New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | DH1 | = 1355505 | 434 (0.930) | 58 (0.140) | 27/260 | 30.4 | 16.0% | noncoding (54/348 nt) | repeat_region | repeat region |
? | DH1 | 3099693 = | 234 (0.580) | noncoding (58/76 nt) | ECDH1_RS15360 | tRNA‑Lys | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
TTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTAC > DH1/3099544‑3099837 | ttGCGGGATTATGCTGCTTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTc > 1:1394466/1‑151 (MQ=255) tGCGGGATTCTGCTGCCTTAATCATTCAGCATGGGGGCTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt < 7:109325/149‑1 (MQ=255) tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTACCCCACCGTTATCCGTCACGGTCGCTAGCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCg > 7:1120401/1‑151 (MQ=37) tGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGGGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTc < 3:1588366/150‑1 (MQ=255) ggggggTTATTCGGCCCTTATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCAACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCg < 5:1726120/148‑1 (MQ=21) gCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCTGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGTGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGa < 3:1776681/151‑1 (MQ=255) gCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTAGCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAtt > 6:1778747/1‑148 (MQ=255) gCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCg > 1:213543/1‑150 (MQ=255) gCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGAGGGTGGGTCGTGCAGGACGACTAGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGa < 1:1566280/151‑1 (MQ=255) ccGGGATTCGGCTGCCTTACTCATTCAGGATGGCGGGTCGTGCAGGCCGACGCCACCTCGGCTCGCCCTTCGGGCCTTTGCTAACGCAACGTTATACTTCAAGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGa < 1:1066976/150‑1 (MQ=25) gggATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTATAACAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAttacaa > 8:1374429/1‑146 (MQ=255) ggATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTAAATAACAGTAACCCCCAATAAAGTGGTGGGTCGAGAAGGATTCGAAc > 8:1703586/1‑150 (MQ=21) ggATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAATAGCTCTAGCCCTTCGGGCAGTTGATAACGCAACCTTAAACTTAACGTTAACGAGCAGTAACAAACATTAAAATAGTGGGTCGTGCAGGATTCGCAcc > 8:52424/1‑151 (MQ=19) gtttATGGTGCCTTAATGTTTCAGTTTTGTGGTTCGTGAAGGATGACTCGACTTCGTCTGGGCCTTCGGGCCTTTTCTAAGGCAACGTTATCGTTAACGTTCTCTTCCAGTAAGCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCt < 2:1599313/149‑1 (MQ=18) ttATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGCACCTGc > 3:1410563/1‑151 (MQ=255) tATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCg > 7:1801066/1‑151 (MQ=255) tATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTAGAATTCGTCTCGCACTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACTGTCTCTAACAGTTAGAAAATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACATGCg > 4:563001/1‑151 (MQ=21) aTGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCg > 6:884431/1‑150 (MQ=255) aTGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTAGAACCTGCgc > 1:944617/1‑150 (MQ=255) tgctgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTAACAGTAACAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGCACCTGCGAc > 5:625298/1‑151 (MQ=255) gctgcCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGAcc < 3:271914/151‑1 (MQ=255) ccTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAGTTCGTCTCCCCATTCCGCCCCATGGTACCGCTCGGTTATCCTTGCCGTTGTCTACCAGTAACAACCGTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGCTTCgggccgggggccgagg > 5:1321646/1‑136 (MQ=255) ccTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTATACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCCAACCTGCGACCaaat > 5:1489729/1‑149 (MQ=255) ccTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATAACAGTAAAAACCTTTAAATAGGTTGGTAGTGCAGGATTCCAACCTGCGCCCaa > 2:293097/1‑149 (MQ=21) ccTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTAACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGCACCGGCGCCCaagt > 7:1010493/1‑149 (MQ=255) ttAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGCCCAATTg > 3:547786/1‑150 (MQ=255) ttAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTAGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATCTACAAGTGACAACCTATAAATAGGTGGGTCGTTCATGATTCGCCCCTGCTACCCAtggc > 3:359152/1‑148 (MQ=18) tAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAATGCCTCACGACGTAAGGGCCTATTCTAAAGAAACATTATGCGTCAATTTCTATAGCAGTAACCACCAATAAAAATTTGTCTAGTGAAGGATTCGAACCGGCGCCGCATTGAt > 6:704246/1‑151 (MQ=255) aaTCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCAATACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTGGAACCTGCGACCAATTGAtt > 7:23426/1‑151 (MQ=255) cATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAAACACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGCTTGGAACCTGCGGCCAATTGATTaa > 7:951613/1‑150 (MQ=255) ttCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATAACAGTAAAAACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAAGATTCGAACCTGAGAACAATTGATTaaa > 6:584883/1‑149 (MQ=18) tCAGGATGTTTGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCTTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAg < 4:913836/150‑1 (MQ=255) tCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAg < 7:756467/150‑1 (MQ=255) gagcgtggtggGTGTTTCAGGATGCCGCGACGTCGTCTCGCCCTGCGGGCCTTTTCTAAGGCAACGTTATCCTTCACCTTCTCTACCAGGCACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTc < 5:769900/146‑1 (MQ=17) ggATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTACGTCTCGCCCTTCGCGCCGTTGCTAACGAAACGTTATCATTCACGTTATATAACAGTAAGAACATTAAAATTTGTGGGTAGTGCAGGATTCGAACCTGCGAAAAAGGGAATAAAAggcg > 6:1546865/1‑147 (MQ=17) ggATGGCGGGTGGTGCAGGAGGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCaa < 5:1830960/151‑1 (MQ=255) ctctgctgcggcgcgCAGTATGACTCCACTTCTTCTCGCCCTTTGTTCTTTTTCTATCTCAACGTTATCCTTCACTTTTTCTAATAGTTTCAACCTTTAAATTTCGTGGTCGTGCATGATTCGTACCTGCGACCAATTGATTAAAAGt < 6:283305/134‑1 (MQ=9) ggtggGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTATATAGCAGTAACCAGCTGTAAAGTGGTCGCTCGTGAAGGATTCGAACCTGGGAGCACTTGTTTTAAAGTAAAATg > 5:291409/1‑150 (MQ=17) 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ttagggagcttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATtggtgg < 7:1500682/137‑1 (MQ=255) cgataacgctcttttAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTAGTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGt < 7:17700/139‑1 (MQ=255) cagggcgctgttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTc < 7:544612/140‑1 (MQ=255) agggagcttttttACATTTGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCg < 6:1398535/141‑1 (MQ=255) aGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCCAACGGTGGGTGCAGGAAAGATATTAACTCCGGCCCCCTCGTTAAGATTCCTGGGt > 8:370280/1‑149 (MQ=14) tatccaccTTTTATTTGTTGGGTCGTTCAGTATTTGTAGCTGTGAACTATTGTTTTAATTTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGt < 8:20165/147‑1 (MQ=25) tAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAAATGAGC‑TAACGAACCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGCTTGGTGGGTCGTg > 7:70394/1‑151 (MQ=255) tcgcttttttACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAg < 6:114285/129‑1 (MQ=255) accTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑t > 7:833655/1‑78 (MQ=38) ttttAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATAc > 4:780902/2‑88 (MQ=37) cTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCa > 2:682770/1‑68 (MQ=35) aaaTTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGATACCAATTTATTAAAATTCAACTGCTCTACCAACTTAGC‑TAACGACCCATACGGGTTTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtc < 8:119823/151‑1 (MQ=25) aaaTTGGTGGGTCGTCCACGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAACTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACCACCCATACGCGTGCTACCTGAAACATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACt < 1:1338919/150‑1 (MQ=25) aTTGGTGGGTCGTTTAGGATTCGAACATGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACTACCCATACGGGTGTTACCTGAAATATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgc < 8:159895/151‑1 (MQ=255) ggtcggtcGTGCAGGCTTCGAACCTGCTACCTATTGTTTTTTTTTTAAATGATATTTCTACTTAGG‑TTACGACCAATACGTGTGTTACTTTTTCGATTTTTTATGGTGGTCATTCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgctt < 2:133302/150‑1 (MQ=255) ggctCGTGCAGGATTCTATATTTTTACGAATTGATTAAAAAGCAACTTCTCTACCAACTGAGC‑TAACGATCCATACGCGTGTTATCTTAATCTTTTTTATTCTGGGTTAATCATTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACtcgcttcgct < 4:1434199/148‑1 (MQ=255) gTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAg < 7:1253614/87‑1 (MQ=255) gTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACCGGTGTTACCTGAAAGATTTTTAATAGGGTCCAATCTATAAGATTGTTGCTTCGTGAAGTATCACTCGCTtcgctctacc > 6:45831/1‑147 (MQ=18) caccagtCGAACCTGCGTCGAATTTATTTTAACTGCCCTCCTCTACCAACTCATC‑TAACGCCCCATACGTTTGCTACCTGTACGATTTTTAGTTGTGGTTAATCTTTAAGCTTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTAc < 6:1321058/145‑1 (MQ=12) aGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCa < 2:1808064/100‑1 (MQ=255) aTTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACGGGTGTTACCTGaa > 1:1739116/1‑78 (MQ=255) | TTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGC‑TAACGACCCATACGGGTGTTACCTGAAAGATTTTTACTCGGGGCCAATCTTTAAGATTGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCTTCGCTCGCCCTAC > DH1/3099544‑3099837 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |