New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | DH1 | = 3099542 | NA (NA) | noncoding (268/268 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 367 total aligned reads displayed.
CTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAT > DH1/3099392‑3099692 | ctcaaACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAccc > 8:1007451/1‑151 (MQ=31) ctcaaACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAccc > 6:1851622/1‑151 (MQ=31) ctcaaACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACATGAGACCAAATGATTAAAAGTCAACAGCTCTACCATCTGAGCTAACGAccc > 2:22364/1‑151 (MQ=255) tcaaACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccc > 5:641997/1‑151 (MQ=32) aaaCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTTAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCtt < 3:234080/151‑1 (MQ=18) aaaCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCtt < 8:1800165/151‑1 (MQ=33) aaaCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAAATCATTAAAAGTCAACTGATCTACAAACTGAGCTAACGAcccaat > 4:273043/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCtaccg > 7:1729653/1‑147 (MQ=18) gctgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCggg < 1:1113667/150‑1 (MQ=38) gctgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCgg < 8:390372/149‑1 (MQ=37) gctgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTACCgggg > 5:1391728/1‑150 (MQ=18) gctgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGACTTTAGGGAGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCATGATTCGAACCTGCGACCAATAGATTAAAAGAAAACTGATCTACCAACTCAGCTAACTAACCCTTTCggt > 6:1582144/1‑149 (MQ=11) tgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccatacgggtgtt > 6:371545/1‑140 (MQ=9) 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acgaaaCTGCTCTTCCAAATGACCTAACCAACTCTTGCTCTATTATGCTGTCTTCATCTTTTATTATGGTGGGTCGTGCAGTTTTACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGt < 4:373517/147‑1 (MQ=12) gTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCACTACGGGCAGTAGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCACTAACAga > 4:1527256/1‑149 (MQ=37) cAACTGCACTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGCTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTaa < 2:319666/150‑1 (MQ=255) aCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAacca < 2:1564662/151‑1 (MQ=255) aCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTAGCGGGATTAGGATGCATTAATCATTAAGGATGCTGGCTCGTAGAGGATGACTCCACTTCTTCTAGCCCATCCCGACTTTGCTAAAGGAACGTTATCATAGACGTTCTCTACCAGTAacc > 7:20188/1‑150 (MQ=255) tctACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCttt > 8:757155/1‑151 (MQ=255) ctACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCtt < 6:625546/149‑1 (MQ=255) tACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCACTTCGGGCAGTTGCTAACGCAACTTTATCCTTCACGTTAAATATCAGTTATAACCTTTa > 7:1269779/1‑150 (MQ=25) tACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCCTCTCGCCCTTCGCGCAGTAGGTAACGCAACGTTATCGGGCACGTTATATAAGAGTCACCTCCtata > 5:383340/1‑150 (MQ=25) ccAACTGTGTTAACCAACCCTTGGGTGATTATGTTTTGGTTCTCTTTTAGTTTGGTGGGTCGTGCTGGATGAGTCTACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAAt < 2:1105759/151‑1 (MQ=12) cAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCCTTCGTCTCGCCCTTCGGCCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCAATAGCAGTaagaacgataacatt > 1:946923/1‑138 (MQ=25) cAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGAGTTAGTCTCGCACGTCGCGCAGTAGCTAACGCAACTTTATCATTCACTTTCACTAACAGTAACAACATTTAAAtt > 4:1458523/1‑151 (MQ=37) cAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCAGTCGGGCCGTTGCTCAGGGAGCCTTATCCGTCACGTGATCTCCCAGGACACACCGTTAAAt > 5:177354/1‑150 (MQ=21) aaCTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTATAAAAGTAACAACATTTaaaatt > 2:661108/1‑148 (MQ=25) gtGAGCTAACGATCAGTTGATGTTTTATGCTTGCTTTATCATTAAGTATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtgg < 1:1594884/149‑1 (MQ=18) cTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCAGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTAACAGTAACCACCTTTAAATtggt > 8:55059/1‑151 (MQ=255) gAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggtgg < 7:302376/151‑1 (MQ=255) aGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTggg < 1:1061111/151‑1 (MQ=255) gCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCGTAATCATTCAGCATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGt < 3:490755/151‑1 (MQ=255) cGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGc > 3:588053/1‑151 (MQ=255) cGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCCTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGc > 5:1832971/1‑151 (MQ=255) ccccTTGCGGGATTATGGTGCCTTAATCCTTCAGGTTGGGGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAgg < 1:1817881/151‑1 (MQ=255) | CTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAT > DH1/3099392‑3099692 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |