New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | DH1 | = 2201911 | 194 (0.400) | 249 (0.510) | 163/300 | 3.5 | 66.9% | coding (1337/1533 nt) | pntA | NAD(P) transhydrogenase subunit alpha |
? | DH1 | 2204947 = | 52 (0.110) | intergenic (‑382/‑30) | tqsA/mdtJ | AI‑2 transporter TqsA/spermidine export protein MdtJ | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
CCTGCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGCCAGCATTAATATTTTCGGT > DH1/2201761‑2202059 | ccTGCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGGGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATc > 7:1728063/1‑151 (MQ=255) gCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATctt < 3:790082/150‑3 (MQ=255) gCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATctt > 7:885289/1‑148 (MQ=255) gCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATctt < 8:308005/150‑3 (MQ=255) gCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATctt < 7:585898/150‑3 (MQ=255) gCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATct < 2:1895104/149‑2 (MQ=255) gCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATct < 6:1125221/149‑2 (MQ=255) gCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGc > 3:1569177/1‑150 (MQ=255) gCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGAGGGCGCTGGCAATAATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCg < 3:51857/149‑1 (MQ=255) cACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCAc < 2:1358376/149‑1 (MQ=255) cACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCAc < 2:926548/149‑1 (MQ=255) cACCGTGGCGTAAATACGCGGTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATcttaaaa < 4:73674/151‑7 (MQ=255) cGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATcttaaaata > 1:484614/1‑142 (MQ=255) gTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTg > 3:935193/1‑151 (MQ=255) tGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATcttaaaataatt > 5:1156294/1‑140 (MQ=255) ggCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATcttaaaataatt < 1:882834/150‑12 (MQ=255) gCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATcttaaaataattct > 6:1197300/1‑138 (MQ=255) gTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATcttaaaataattctct > 2:5543/1‑136 (MQ=255) gTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATac > 3:1834113/1‑151 (MQ=255) aaaTACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATacac < 3:686827/151‑1 (MQ=255) aaTACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACAcc > 2:1853910/1‑151 (MQ=255) aTACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCg > 6:1711959/1‑151 (MQ=255) cgcgTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTg > 5:1809570/1‑151 (MQ=255) gcgTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGa < 6:601976/151‑1 (MQ=255) gTTGATGTCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATg < 8:1290248/151‑1 (MQ=255) gTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATg < 4:1401868/151‑1 (MQ=255) tGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTc > 1:1483075/1‑151 (MQ=255) gATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGGTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTc < 2:1421508/150‑1 (MQ=255) ggagcTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTc > 4:1604500/4‑151 (MQ=255) cgcTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTccc > 6:1897697/1‑149 (MQ=255) ggCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCa < 2:963909/149‑1 (MQ=255) cAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAAcgc > 6:1403326/1‑151 (MQ=255) aaTCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATCCACCGGTGATGTCGGTCACCAAcgcg > 6:73979/1‑151 (MQ=255) aTCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGa < 7:363606/151‑1 (MQ=255) aTTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGAttt > 5:737657/1‑151 (MQ=255) ttttGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCa < 6:1292151/148‑1 (MQ=255) tttGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAggg < 3:1398607/150‑1 (MQ=255) ttGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGat > 2:1202296/1‑151 (MQ=255) ttGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGa < 5:397070/150‑1 (MQ=255) tGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGatt > 7:1408185/1‑151 (MQ=255) gCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCTAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGattat < 3:1749078/151‑1 (MQ=255) gCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGattat < 7:119024/151‑1 (MQ=255) ggATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTAttgt < 1:1688395/151‑1 (MQ=255) ggATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTAttgt < 1:83022/151‑1 (MQ=255) ggATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTAttg < 7:678009/150‑1 (MQ=255) gATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACAACGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTAttgtt > 4:849154/1‑151 (MQ=255) ggCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTc < 8:711171/151‑1 (MQ=255) gCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCg < 1:1237337/151‑1 (MQ=255) cAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCgg > 5:17749/1‑151 (MQ=255) cAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATCTCAGGGAGTATTGTTGTCgg > 2:384353/1‑151 (MQ=255) aaGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCCGGGATTATTGTTGTCggg > 6:941849/1‑150 (MQ=255) aaGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCgg > 8:1600923/1‑150 (MQ=255) aaGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCgg > 1:1372041/1‑150 (MQ=255) aaGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCgg > 4:1875333/1‑150 (MQ=255) gTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCAGatcgc > 5:1255762/1‑147 (MQ=255) gcgcCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGt < 1:650669/151‑1 (MQ=255) cgcCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGtt < 8:1861706/151‑1 (MQ=255) gcCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGAGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTg > 8:1697254/1‑151 (MQ=255) ccGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTCTGGAATCTATCGCACGCGCTGCATACACCGATGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGc > 7:762136/1‑151 (MQ=255) cGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGc > 5:121552/1‑150 (MQ=255) aaaGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACCCCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGc > 4:1474983/1‑148 (MQ=255) aGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGAtt < 1:1024661/151‑1 (MQ=255) aGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGAtt < 2:835622/151‑1 (MQ=255) ttCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGcc > 3:974217/1‑151 (MQ=255) ccTTGGGCACTGCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAg < 8:421443/151‑1 (MQ=255) tGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGggc > 8:1458474/1‑151 (MQ=255) gggCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGggcg > 8:1177434/1‑151 (MQ=255) tCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTgg < 1:424327/149‑1 (MQ=255) tCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGt > 2:156969/1‑151 (MQ=255) aCCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTa < 6:548122/151‑1 (MQ=255) gTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCt > 3:1052908/1‑151 (MQ=255) tttCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCtt < 7:1126728/150‑1 (MQ=255) tttCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTc > 2:1703688/1‑151 (MQ=255) ttCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATATATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTcc > 1:215517/1‑151 (MQ=255) cgcgCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCt < 3:356728/150‑1 (MQ=255) agcgcTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTAGATGTCGGTCACCAACGAGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGAACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCtt > 8:1530033/2‑151 (MQ=255) gcgcTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTa < 1:1185121/151‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTa < 6:330571/151‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTa < 1:1428222/151‑1 (MQ=255) gcgcTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTa < 4:692506/151‑1 (MQ=255) gCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGtttt > 1:1862355/1‑150 (MQ=255) cTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTATGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGCGCGCTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATc > 8:666708/1‑151 (MQ=255) gCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATcgc < 6:1806591/151‑1 (MQ=255) 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ggTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTta < 7:1648751/151‑1 (MQ=255) gTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTtat < 2:1503452/151‑1 (MQ=255) attaCGTGGTCTGGAATCTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAg < 8:386202/150‑1 (MQ=255) ttaCGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGcc > 2:1337402/1‑151 (MQ=255) aCGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGCCa < 5:892956/150‑1 (MQ=255) gtggtgTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGCCAGCa < 3:850792/151‑1 (MQ=255) gtgGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGCCAGCATTaa < 4:507259/150‑1 (MQ=255) ggAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGCCAGCATTAatat < 5:1900923/151‑1 (MQ=255) gAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGCCAGCATTAATAtt > 6:1349099/1‑151 (MQ=255) aTGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGCCAGCATTAATAtttt > 2:1764988/1‑151 (MQ=255) tGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGCCAGCATTAATATTTTc > 4:1075523/1‑151 (MQ=255) aTCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGGCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGCCAGCATTAATATTTTCGGt < 3:763531/151‑1 (MQ=255) | CCTGCTCACCGTGGCGTAAATACGCGTTGATGGCGCTGGCAATCATTCTTTTTGGCTGGATGGCAAGCGTTGCGCCGAAAGAATTCCTTGGGCACTTCACCGTTTTCGCGCTGGCCTGCGTTGTCGGTTATTACGTGGTGTGGAATGTATCGCACGCGCTGCATACACCGTTGATGTCGGTCACCAACGCGATTTCAGGGATTATTGTTGTCGGAGCACTGTTGCAGATTGGCCAGGGCGGCTGGGTTAGCTTCCTTAGTTTTATCGCGGTGCTTATAGCCAGCATTAATATTTTCGGT > DH1/2201761‑2202059 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |