| Read alignment evidence... | |||||||||||
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aaaaaaaCACCCGTTAGGGTGTTCAATAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGACCCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCAT‑CAAA‑TTTGATTGGTTGCgggg < 7:820676/151‑1 (MQ=255) aaacaCACCCGTTAGGGTGTTCAATAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCAT‑CAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGc < 1:1370244/151‑1 (MQ=255) aaaaCACCCGTTAGGGTGTTCAATAATTGTTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTGTTACTTCAT‑CAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGcc < 3:752159/151‑1 (MQ=255) acGTTCGGGTGTTAAATATTTTTTTGCGGTGGCCGGACGCGCCCCGCCGACGTTCGCTTTATCAGCCCGACCAGCGACGAGTTTCCTCGACACCCCCTAACACTACTCCCTTTACTTCCT‑CAAA‑ATTCATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTg < 3:1374269/150‑1 (MQ=255) cgggaGGGTGTTAAATAAATGGTTGCGCTGGCCGGAATGGACCCGCAGCCGTTGGTGTTAAGCGCCCGACGAGCTACCATGCTCCGGGACCCCCCGTCAACGTACTGCGTTTACATCCT‑CATA‑ATTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGa < 1:751934/147‑1 (MQ=9) aggggTGTTCAATCATTGGTGGCGCTGGCCGGACGCGCGCCGTCGGCCTTCGGGATATCAGCCCGACGAGCGCCCAGGCTGCGGGACCCCGCGTCACCCAACTGCCTGTACATCAT‑GTAA‑ATTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAAc < 7:105224/148‑1 (MQ=9) ggggTGTTCAATCATTGGTGGCGCTGGCCGGACGCGCGCCCCCGCGCTTGGCGTTATGCGCCCGCCGAGCTACGAGGCTGCGGGAGCCCCCGTCACCGTACTGCTTCTACTTGCT‑CAAA‑ATTCATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACcg < 7:768101/150‑1 (MQ=9) tgtTCAATAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTTACTTCAT‑CAAA‑tt < 2:971685/116‑1 (MQ=18) ggTTGCGGGGGCCGGAGTTTATCCCACCCCCTTCGGTTAATGCGCCCGACGTGGTACCAGTCTGCTCCACCCCGCTACACCGAACTGCGTTTACTTCAT‑CATA‑TATGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTAt < 7:1114515/151‑1 (MQ=11) tcttcgcgaCCCCACTTCACCGTACTCCGTCGACTGCCT‑CATA‑TTTCATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTACTtcatca < 5:971152/142‑1 (MQ=14) cACCGTACTGCTTTTACTTCAT‑CAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACAGTAATCCATGACTTCATCACATTTTAATTCGTTGc > 4:775942/1‑149 (MQ=17) | GAATGGCGCTTTTTTATGGGAGACCAGAAACAAAAAAACACCCGTTAGGGTGTTCAATAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTTACTTCAT‑CAAA‑TTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGCTTTACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGC > DH1/936019‑936306 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |