| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | DH1 | 1355966 = | 130 (0.400) | 144 (0.450) +CTTC |
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| ? | DH1 | = 3099542 | NA (NA) | noncoding (268/268 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
CTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAT > DH1/3099392‑3099692 | tcaaACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTCAGCTAACGAcccc > 5:559960/1‑151 (MQ=17) caaACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccc < 2:1186174/150‑1 (MQ=32) caaACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCCAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccat > 4:1138943/1‑149 (MQ=14) aaaCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccat > 6:822272/1‑148 (MQ=14) aaaCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCtt < 1:1116030/151‑1 (MQ=33) aaaCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCtt < 7:745165/151‑1 (MQ=33) aaCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTg < 8:595453/151‑1 (MQ=34) aaCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACAAATTGATTAAAACTCAAATGCTAAACCAACTGAGATAACGAACCATTg > 4:560249/1‑151 (MQ=11) aCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCATATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGc < 4:54594/151‑1 (MQ=25) aCCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGc < 4:1033948/151‑1 (MQ=35) ctgctgCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGATCTACGAACTGCGCTCACGACCCCtggagg > 1:1266112/1‑146 (MQ=11) gctgcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAcccataccgggg > 7:1057495/1‑142 (MQ=9) gcAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGAt < 5:788317/149‑1 (MQ=39) 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aTAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAAACTGCGGCAAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACTCACCCTTGGGGGATTATCCTTCAATAATAATTCAGGAtggtgg > 4:225342/1‑151 (MQ=14) aGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTggg < 1:1077746/150‑1 (MQ=255) aGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTggg < 2:1212320/150‑1 (MQ=255) aGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTggg < 3:1156815/150‑1 (MQ=255) aGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTggg < 6:1258678/150‑1 (MQ=255) 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aGTCAACTGCTCTACCACCTCAGCTACCGCCCCCTTGCCGGATTATGCTGCCTTACTGATTCAGGATGGGGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGt < 2:670733/151‑1 (MQ=25) gtctactcatctACAAACTGAGCTACCGACCCCTTCCTCGATTAGGCTGCCTTCCTCATTTAGAATGGTGGGGCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTa < 5:944004/142‑1 (MQ=18) gTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTGCTCTACCAGTa < 3:169876/151‑1 (MQ=255) cAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAac < 6:674351/151‑1 (MQ=255) ctctACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGTTCTTGCAGGTTGACACCCGTTCGTCTCCCCCGGGGGGCCGTTGCTACCGCAACTTTATCGTGCCCGTTATAGACCAGTAACCACCtt > 5:872799/1‑151 (MQ=255) cactACCAACTCAGCTATGGCCCGCTTGCGGGATTCTGCTGCGTTAATCATTTAGTATGGGGGGGCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCtt < 5:390070/149‑1 (MQ=21) ctACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCtt < 4:1235757/149‑1 (MQ=255) ctACCAACTCAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCtt < 8:532257/149‑1 (MQ=255) aCCAACTGCGCTAACGACACCTTGCGGTATTATGCTGCCTTAATCATTGAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTTTCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTa < 1:1204400/149‑1 (MQ=255) cAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTACGTCTCGCACTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCGTCACCATCTCGACCAGTCAACACCATTAAAtt > 3:840486/1‑151 (MQ=25) aaCTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtg < 7:1189481/151‑1 (MQ=255) gAGCTAACGACCGCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggtgg < 5:863573/151‑1 (MQ=255) gAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggtgg < 5:532483/151‑1 (MQ=255) tgCTAACGTACCCTTGCTTGATTATGCTTTCTTTATCATTCTTGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTGGTCTCGCCCTTCGGTCCGTTGCTAACGCAACTTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATtggtgg < 6:1242797/149‑1 (MQ=21) tAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCCTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCCCGTTATATACCAGTAACCCCCATGAAACTGGTGGGACg > 1:206676/1‑151 (MQ=25) aaCGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTc < 4:101862/149‑1 (MQ=255) cGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGTATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGCGTAGCTCTCGCACATCGCGCCGAAGCGAACGCCTCTGTAAGCCAGACCTTCAGTACCAGTTACCAGCATTAAATTGGGGTGTAGTg > 7:1098258/1‑150 (MQ=255) aCCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCGCTTCGGGCAGTTGCTAACGCAACGTTATGCTTCACGTTGTCTACCAGTAACCAGGTTTAAATTGGTGGGTCGTgg > 8:255503/1‑148 (MQ=37) ccccTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTACGTCTCGCACTTCGGGCCGTTGCTAACGCAAAGTTATCCTTCACGTTATATAACAGTAAAAACATTTAAATTGTTGGGTAGTGCAgg > 6:270374/1‑151 (MQ=25) acccTTGCCTGATTCTGCTTTGTTTATTTTTCAGCATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAgg < 8:715268/150‑1 (MQ=21) cccTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAgg > 7:568551/1‑150 (MQ=255) cccTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCACCCTTCCGGCCGTTGCTATCGCAACCATATCCTTCACGTTCAAAAACAGAAAACAAATTTAAAAATGTTGGTGGTGCAgg > 4:1089827/1‑150 (MQ=18) | CTCAAACCTGCTGCAGGTTCGAATCTTTGAGTATCGCAGATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCTTGCGGGATTATGCTGCCTTAATCATTCAGGATGGTGGGTCGTGCAGGATGACTCGACTTCGTCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGAT > DH1/3099392‑3099692 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |