| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | DH1 | 936,278 | 1 | . | T | 30.6% | 166.6 / 117.0 | 72 | intergenic (‑12/+22) | ECDH1_RS04620/ECDH1_RS04625 | tRNA‑Met/tRNA‑Met |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (49/1); new base T (20/2); total (69/3) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.81e-04 | |||||||||||
CGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTT > DH1/936161‑936427 | cGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCggggg > 8:658436/1‑151 (MQ=255) aCTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGAGTAGTCG‑ATT‑AATTCATCAAATTTTATTTGATTGCgggggact > 7:633709/1‑148 (MQ=17) aaTTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCCGGAGTGC‑GTG‑ACTTCAGCGAAATTTAATTGCTTGCGCGGGACGGAttgcaccagccgcgat > 5:471283/1‑137 (MQ=14) gCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGACcgacc > 7:366273/1‑150 (MQ=255) gacgacCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCAGTACTGC‑GTT‑AATTCATCAAAATTTATTTGCTTCCGGGGGAATTATTTGAACCTAAGACCTTAGGGTTATGAGACCTCCGAGCAAACACgcta > 6:1038263/1‑149 (MQ=2) ccTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCCGTAGTCC‑GTG‑ACTACATCCAAGTATAATTCGTTGCGCGGGGCGTATTTGACCCGACGCCATTCGGCTTCATATACCGACGAGAAACCAGgctgcagccc > 5:840436/1‑146 (MQ=2) tACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACGGTAGTGG‑GTT‑ACTTCAGCAAAGTTTAATTGGTTGCGGGGGAGGTTTTGGACCCGACCCCCTTCGGCTTCTGATGCAGACGAGCGACCAGGCTGCTCCCCCCAGCGTCCGGCGATggtccctatt > 5:60137/1‑142 (MQ=9) tACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGGACtat > 7:364011/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGAAGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATAc > 3:235142/1‑151 (MQ=255) aGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TGT‑ACTTCATCAAATTTTAATTCGTTGCGGGGGCCGGATTTGACCCGACGACATTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCAGCGTCCGTGGATGCGCACAATACTcc > 7:644580/1‑151 (MQ=17) ctgctCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGcg > 5:1633559/1‑150 (MQ=255) tgctCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGAAGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTc > 5:1311707/1‑151 (MQ=255) gctCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcg > 7:1473487/1‑151 (MQ=255) ctCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGAAGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcgc > 5:96182/1‑151 (MQ=255) tCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcgcg > 7:1590151/1‑151 (MQ=255) cACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGtt > 3:1300698/1‑151 (MQ=255) cACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGtt > 5:206465/1‑151 (MQ=255) aCCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGttt > 7:847016/1‑151 (MQ=255) ccccGCGTCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGCCGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGCGTCCGTGGATGCGGACTATACTCCGCTCGCGtttt > 1:614642/1‑151 (MQ=14) ccccGCGTCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGACCTACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCTGGAGGCCCACAATACAccccacgttattt > 5:1508124/1‑140 (MQ=11) ccccGCGTCACCGTACTGCTTTT‑ACTTAATCAAATTTT‑ATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACAATTCTACGCTCGAGtatt > 6:697045/1‑151 (MQ=11) cgcttcggatcttACTGCTTTT‑ACTTCTTCAAATTTT‑ATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTc < 4:1186949/139‑1 (MQ=17) cccGCGTCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCTGGAATCGCACTATACAGCGCTCGAGTTTTc > 6:179788/1‑151 (MQ=11) cccGCGTCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACAGGAAGCGCACTATACTACCCTCGAGTATTc > 2:1372212/1‑151 (MQ=11) cccGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTc > 4:1281808/1‑151 (MQ=255) cccGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGAACTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCACCACCCCGCGTACGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGtttt > 7:905831/1‑150 (MQ=255) ccGCGTCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCGGGAGGCGCACTATACTCCGATCGCGTTTTcc > 2:204136/1‑150 (MQ=11) ccGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTc > 3:1441673/1‑150 (MQ=255) cgcgTCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCAGAATACTACGCTCTCGTTTTcgt > 7:434320/1‑149 (MQ=11) cgcgTCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGGGGATTCGCACTATACTACGCTCTCTttttgct > 1:1380086/1‑148 (MQ=11) cgcgTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCAt > 2:714551/1‑151 (MQ=255) cgcgTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCAt > 2:637444/1‑151 (MQ=255) gcgTCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGGGCAATATACTCCGCTCGAGTTTTCATg > 7:1139034/1‑151 (MQ=14) gcgTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATg > 5:276886/1‑151 (MQ=255) cgTCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGAGGAATCGAACTATACTACGATCTAGTTTTCATGc > 8:1663057/1‑151 (MQ=11) cgTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTAGCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGc > 3:625291/1‑151 (MQ=255) gTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGc > 4:716017/1‑150 (MQ=255) gTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGc > 5:1311714/1‑150 (MQ=255) gTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTACCGTTTTCATGc > 2:321941/1‑150 (MQ=255) tCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGAGTCGCACTATACTGCGATGTGGTTttcattca > 2:937882/1‑150 (MQ=1) tCACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGGGGATGCGCACTATACTCCCATAGGGTTTTCATGCa > 4:1207925/1‑150 (MQ=11) tCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGCCGCGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGGTTTCATGCa > 2:506533/1‑150 (MQ=255) tCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCa > 2:1118455/1‑150 (MQ=255) cACCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGCGTCCGTGGATGGGCTCTATACTACCCTGTAGTTTTCGTGCagc > 7:1022640/1‑149 (MQ=1) cACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAAc > 7:215177/1‑151 (MQ=255) aCCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCAATATACTCCGCTAGCGtt > 6:1008770/1‑140 (MQ=11) aCCGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCGGGATTCGGACAATACTCCTCTAGGTTTTTCATGCAAcc > 1:993628/1‑151 (MQ=1) aCCGTACTGCTTTT‑ACTTCAT‑AAATTTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGtt < 5:1009962/140‑1 (MQ=255) aCCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCTGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAAc > 8:226888/1‑150 (MQ=255) aCCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAAcc > 5:633997/1‑151 (MQ=255) ccGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCGGGATGCGCAATATACTACACTCGATTTTTCATTCAACCt > 6:1412341/1‑151 (MQ=11) ccGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCt > 3:919287/1‑151 (MQ=255) ccGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCt > 7:1097196/1‑151 (MQ=255) cGTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGATCGCGTTTTCATGCAcccgt > 1:1145798/1‑149 (MQ=14) cGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtt > 1:1581421/1‑151 (MQ=255) cGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtt > 2:351081/1‑151 (MQ=255) gTACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGCGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGCGGCCGGGGATGGGCAGTATTCTGCGCTGGCGttttgctggcgggggg > 6:185447/1‑139 (MQ=11) gTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCttt > 5:1444523/1‑151 (MQ=255) gTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCttt > 8:442903/1‑151 (MQ=255) tACTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTc > 3:1186618/1‑139 (MQ=255) tACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGAGTTTTCATGCAACCtttt > 4:353285/1‑151 (MQ=255) aCTGCTTTT‑ACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGAGGCGCAGTATACTACGAACTAGTTTTCATTCACCCtgttt > 3:588124/1‑151 (MQ=11) aCTGC‑TTTAACTTCAT‑AAATTTTTATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCttttt < 2:994712/151‑1 (MQ=255) cTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttt > 6:1598969/1‑151 (MQ=255) cTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttt > 3:393230/1‑151 (MQ=255) cTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttt > 8:1102104/1‑151 (MQ=255) cTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttt > 7:1213193/1‑151 (MQ=255) tGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCttttttt > 2:486850/1‑151 (MQ=255) tGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATAATCCGCTCGAGTTTTCATGCAACCttatttt > 6:1355976/1‑151 (MQ=255) tGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCAGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATCCAACCttttttt > 7:478193/1‑151 (MQ=255) gC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 3:1014663/1‑151 (MQ=255) gC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 5:553081/1‑151 (MQ=255) c‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 7:986292/1‑150 (MQ=255) c‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 6:765379/1‑150 (MQ=255) c‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGATACCAGGCTGCTCCCCCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGGTTTCATGCAACCtttttttt > 8:1453052/1‑150 (MQ=255) | CGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTT > DH1/936161‑936427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |