| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | DH1 | 490,607 | Δ4 bp :: repeat_region (+) +9 bp :: Δ1 bp | coding (3102‑3110/3801 nt) | yhdP → | DUF3971 domain‑containing protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | DH1 | = 300335 | NA (NA) | 346 (1.060) | 195/300 | 0.0 | 97.0% | noncoding (772/773 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 490607 = | 10 (0.030) | coding (3102/3801 nt) | yhdP | DUF3971 domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 370 total aligned reads displayed.
GCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAA‑GTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATT > DH1/299418‑299715 | gCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAA‑GTTACTTTTAATGTCg > 6:94401/1‑151 (MQ=255) aTGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAA‑GTTACTTTTAATGTCGGt > 7:383499/1‑151 (MQ=255) aTGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAA‑GTTACTTTTAATGTCGGt < 6:202662/151‑1 (MQ=255) 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aTGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATTACTATGTCATGCACCTCCACCGATTATGAGAACGACACCGACTTCCGTCCCACCCGAGCCACCTCCAGCCACAGATACaacatatgacaaaca > 4:234286/1‑136 (MQ=11) aTGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCtaa > 7:447234/1‑148 (MQ=14) | GCATGGTTTACAATGATTTTTGTTTCCTTTTGATTATTATGAACAACTGTCCATGATTTCGTTTAAGAATGAAGAGAAATCACTAAACGAACTGAATATATTTTCTGTGCCAATATTATCTCTAATTTCAAAAAA‑GTTACTTTTAATGTCGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATT > DH1/299418‑299715 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |