGGTTTTCCTTCAGGTTATCATCCCCTAACGATCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAAc < 1:1045823/147‑1 (MQ=17) aCTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAAc > 4:969729/1‑151 (MQ=255) cTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACg > 5:217232/1‑151 (MQ=255) gACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcc > 3:631032/1‑151 (MQ=255) aCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGATATCAAGCAGTGAGAGCGGTTAAATAGCTCGGACGTGCATGATTGGAGCCTGCGAGCAAGGGATTAAAAGTGAACTCCTGTAACACCTGatcaaaagaaac > 6:810036/1‑140 (MQ=9) 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ccTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTACAGTGGTATACCAAAAGACGTAACTACCCTTAcctgtctgt > 1:379551/1‑143 (MQ=18) ccGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGaa > 2:340906/1‑149 (MQ=255) gCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGAttt < 1:340525/150‑1 (MQ=255) tAACGCAACGTTATCCTTCACGTTGTAGACCAGTAAAAACATTTAAATTTGTGGGTAGTGCAGGAATCGACCCTGCGCACAATTGAATAAAAGTCAACTGATCTACAAACTGAGCTAACGACCCAAACGGTTGATAAATGAAAGAttttt > 4:1278141/1‑150 (MQ=16) tAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGAtttttt > 7:83021/1‑150 (MQ=255) aaCGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGAGAGCAGATGAGGAAAAGTCTGCAGGGCACGCAACTGAGCTAAGGACCAATACCGTGTTTACCTGCAACAATTATAc > 1:712569/1‑151 (MQ=16) gCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTCGGGGGGTTACCGGaagcacataacggcg > 3:213565/1‑138 (MQ=18) gCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCg > 5:501441/1‑151 (MQ=255) cAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAAAGGGGGGTTACCTGAAAGATATATCCTCgg > 4:547203/1‑151 (MQ=21) cAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCAAAAAATAAAATAAAAGTCAACTGAAATACAAACACAGAAAAAGAAAAATACGGTTGTTACCTGAAAAAtttaaaaaa > 2:1261987/1‑143 (MQ=16) cAACGTTATCCTTCACGATGTAGAACAGTAAAAAAATTTAAATTTGTAGGTCGTGAAGGATTCGAACATGCGAACAATTGAGTAAAATTAAAATGATCTACCAAATGAGCTAACAAAAAAAAAGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCgg > 2:201176/1‑151 (MQ=255) aaCGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGCTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAACTCAACTGCTCAACCAACTGAGCTAACGACCCAAAAGGAAGTTAAATAAAAGAtaaaaactccg > 4:254227/1‑140 (MQ=18) tATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGCACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCa > 5:995798/1‑150 (MQ=255) aTCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAAt < 7:972104/151‑1 (MQ=255) ttCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACAAATTGATTAAAACTCAAATGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCttt > 2:1089903/1‑151 (MQ=255) taaacttCTCTATTAGTTAGCTCTTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAACAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCttt < 4:406172/145‑1 (MQ=18) aCGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCTAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAg < 4:591108/151‑1 (MQ=255) cGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGa < 6:312902/151‑1 (MQ=255) tctcTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGa > 1:464852/1‑118 (MQ=255) tctcTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGa < 2:465769/118‑1 (MQ=255) tctACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACCTGCGACCAATTGAATAAAAGTCAACTGCTCTACAAACTGATCTAACGACCCCTAAGGGTGTTAATTCAATGATAGAAACTCCGGACCAATCATTAAAATtggt > 4:1522655/1‑151 (MQ=255) acccctAACCACCGTTAACGAGCTGGGTCCTGCAGCATGCCTACCTGAGATCACTTCATTACAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTggg < 5:369402/146‑1 (MQ=21) ttagttagcttttttAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACGAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTggg < 8:642504/138‑1 (MQ=255) cgcggcacctccTTTCAATTGGTGGGGCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGt < 7:746283/145‑1 (MQ=255) aaggtcgcttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGCCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTc < 7:1616015/140‑1 (MQ=18) gggcgcttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACCGGTGTTACCGGAAAGATTTTTAAGCGGGGCCAATCTTTAAGAGTGGTGGGTCGt > 3:1529814/10‑151 (MQ=17) ctAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccgagtggtgg < 7:505123/100‑10 (MQ=255) aaCCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAACAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGc > 6:1622433/1‑151 (MQ=255) cgctccTTTACATTGGTGGCTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCa < 3:1037294/147‑1 (MQ=255) ttttACATTGGTGGGTCGTGCAGTATTCGAACCTTCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGAt < 6:1212478/149‑1 (MQ=255) tttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCTAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCTTACGGGTGTTACCTGAAATATTTTTACTCGTGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATg < 4:1552900/150‑1 (MQ=255) ttAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTa < 3:442964/75‑1 (MQ=33) tacagtggtggGTCGTGCAGGATTCGCACCTGCGACCAATTGATTAACAGTCACCTGCGTTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGAc < 7:1316239/145‑1 (MQ=25) acaTTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGtt < 2:822917/89‑1 (MQ=255) aaaTTGGTGGGTCGTCCAGGAGTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtc < 7:54757/151‑1 (MQ=255) tttctgatctgTGCAGGATTCTAAGCTGCTACAAATTGATTAAAATTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgc < 6:390167/140‑1 (MQ=37) ggttgGTGGTGCAGGATTCGATCGTGCGAGCTTTTGATTAAATGTCAACTGCTCTACCATCTTAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAATATTTTTACTCTGGGGCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgctt < 4:1039007/150‑1 (MQ=25) ggtggGTCGTTCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAACTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAACATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgctt < 1:1100454/150‑1 (MQ=255) ggggggTCGTGCACGAGTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAACTCAACTGCTCTACCCTCTTCGCTAAAGACCCATACGGGGGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgctt < 5:94463/147‑1 (MQ=37) ggcgggTCGGGCAGGACTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAATGAACCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAGCATTACTGTTGTTACCTGAACTATTTTTACTCGCGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgcttc < 1:784826/148‑1 (MQ=21) gcgatctgTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTTATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgcttcg < 4:1127030/144‑1 (MQ=255) ggTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTCAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTAGGCGCGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTtcgctc < 7:1161497/151‑1 (MQ=255) gTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGTGTCGTGCAGGATGACTCGAGTCCCTCTccc > 7:616159/1‑151 (MQ=255) ggCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACAGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAACATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCt < 5:1152753/150‑1 (MQ=255) cAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACggg > 3:1075478/1‑71 (MQ=38) aggcgtCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAACTCAACTGCTCTACCAACTTAGCTAACGACACATACGGTTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGCGGCCACTCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACg < 1:1204936/146‑1 (MQ=37) aGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACg > 5:1332754/1‑151 (MQ=255) aGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACg > 7:905006/1‑151 (MQ=255) gATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTtcgctc < 8:791116/141‑1 (MQ=255) aTTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAAGATCGCAACAGACTCGTCTAACGAAACATAGGGGATGTAACTGTAAGAGTATTTCTCGGGGCGATGCTTTAAAAAAGGTGGGTCGTGCGGGGTGGCTCGGTGCGCTCGccggcggggg > 2:799068/1‑143 (MQ=255) ttCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCggg < 4:1408207/92‑1 (MQ=255) atCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTACACTGCTGTACACACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAACGCTTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGcc < 7:408057/150‑1 (MQ=38) | TTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTACGGGCC > DH1/3099544‑3099842 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |