| Read alignment evidence... | |||||||||||
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Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
CAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAT > DH1/936180‑936442 | caAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCACATTATAATTGCTTGCGGCGGCCGGATTTGAACcgacgcc > 7:1041003/1‑149 (MQ=255) tGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACGGTACT‑GC‑GTTACTTCTGCAAAGTTTAATTGGTTGCGGGGGACGGATTTGCAGCGACGACCTTAgg > 4:300102/1‑151 (MQ=14) aTTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAAt < 7:1544602/88‑1 (MQ=35) cTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTTAATAATAAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGAtt > 6:865261/1‑98 (MQ=14) ttATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACGTCATCAAATTTTAATTGGTTg > 6:198575/1‑78 (MQ=255) cAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTAGTCGG‑ATTA‑TTCAGCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGGATTATTGGACGAGACGACCTTAGGCTTAAGAGACCGAAGAGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGATTCCGTGGAAGATGACTATACt > 6:45256/1‑150 (MQ=9) aGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTGACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGGCGGATTTGACCCGACGCCCTTCGGGTTATGAGCCCGACTAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGGGTATGCGCACTAtcctcc > 3:1351143/1‑151 (MQ=17) tgctCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTAATTCATCAAATTTTAATTGGTTCCCCCCGCCTGATTAGAAACGACGACCTTCCGGATATCAGACCGACGAGCTACCAGGCTACTCCACCCCTAGTCCGTGGATTAGCACTATACTcacctc > 2:1050526/1‑146 (MQ=12) gctCCACCCCGCGTCCCCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGCCGAGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGCTTCCGTGGATGCGCACTATACTCGGCTcg > 6:1699138/1‑151 (MQ=255) ctCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTcgc > 6:1764551/1‑151 (MQ=255) 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cgcgTCACCGTACT‑GCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCTCTATACTCCGCTCGAGttttggt > 3:1230728/1‑148 (MQ=14) cgcgTCACCGTACT‑GCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGGGGAGGCGCAGTATACTGCgaaggagtattcat > 8:1598142/1‑138 (MQ=11) cgcgTCACCGTACT‑GCTTTTACTTCATCAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCCGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCCGGGATGCGGACTATACTACCCTCTCGTTTTCAt > 4:684565/1‑151 (MQ=11) cgcgTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCAt > 5:1449442/1‑151 (MQ=255) gcgTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATg > 1:970812/1‑151 (MQ=255) 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catcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATc > 1:502755/1‑151 (MQ=255) catcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATc > 8:691858/1‑151 (MQ=255) catcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATc > 1:1708266/1‑151 (MQ=255) atcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATc > 2:1790238/1‑150 (MQ=255) atcaAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTGCTCTGGATTTTTCATGCACCGGTGTTTTTAGCACGATCAc > 7:1002884/1‑151 (MQ=14) tcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc > 1:630575/1‑151 (MQ=255) tcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc > 7:1288061/1‑151 (MQ=255) tcaAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCAc > 4:258998/1‑151 (MQ=255) caAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACg > 4:484366/1‑151 (MQ=255) aaaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 7:158374/1‑151 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACgg > 4:750350/1‑150 (MQ=255) aaTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGa < 3:673197/151‑1 (MQ=255) aTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAt > 5:831408/1‑151 (MQ=255) aTTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTATTTTTTACCCCGATCACGGAt > 4:835776/1‑151 (MQ=255) | CAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACT‑GC‑TTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGGATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAT > DH1/936180‑936442 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |