| Predicted mutation | ||||||
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| RA | DH1 | 4,599,491 | C→T | L75F (CTT→TTT) | glmU → | bifunctional N‑acetylglucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/glucosamine‑1‑phosphate acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | DH1 | 4,599,491 | 0 | C | T | 94.9% | 1591.0 / 47.6 | 477 | L75F (CTT→TTT) | glmU | bifunctional N‑acetylglucosamine‑1‑phosphate uridyltransferase/glucosamine‑1‑phosphate acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (13/11); new base T (195/255); total (209/268) | |||||||||||
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Only 100 of 481 total aligned reads displayed.
AGTGCTGCATACCCTTGCCGGGAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGCTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGCGTGATGCTAAACCGCAGG > DH1/4599343‑4599638 | gctgcATACCCTTGCCGGGAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTc > 2:683868/1‑149 (MQ=255) gctgcATACCCTTGCCGGGAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCa < 8:1638422/150‑1 (MQ=255) gctgcATACCCTTGCCGGGAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAg < 7:1731744/151‑1 (MQ=255) tgcATACCCTTGCCGGGAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGCCGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGc > 2:171605/1‑151 (MQ=255) tgcATACCCTTGCCGGGAAAGCGATGGTTAAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGATGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGTGAGCTTCAGGc > 2:105359/1‑151 (MQ=255) gcATACCCTTGCCGGGAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTCCGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGc > 4:1443521/1‑150 (MQ=255) gcATACCCTTGCCGGGAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGc < 7:1320548/150‑1 (MQ=255) gcATACCCTTGCCGGGAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGCa < 6:1424391/151‑1 (MQ=255) 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tGCCGGGAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCt < 4:1671343/150‑1 (MQ=255) gCCGGGAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTgg > 4:187095/1‑151 (MQ=255) gAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACg > 3:1582189/1‑151 (MQ=255) aaGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACggg < 6:1111230/151‑1 (MQ=255) aGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGt > 2:761962/1‑151 (MQ=255) 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aaGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCt > 8:66781/1‑151 (MQ=255) aGACGACAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTg < 3:450688/151‑1 (MQ=255) gacgacAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGc < 5:897381/151‑1 (MQ=255) acgacAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGCg > 3:1753686/1‑151 (MQ=255) cAACCTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGCGTGAt < 1:4364/151‑1 (MQ=255) cTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGCGTGATGCt > 2:1246800/1‑150 (MQ=255) cTTAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGCGTGATGCt > 5:175901/1‑150 (MQ=255) tAACTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGCGTGATGCTaa < 5:1379568/150‑1 (MQ=255) aaCTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGCGTGATGCTaaa < 6:547132/150‑1 (MQ=255) aaCTGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGCGTGATGCTaaa < 5:506717/150‑1 (MQ=255) tGGGTGTTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGCGTGATGCTAAACCGc > 7:746072/1‑151 (MQ=255) gtgtTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGCGTGATGCTAAACCGCAgg < 3:1488397/151‑1 (MQ=255) | AGTGCTGCATACCCTTGCCGGGAAAGCGATGGTTCAGCATGTCATTGATGCTGCGAATGAATTAGGCGCAGCGCACGTTCACCTGGTGTACGGTCACGGCGGCGATCTGCTAAAACAGGCGCTGAAAGACGACAACCTTAACTGGGTGCTTCAGGCAGAGCAGCTGGGTACGGGTCATGCAATGCAGCAGGCCGCACCTTTCTTTGCCGATGATGAAGACATTTTAATGCTCTACGGCGACGTGCCGCTGATCTCTGTCGAAACACTCCAGCGTCTGCGTGATGCTAAACCGCAGG > DH1/4599343‑4599638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |