| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | DH1 | 4,549,890 | Δ6 bp | coding (1051‑1056/1266 nt) | rhlB → | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 4549889 | 20 (0.060) | 332 (1.050) | 190/290 | 0.0 | 94.8% | coding (1050/1266 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
| ? | DH1 | 4549896 = | 17 (0.050) | coding (1057/1266 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB | |||||
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GAATTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACG > DH1/4549740‑4550039 | aaTTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCA > 7:41247‑M1/1‑149 (MQ=255) aTTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGGCTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagc > 2:653239‑M1/1‑148 (MQ=255) aTTTACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGCCTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGgc > 4:14317/1‑151 (MQ=255) tttACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGTCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGAATTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcg > 2:468488‑M1/1‑147 (MQ=255) ttACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcgg > 5:301756‑M1/1‑146 (MQ=255) tACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGgcgc > 3:254703/1‑150 (MQ=255) aCCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtc > 1:539913‑M1/1‑144 (MQ=255) aCCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtc > 7:971019‑M1/1‑144 (MQ=255) ggCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactcta < 4:581406‑M1/151‑14 (MQ=255) ggCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactct < 1:1140088‑M1/150‑13 (MQ=255) cTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcc > 2:739966‑M1/1‑132 (MQ=255) cTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcc > 6:994053‑M1/1‑132 (MQ=255) ggATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctg < 8:876855‑M1/151‑22 (MQ=255) ggATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcct < 8:350377‑M1/150‑21 (MQ=255) ggATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcct < 5:625554‑M1/150‑21 (MQ=255) gATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctgg < 3:788108‑M1/151‑23 (MQ=255) atatTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggc > 7:200688‑M1/1‑128 (MQ=255) atTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgt < 6:84590‑M1/151‑26 (MQ=255) atTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgt < 2:1258448‑M1/151‑26 (MQ=255) tgcttgccACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGAATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagccttgcgagtg > 8:641266‑M1/4‑122 (MQ=255) gggtgccACGGACGTTGGCGCGCGTGGTTTACATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgt < 4:941994‑M1/145‑28 (MQ=255) ggTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtg < 7:625672‑M1/149‑29 (MQ=255) gCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagag < 5:35369‑M1/150‑34 (MQ=255) ccGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgc > 1:1238708‑M1/1‑113 (MQ=255) cGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgc > 5:7045‑M1/1‑112 (MQ=255) cGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgc > 2:959449‑M1/1‑112 (MQ=255) gACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcat > 4:288684‑M1/1‑111 (MQ=255) gACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcat > 8:171061‑M1/1‑111 (MQ=255) gACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTAGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcat > 6:46305‑M1/1‑111 (MQ=255) aCGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcatt < 7:67148‑M1/151‑42 (MQ=255) cGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattg < 8:1162523‑M1/151‑43 (MQ=255) ggtgcCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGGCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattga < 2:1198369‑M1/149‑44 (MQ=255) gTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattga < 7:255463‑M1/151‑44 (MQ=255) gTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattg > 5:135452‑M1/1‑108 (MQ=255) gTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattg > 4:1155010‑M1/1‑108 (MQ=255) cgcgcgTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttg > 3:558364‑M1/1‑103 (MQ=255) cgcgTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcc > 2:146650‑M1/1‑101 (MQ=255) ggTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgcta < 3:1085068‑M1/151‑56 (MQ=255) tgtatatTCGTGCTGTGACGTTTGTTTTTAATTTCGATTTATGCGATGACTGTGTAGATTACGTTCACCGTATTGGTTGTACAGGTCGCG‑‑‑‑‑G‑AAGCGGTCACTCTTTCTGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGGATTGAATTTGCCTGCTATTg < 6:194859/147‑1 (MQ=255) gCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCGGATGACTGTGAAGATTACGTTCACGGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattga < 7:735500‑M1/150‑60 (MQ=255) gCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattg > 4:1052085‑M1/1‑91 (MQ=255) tCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagaccta < 2:869143‑M1/150‑66 (MQ=255) ccGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagacctat > 5:441160‑M1/1‑84 (MQ=255) cGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagacctatat > 5:95362‑M1/1‑83 (MQ=255) cGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagacctatat > 1:336019‑M1/1‑83 (MQ=255) aGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCtat > 7:1088099/1‑151 (MQ=255) gTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagacctatattggtc < 1:154619‑M1/151‑74 (MQ=255) gTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAagcggtcactctatcagcctggcgtgtgaagagtatgcattgaatttgcctgctattgagacctatattggtc > 3:643701‑M1/1‑78 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |