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caatAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAt < 2:129803/147‑1 (MQ=255) caatAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTCGATTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAtt > 6:68013/4‑151 (MQ=255) caatAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTAGCGTTTTCATGCACCCTTTTTTTTAACCCGATCACGGAtt > 1:1105528/4‑151 (MQ=255) tttGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACAATACTACGCTCGAGTTTTCATGCAACGTTTTTTTTACCCAGATCACGCAttt > 3:795488/1‑151 (MQ=18) tttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAttt > 1:143214/1‑151 (MQ=255) gttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGCCGAGCTACCAGGCTGCTCCCCCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCACCCTTTTTTTGACCCCGATCACGGAttt > 1:147731/2‑151 (MQ=255) aatAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCAGTGG‑ATGCGAACTATACTCAGATCGCTTTTTCATTCAACCTTTTTTTTACCACGATAACGGAttt > 4:700746/3‑151 (MQ=18) aatAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTGATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGAttt < 8:825673/149‑1 (MQ=255) ttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATTTg > 6:992964/1‑151 (MQ=255) ttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACACCGATCACGGATTTg > 7:1104876/1‑151 (MQ=255) ttAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGCTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATTTg > 3:15009/1‑151 (MQ=255) atAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCGGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGAGCACTATAGTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATTTg < 5:798523/150‑1 (MQ=255) tAATTGGTTGCGGTGGCCGGATTTGAACCGACGACATTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATTTgg > 3:451092/1‑151 (MQ=255) aaTTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATTTgg < 1:446309/150‑1 (MQ=255) | TTTTACTTCATCAAATTTGATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCACCGTACTGC‑TTT‑ACTTCATCAAATTTTAATTGGTTGCGGGGGCCGGATTTGAACCGACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGGCTGCTCCACCCCGCGTCCGTGG‑ATGCGCACTATACTCCGCTCGCGTTTTCATGCAACCTTTTTTTTACCCCGATCACGGATTTGG > DH1/936169‑936446 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |