| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | DH1 | 936,278 | 1 | . | T | 26.7% | 206.4 / 118.3 | 86 | intergenic (‑12/+22) | ECDH1_RS04620/ECDH1_RS04625 | tRNA‑Met/tRNA‑Met |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (59/4); new base T (22/1); total (81/5) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.96e-03 | |||||||||||
GGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTT > DH1/936140‑936427 | ggCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCAGTAAT‑GC‑TTGTATtcatc > 5:1765227/1‑150 (MQ=14) caAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCACATTATAATTGCTTGCGGCGGCCGGATTTGAACcgacgcc > 7:1041003/1‑149 (MQ=255) tGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACGGTACT‑GC‑GTTACTTCTGCAAAGTTTAATTGGTTGCGGGGGACGGATTTGCAGCGACGACCTTAgg > 4:300102/1‑151 (MQ=14) aTTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAAt < 7:1544602/88‑1 (MQ=35) aTTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAAt > 8:1545991/1‑88 (MQ=35) aaCCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGACCGCCGAGCTACAAgg > 5:834976/1‑151 (MQ=255) cTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTTAATAATAAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGAtt > 6:865261/1‑98 (MQ=14) ttCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACGGGACG‑GG‑GTGACTTCATCACAGGTTTATTGGTTGCCGGTGGATGTTTTGCAGCTCCGCCCTTCGGGTTGTTAGACCGAAGAGCGACAAGGCTGCTCcccc > 1:642040/1‑150 (MQ=2) ttATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACGTCATCAAATTTTAATTGGTTg > 6:198575/1‑78 (MQ=255) cccGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACAGGACT‑GC‑TTTAATTCAGCAAATTTTAATTCCTTGCCGGTGACGGTTAAGAACCTACCCCATTAGGCATATGATACAGCCGACCAACCAGGCTGCACCAACAAGCGTcagacaa > 1:1551729/1‑144 (MQ=9) tACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACGGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGGCGGATTTGCACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCGCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCAGGCGTCCGTGGATGAGCACtat > 7:271342/1‑150 (MQ=17) cAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTAGTCGG‑ATTA‑TTCAGCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGGATTATTGGACGAGACGACCTTAGGCTTAAGAGACCGAAGAGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGATTCCGTGGAAGATGACTATACt > 6:45256/1‑150 (MQ=9) aGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTGACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGGCGGATTTGACCCGACGCCCTTCGGGTTATGAGCCCGACTAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGGGTATGCGCACTAtcctcc > 3:1351143/1‑151 (MQ=17) gctgctCCACCCCGCGTCACCGTACT‑CC‑GTTAATTCATCAAAATTTAATTCGTTGCGGCGGAAGTATAAGACCCGCCGACCTTCGGGTTATGAGACCGAACAACTAACACACTGCTCCAAACATCGTCCGTTGATTCGCACTATACTCCGc > 4:953072/1‑151 (MQ=12) tgctCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGCCCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCTCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGGTc > 2:560162/1‑151 (MQ=255) tgctCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTAATTCATCAAATTTTAATTGGTTCCCCCCGCCTGATTAGAAACGACGACCTTCCGGATATCAGACCGACGAGCTACCAGGCTACTCCACCCCTAGTCCGTGGATTAGCACTATACTcacctc > 2:1050526/1‑146 (MQ=12) gctCCACCCCGCGTCCCCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGCCGAGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGCTTCCGTGGATGCGCACTATACTCGGCTcg > 6:1699138/1‑151 (MQ=255) gctCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCCACCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcg > 6:661367/1‑151 (MQ=255) ctCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcgc > 6:1764551/1‑151 (MQ=255) tCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcgcg > 5:1865108/1‑151 (MQ=255) 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cT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttt > 7:59094/1‑151 (MQ=255) t‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCttttttt > 3:1275505/1‑151 (MQ=255) t‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCttttttt > 8:566579/1‑151 (MQ=255) gC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 5:1597173/1‑151 (MQ=255) gC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 6:1053907/1‑151 (MQ=255) c‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 7:1167601/1‑150 (MQ=255) c‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 4:487999/1‑150 (MQ=255) c‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACAAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCtttttttt > 5:1048897/1‑150 (MQ=255) | GGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTT > DH1/936140‑936427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |