Read alignment evidence... | |||||||||||
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Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
AATCCCGTCGTAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGTTC > DH1/3184437‑3184734 | aaTCCCGTCGTAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACACCAGCCAAATTAATct > 5:752975/1‑149 (MQ=255) ccGTCGTAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTAAAGACg > 7:345249/1‑151 (MQ=255) tcgtAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTATTAAAGagggct > 5:62304/1‑146 (MQ=255) 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cAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCtttt > 6:544218/1‑151 (MQ=255) aaTTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTc > 3:1050004/1‑151 (MQ=255) aTTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCt > 6:407278/1‑151 (MQ=255) ttATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGc > 1:649020/1‑151 (MQ=255) atcgacAAGCCGCGTCCCTTGCAACACCACCCAGTGGGGGTAGCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGc < 3:570956/146‑1 (MQ=21) atcgacAAGCCGCGTACCTTTGAACTCCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTg < 1:491787/145‑1 (MQ=21) cgacAAGCCGCTTAACTTGAAACAGCACCCAGTTGGGGTATCCCCAAGCGGTAAGGCACCGGATGCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTg < 1:1449418/145‑1 (MQ=21) ttCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGtt > 7:1506266/1‑151 (MQ=255) ttCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGtt > 7:1316831/1‑151 (MQ=255) ttCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGtt > 7:492528/1‑151 (MQ=255) ttCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTAACCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGATCTTTTTGCTTTTCTGAGtt > 4:1339547/1‑151 (MQ=255) tCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAAGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGttc > 8:1274314/1‑151 (MQ=255) cAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGttc > 2:1026975/1‑150 (MQ=255) cAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGttc > 2:187923/1‑150 (MQ=255) cAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGCCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGttc > 3:988219/1‑150 (MQ=255) | AATCCCGTCGTAGCCACCAAATTCTGAATGTATCGAATATGTTCGGCAAATTCAAAACCAATTTGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTGATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCAATTTATTCAAGACGCTTACCTTGTAAGTGCACCCAGTTGGGGTATCGCCAAGCGGTAAGGCACCGGATTCTAATTCCGGCATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTGCTTTTCTGCGTTC > DH1/3184437‑3184734 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |