| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 1355847 = | 111 (0.240) | 46 (0.100) +CCTC |
25/292 | 34.3 | 19.6% | noncoding (75/76 nt) | ECDH1_RS06680 | tRNA‑Val |
| ? | DH1 | = 3099750 | 276 (0.590) | noncoding (1/76 nt) | ECDH1_RS15360 | tRNA‑Lys | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
ACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < DH1/1355973‑1355847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCG < DH1/3099750‑3099609 |||||| ACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TCGGGGCGTgatatcattgtg > 3:515985/1‑139 CCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TAGTGTCGTTAGatattttggtt > 7:539618/1‑140 CAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TAGTGTCGTTAGATCATTTGGTAG > 7:1435941/1‑148 ATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TAGGCTCGTTAGCTCAGTTGGTTTACCAGGTGACTTT > 7:1062618/1‑151 TGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TAGGCTCGTTAGATCAGTAGGTAGACCAGTTGACTTTT > 3:1543329/1‑151 ttcctcgtttTAGTAAGAATTTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAG < 4:1580779/121‑1 cggtatattttGAACTTGCGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGTGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTG < 5:1624596/138‑1 CGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTGGGTTTAGCAGTTGACGTTGAATAAATTGTTC > 1:1064565/1‑151 CGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TCGGGTCCTTAGATCAGTTGGTAGAGAAGTTGACTTTTAATCAATTGtt > 4:517346/1‑148 tttatgatGAATTTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG < 6:716063/142‑1 tttatcctGAATTTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCG < 8:1501943/142‑1 GCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACT‑TCGGCTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAAAAAATTGTTCGAAGGT > 2:1051873/1‑151 TAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATT > 2:1731873/1‑151 gTCAGCTTGGAGAGCACCTCCCTTAGAATGAGGGGGTCGGCGGTTCTATCCCTTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAA < 6:1050036/150‑1 TCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAA > 2:448736/1‑150 CAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAc > 5:1050442/1‑150 CTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTgatcgg > 8:1282547/1‑144 CTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTG > 6:515934/1‑151 gacAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGGCGGCGTTTCGATCCCGGCATCACCCACC‑CC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTA < 5:515780/148‑1 AGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGCTGGTAAC > 1:1421302/1‑151 cCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTAGATCCCGTCATCACCCACC‑CC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGTAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGG < 8:261054/150‑1 aCACCGCACTTACAATGAGGGGGTCGGCGGTTCTATCCCGTAATCACCCACC‑AC‑TGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGG < 1:1587283/150‑1 TCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAA > 1:1834449/1‑134 CCTTAGAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑TC‑TGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAA < 2:1428765/151‑1 CCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTTAAGGTGctaaggggttgtga > 5:1346028/1‑136 tAAGGAGTGGGTCGGAGGTTCTATCCAGTCATCACCCACC‑TC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTG < 4:1158288/149‑1 AAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTTTTAAGCTGCTTACGCGAAGAGAACGTtgc > 3:1155020/1‑148 AGGAGTGGGGCGGCGGTTCGATCCGTGAATCACCCCCC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAG < 1:1723133/151‑1 GGGTCGGCGGTTCGATCCCTTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAAC < 6:1298399/151‑1 GTCGGCGGTTCTATCCCTTCATGAACCACC‑AG‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGT < 8:1795607/151‑1 GTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCATTTTTAAGCTGCTTACTCGTAGAGAACGTGTACGAGAACGg > 5:1847447/1‑150 CGGCGGTTCTATCCCGCAATTACCCACC‑TG‑TTGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTG < 6:1345363/151‑1 CGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTCGTTAATAGAAGATAACGTGAAAGATAAactt > 2:1650687/1‑146 gcgagatataatcttTCATGAACCACC‑CCGTGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTG < 1:324606/136‑1 gagtTTCTATCACGTCATCACCCACC‑AC‑TGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCG < 3:851477/147‑1 GCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTCGTTACTG > 5:1382950/1‑124 CGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑TG‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATT < 4:1620457/108‑1 acaatcccgactggACCCACC‑TT‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGC < 1:33801/137‑1 GATCCCGTCATCACCCACC‑TC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTAC < 3:1125602/115‑1 GATCCCGGCATCACCCACC‑AC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGA < 5:1271905/130‑1 ATCCTGTAATCAACCCCC‑AG‑TTGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAA < 8:1219310/150‑1 ccaGTCATCACCCACC‑AT‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACG < 2:1606131/147‑1 ggCATCACCCACC‑TC‑TGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCC < 5:1552230/149‑1 gcagCACCCCCC‑CC‑ACGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCG < 1:390892/147‑1 CCCACC‑TC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGC < 6:1097695/151‑1 cagacgcgtgCGGTTCGTTTGTTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGG < 5:236846/140‑1 CCACC‑CCGTGGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGC < 3:1279791/151‑1 cccccaC‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAAACATTTGGGCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAACGGTGGTTACTGGTATAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCG < 7:1110091/145‑1 C‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAG > 1:1023392/1‑101 C‑TCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAG < 2:1025840/101‑1 CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAAC < 5:796314/130‑1 CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACCTGAAGGATAACCTTTCGTTAGCAAC > 6:796208/1‑130 |||||| ACCCACCAACTACTTTATGTAGTCTCCGCCGTGTAGCAAGAAATTGAGAAGTGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < DH1/1355973‑1355847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAATTTAAAGGTGGTTACTGGTAGAGAACGTGAAGGATAACGTTGCGTTAGCAACGGCCCGAAGGGCG < DH1/3099750‑3099609 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |