| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 1519281 | 278 (0.600) | 47 (0.110) +AACCTTCTAATT |
33/276 | 29.0 | 15.5% | coding (788/900 nt) | yfaD | transposase |
| ? | DH1 | 1519282 = | 278 (0.600) | coding (787/900 nt) | yfaD | transposase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
GCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATTAA > DH1/1519132‑1519431 | gCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTATTGACCGTTCGGAATATCAGCCTCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACACTCTCCCGTGCAACGCCCTGCTCAAGAATGAGCAAAGGAATTTTCATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TAcc > 7:91849/1‑151 (MQ=255) ttCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGTCAGTTCGGATTATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGACAGCACAATCTCACGTTCAAACCCCTGCTCCAGCAAGCCCAAAGCAATTTTAATCCCGTCTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTgc > 7:1750575/1‑151 (MQ=255) ttCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGGATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAACGCCCTGCTCCAGAATGCGGAAAGCAATATTAATGGCTTGTGAATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTgc > 4:918372/1‑151 (MQ=255) tCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGAGATTTACGATGATCAGCATCAGAAATTAGCGTTGTAGACAGCAAAATCTCACGTACAAACACCAGAGCCATAATGAGAAATCCAATTTAAATTGCTTGTTCATTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACATTCCTggc > 5:323031/1‑149 (MQ=255) tCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGAGAGTACGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCCGCACAATATCACCTTCAAAGCCCTGATACATCATGAGCAAATGAATATTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACATTCCTgcc > 5:974066/1‑151 (MQ=255) cAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTgcca < 3:1507421/151‑1 (MQ=255) cAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAAAGACAGTACCGATAATCAGGATCAGAAAGATGGCTTGTCGCCAGCACCATCTCTCCTACAAAGCCCAACTCCAGCATGCGCAAATCAATTTTAATGGATTGTTGATGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTGCGTgccc > 2:819682/1‑150 (MQ=255) aGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGATGACAGTTCGGAATATCAGGATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCCGCGCCGTCTCACGTGCAAAGCGCTGCTACAGCATGCGCATAGGTATTTTAATGGCTTGGTCCTGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCCTTCCTggg > 6:259375/1‑147 (MQ=255) aGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGCTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATGTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTgcc > 3:1337966/1‑149 (MQ=255) gCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGGTGTCGCCAGCACAATCTCCCGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTgccagc > 1:1327020/1‑151 (MQ=255) gCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTACGGAAGATCAGCATCAGGGAGTTGGCTTGTCGACAGCGCCCTCTCGCGTTCAACGCCCTGCTCCAGCATGAGAAAAGCAATGTTAATGGCTTTTTCGAGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTGACTggcagc > 6:1043609/1‑151 (MQ=255) cAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTgccagcc > 1:590608/1‑151 (MQ=255) aTAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCCCAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGGTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTgccagcca > 8:58839/1‑150 (MQ=255) tAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAAt > 3:808035/1‑151 (MQ=255) aGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAAtt > 5:1335075/1‑151 (MQ=255) cATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGTGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTAAATGGCTTGATCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCGGCCCGCCAATTTg > 8:1810264/1‑150 (MQ=255) cATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTg > 7:1519514/1‑150 (MQ=255) tAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGc > 1:854639/1‑151 (MQ=255) aaTCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGcc > 3:1093434/1‑151 (MQ=255) ctctcCTTTTAATGAAAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGCTTTTATCCAGCAAAATCTCACGTTCAAAGCACTGCTCCAGCATGCGAAAATCAATTTTAATCTCTTTTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATATGATGCCCtt > 2:997640/1‑151 (MQ=255) ctcCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTcc > 5:680285/1‑151 (MQ=255) tcCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCt > 3:475600/1‑151 (MQ=255) ttttAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGcc > 1:1201261/1‑151 (MQ=255) ttttAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGcc > 1:142569/1‑151 (MQ=255) tttAATGACAGATCGCAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACATTCAAAGCCATGCTCCACCATGCGCAAAGCAATTTTAATGCCTTGTTCATTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCACCAAATTTGATCCACTTCCAGca > 6:1853612/1‑149 (MQ=37) tAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGt > 2:650037/1‑150 (MQ=255) tAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGt > 4:1732273/1‑150 (MQ=255) aTGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGc > 8:912622/1‑151 (MQ=255) aTGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGc > 5:1636453/1‑151 (MQ=255) ttCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTc > 2:605429/1‑149 (MQ=255) gctgccatatCCGCTTCGGTTAGGTGGGTGGGCGCCAGCACATTGTCACGATCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAg < 7:258384/145‑1 (MQ=18) ggAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGc < 2:718076/141‑1 (MQ=255) ggAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGc > 1:715816/1‑141 (MQ=255) ggAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCa > 3:1577665/1‑150 (MQ=255) gAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAAt > 7:1252066/1‑151 (MQ=255) aaTATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCGTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAAt > 6:630787/1‑150 (MQ=255) atatCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAAt > 2:421346/1‑149 (MQ=255) tatCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCTGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGt > 7:236934/1‑151 (MQ=255) 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aTCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAAt > 8:1711284/1‑151 (MQ=255) tcggTGAGGTGGGTGGGCGCCAGCACCAGGGCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAAt < 7:1104536/147‑1 (MQ=21) aGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCt > 8:553865/1‑151 (MQ=255) tGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCtttt > 3:1236836/1‑151 (MQ=255) gggTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTg > 1:459514/1‑151 (MQ=255) 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gCCCTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGacggatgggc > 7:403701/1‑141 (MQ=21) cccTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCATGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCATGCCGCAGACTTTCAGCAATAGTCATTAATCTATCCTTTTGTAGTGCTGaaggatcatca > 5:1560166/1‑141 (MQ=21) cccTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATa > 4:201184/1‑150 (MQ=255) cTGTTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCAAACCTTCTAATTTACCTTCCTGCCAGCCAAGTTGATGTCCTTCCTGACGAAGACGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTTgaggttacggatacgcaaa > 3:995420/1‑136 (MQ=21) cTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATaaa > 2:200118/1‑150 (MQ=255) 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aattttaataGCAATTTTAATGGATTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGaaa < 5:522355/142‑1 (MQ=255) aattataaacgCATTTTTATTGCCTTGTTCATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGaaa < 5:289545/141‑1 (MQ=25) aTGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAAc > 8:330043/1‑151 (MQ=255) cgcAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGATCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGAGGACAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGCGTGAAACggg > 8:683333/1‑151 (MQ=255) taattgcttttttAATGTCATTTTCTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGTCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACggg < 2:1085951/141‑1 (MQ=21) gcAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACggg > 7:597176/1‑150 (MQ=255) aaaaGCTTTTTTAATGTATTGTTCATTCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAg < 6:71820/150‑1 (MQ=25) cAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATc > 6:1778283/1‑151 (MQ=255) aaTTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATcg > 1:814324/1‑151 (MQ=255) aaTTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATcg < 4:74617/151‑1 (MQ=255) aTTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAATCGGGTGAAACGGGAGGTATcgc > 8:1616241/1‑151 (MQ=255) aTTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATATGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATcgc > 5:913186/1‑151 (MQ=255) aTTTAAATGCCTCCTTCATTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATc < 2:1140742/149‑1 (MQ=255) ttttAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATcgcc > 6:1500032/1‑151 (MQ=255) ttAATGGAATGCTTATTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATcgccg < 4:499424/150‑1 (MQ=255) 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gCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAAtt > 3:210960/1‑151 (MQ=255) a‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACCGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATTaa < 5:125348/151‑1 (MQ=255) | GCCGCAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTAATGACAGTTCGGAATATCAGCATCAGTGAGTTGGGTTGTCGCCAGCACAATCTCACGTTCAAAGCCCTGCTCCAGCATGCGCAAAGCAATTTTAATGGCTTGTTCATGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACCTTCCTGCCAGCCAATTTGATGCCCTTCCTGCCGTAGCCGTTCAGCAATAGTCATTAATCTCTCCTTTTGTAGTGGTGAACGTTCGGCAATCTCCTCAATAAAACGGGTGAAACGGGAGGTATCGCCGCATTGCAGCAGATAATTAA > DH1/1519132‑1519431 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |