Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | DH1 | 3,906,832 | 0 | C | A | 31.3% | 137.2 / 11.9 | 98 | intergenic (+3/‑32) | ECDH1_RS19315/ECDH1_RS19320 | tRNA‑Leu/tRNA‑Leu |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/24); new base A (26/0); total (73/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.83e-05 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCT > DH1/3906689‑3906981 | gcgcgccacgccccccccTCCCACCTAAAACCACTTTTAAATTGCTGCGAGTTTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGa < 1:1126881/141‑1 (MQ=14) cccgccaacgcccgccccTCGCACCAACAACTCCTTTTTAATTCCTGTCCGTGGGCGAAGGTGGCGTAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGGCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGa < 5:1183044/141‑1 (MQ=2) gcgcccattCCCCCCCCGCGCTCCAAAAAACACTTTGAAATTGATCCCCGTCGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTGCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGat < 3:1564092/143‑1 (MQ=17) gcAAGGCCCCCCCCTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGGTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATc < 7:51108/150‑1 (MQ=255) acgccccccccTCCCACCAACAACCACTTTGAAATACCTGACTCTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCaaa < 8:1459421/148‑1 (MQ=18) gccgcccccTCCCACCAACCAACACTTTTATATAGCTGCCTGTCTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCaaaaa < 3:257814/147‑1 (MQ=14) cccTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTACTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAGCACGGGAGATCATATAAAGttt > 6:142606/1‑149 (MQ=18) cccTCGCACCAAAAACCACGTTGAAATTGCTCGCTCTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTaa < 3:531226/151‑1 (MQ=255) ccTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAATAACGGTACATCAATAAAAGtttc > 1:1045657/1‑148 (MQ=18) tCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CCCCAAACGAGGCGAGATCAAATAATGttacat > 1:759395/1‑146 (MQ=21) gcccACCAACCACCACGTTTATATAGCTCCCCGTTGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CCCCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGAt < 5:906139/148‑1 (MQ=18) cgcacctaccaactcGTTGATAGAGCTCGCAGTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTGCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATg < 5:537852/137‑1 (MQ=18) cGCACCAAAAACCTCGTTGAAATTCCTCTCTGTTGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATg < 4:463157/151‑1 (MQ=18) cGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAATTGAGGCTAGTTCAAATAAAGTTTGATg > 1:1117189/1‑151 (MQ=18) cGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCAC‑G‑CCCCAAAGAAGGGGAGATAAAAAAAAGTatggt > 8:579592/1‑146 (MQ=18) gCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTACCCCCCCTC‑G‑CACCAAAAGACGGTAAATCAAAAAAAGTAAgcaa > 4:819344/1‑147 (MQ=18) acaaaacaCCACTTTGATATTCCGCGCAGTGGTCGAATGTGGAGGACTTGGTAGACCCGATAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACt < 7:585702/148‑1 (MQ=18) aCCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATAAAAAAAAGTAAGATGACt > 2:1011722/1‑151 (MQ=255) aCCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAAGAGCCGAAGACCAAAAATGTAACAtcc > 7:1647517/1‑147 (MQ=18) aCCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAACTCCCCCCCCTA‑G‑CCCCAAAAATCGTTATATCAAAAAAAGtttcttacat > 8:1634033/1‑142 (MQ=18) ccAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAACTCGGGATATCAAAAAAAGTTAGATGAAtg > 3:294041/1‑151 (MQ=18) cAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGTTGTTAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTGTTACGGTCGTGGGGGGTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACtgt < 1:504150/151‑1 (MQ=21) aaacacgtcGTTTATATTGCTCGGTCTCGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGGCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACtgtg < 1:1164885/143‑1 (MQ=18) aaaaaCCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACtgtg > 1:954061/1‑151 (MQ=255) aaaaCCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAAAAGGTTAAATCAAATAAAGTATAATGCCtgtgt > 7:1386430/1‑150 (MQ=18) aaaaCCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCGC‑G‑CACCAAACGAGGAGATATCAATTAATGTTACATGAGtgtgt > 1:1317786/1‑150 (MQ=18) aaaCCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAATAAGGGGATATCAATTAATGTTTGTTGACtgtttt > 1:1097415/1‑148 (MQ=17) aaaCCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAGGAGGGGATATCAAATATATTTAGATGCAtgtggt > 8:598291/1‑149 (MQ=18) aaaCCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTACCCCCCCAC‑G‑CACCAAAACAAGGGAAAACAAAAAAAGGTAGTAGACtgtggt > 2:1368977/1‑149 (MQ=17) aCGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGt < 1:1010336/151‑1 (MQ=255) cGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTg < 2:954527/151‑1 (MQ=255) gTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CCCCAAAGGAGGTTAGATCCATTAAAGTTTGATGCCtgttggttggtcg > 3:749096/1‑141 (MQ=17) gTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAGGACGTTAGATCAAAAAATGTTAGATgcgtgtttgttgctgg > 3:741187/1‑136 (MQ=17) gTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAAGAGTCGAGATCATAAAAAGTTTGATGCCtgttgtttgctgg > 3:803592/1‑141 (MQ=17) gTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAAGAGGTTATTTCAAATAAAGTTTGTTGACtgatttatcatgc > 1:1473948/1‑140 (MQ=17) tGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAAGACGGGATATCAAATATTGTTAGATGCGtgtgttttggtggcg > 3:369037/1‑140 (MQ=17) taattagtcattgtGGGCGAAGGTGTCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTATTACTGACGTGGGGGTGCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACGAAACGAGTCGATATCTATAAAAGTAAGATGAGTGTGCGAAGGTGGCgg < 6:1189678/137‑1 (MQ=18) tatTGCTCGCACTGGGCGAAGGTAGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAACAGGGGAATTCAATAAAAGTTTCATGACtgtgttatgttgccggat > 3:878639/1‑137 (MQ=14) aatttgttcctctctgCGAAGGGTTCGTAATTGGTAGAGGAGCTAGCTTTAGGTGTTAGTGTTATTACGGACGTGGTGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACTAAACGATCCGATATCAATAAAAGTAATATGTCTGTGCGAAGGTGGCGGaa < 4:403560/136‑1 (MQ=12) atTTCTAGCAGTAGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTGCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGaa < 3:928117/150‑1 (MQ=255) atTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCGC‑G‑CACCAAAAGAGGGGAGATCAAAAAATGTTAGTTGCCTGTTGGTTGGTGGCGGatt > 7:111141/1‑149 (MQ=17) tGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAAATGGGGAGATCAAAAAAAGTTATATGCCTGTTGTTTGGTGGCGGAAttt > 1:550118/1‑150 (MQ=14) tGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCCAAATACGGGATATCAAAAAAAGTTAGATGAGTGTGGGTTGGTGGCGGAAtgg > 3:1634210/1‑149 (MQ=17) 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cGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CCCCAAAAAAGGTTAAATAAAAAAAAAGAAGAAGCCTGTGCCAACGAGGCCCCATTAGGAGAcgcggttg > 5:931883/1‑147 (MQ=2) gTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAAAGAGGGGATATCAAAAAAAGTAAGATGCCTGTTGTTTGGTGGCGGATTTGGTataatagctatcatc > 1:559801/1‑136 (MQ=17) gTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGGTCAATTACCCCCCCAC‑GCCACCAAA‑TAGGGGAAATCAAAAAAAGTAAGATGAATTTGAGAAGGTTGGGGAATTGTTataaacgaaaaaatc > 8:1443377/1‑136 (MQ=12) tAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTACCCCCCCTC‑G‑CACCAAAAAAGGTTAAATCAAAAAATGTTTGATGATTGTTTTTTGGTGCCGGAATTAGTATAATTGATATCTGCAGGTTTTAgtgaa > 2:779348/1‑148 (MQ=2) cgcgCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACTAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGCATGTGAGAAGGTGGCGGAATTGGTATACGCGCTAGCATCAGGTGTTAGTGTACtttc > 5:247684/1‑149 (MQ=25) 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c‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCGCGCACCAAATAACTTTACTTCCTTTCTTGt > 1:1555829/1‑151 (MQ=255) c‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTGAAGTCCCCCCCCGCGCCCCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGt > 2:1379097/1‑151 (MQ=255) ccccACCAAACGAGTCCATATCTTATAATTTATGATGACTGTGCGAAGGTGTCGTAATTTGTAGACGCGCTTGCTTCAGTTGTTATTGTTCTTACGTACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTg < 8:941488/148‑1 (MQ=17) g‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCCCCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGtt > 5:1016014/1‑151 (MQ=255) g‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGtt > 5:1099639/1‑151 (MQ=255) g‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGtt > 3:1004656/1‑151 (MQ=255) g‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCCCGCACCAATTATCTTTACTTCCGTTCTTGtt > 3:275068/1‑151 (MQ=255) cACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGttt > 2:376749/1‑151 (MQ=255) cACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCCAGTCCCCCCCCGCGCACCAATTATGTTTACTTCCGTTCTTGttt > 5:1190096/1‑151 (MQ=255) cccAAACGATGCTACATCAAAATACGCACTATGCCTCTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTttc < 8:657487/150‑1 (MQ=17) cccAAACGAGGCGATATCAAAATATTTAATATTAATGTGCGAAGGTGGCTGAATTCCAATACGCGCTAGCTTCTTGTCTTAGACGACTTTCTTACGTGGTGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTttc < 8:1101530/150‑1 (MQ=16) acgaaaCTATGCTATCTCAAAAAAAGTAATATGACTTTGCGCAGGTTGCGTATTTGTTAGACTCGCTATTGTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTttc < 6:360055/148‑1 (MQ=18) cAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTGAAGTACCCCCCCGAGGCCCAATTATCTTTACTTACGTTGTTGTttctt > 8:1164916/1‑151 (MQ=21) aaaCGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTttcttc > 1:663602/1‑151 (MQ=255) aaaCGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTttcttc > 3:911207/1‑151 (MQ=255) aaaCGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTttcttc > 4:1221391/1‑151 (MQ=255) aCGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTGCCCCCCCTCGCCCCAATTATCTTTACTTGCTTTGTTGTTTCTTCCt > 6:1188591/1‑151 (MQ=255) aCGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCt > 5:1109118/1‑151 (MQ=255) aCGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCACCCACCAATTATCTTTAATTCCTTTCTTGGttattgc > 8:583822/1‑148 (MQ=21) | GGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAAAAACCACGTTGATATTGCTCGCACTGGGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTC‑G‑CACCAAACGAGGCGATATCAAAAAAAGTAAGATGACTGTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAATTATCTTTACTTCCTTTCTTGTTTCTTCCT > DH1/3906689‑3906981 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |