| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 3970042 | 293 (0.600) | 301 (0.660) | 176/282 | 1.3 | 50.4% | intergenic (‑128/‑86) | fimA/ECDH1_RS19620 | type‑1 fimbrial protein, A chain/hypothetical protein |
| ? | DH1 | = 3970338 | 317 (0.690) | intergenic (+22/+58) | ECDH1_RS19620/fimE | hypothetical protein/tyrosine recombinase | |||||
Only 100 of 650 total aligned reads displayed.
AGAAACGTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCAC > DH1/3970188‑3970488 | aGAAACGTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGtt > 1:395024/1‑151 (MQ=255) gAAACGTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTt < 6:1074858‑M2/151‑2 (MQ=255) aaCGTTAGCTTTACATATAGCGGATGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtgg > 8:1651679‑M2/1‑148 (MQ=255) aaCGTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtgg < 4:1821513‑M2/151‑4 (MQ=255) aGCTTTACATATAGAGTATGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTATATGCTTTTTTTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaa > 2:483867‑M2/1‑142 (MQ=255) ttACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTg < 3:1490456/150‑1 (MQ=255) tACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTc > 8:559090/1‑151 (MQ=255) cATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttc > 5:1916476‑M2/1‑135 (MQ=255) atatAGCGGAGGTGATGTTAAATTAATTTACAATAGAAAAAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttca > 4:1716859‑M2/1‑134 (MQ=255) ataGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGt < 5:173926/150‑1 (MQ=255) taGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatct < 3:458966‑M2/151‑21 (MQ=255) ggAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGtatttat > 4:259470/1‑151 (MQ=255) gAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATATAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTTTTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGtatttatt < 5:1523980/151‑1 (MQ=255) aGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTatttattt < 1:156947/151‑1 (MQ=255) gTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAACCAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATATATGATATGGACAGTTTGGCACGAATTGTCTTGTATTTATTTGt > 6:1886301/1‑151 (MQ=255) gTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGt > 4:647672/1‑151 (MQ=255) gtgAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaa > 5:1272935‑M2/1‑118 (MQ=255) gtgAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGttttt < 8:913301/150‑1 (MQ=255) gtgAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGttttt < 3:671389/150‑1 (MQ=255) gAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTa < 4:877400/151‑1 (MQ=255) aaaTTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTa < 4:1441622/150‑1 (MQ=255) aattaattTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccacaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtg < 4:1522228‑M2/151‑38 (MQ=255) taattTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgc < 6:975322‑M2/149‑39 (MQ=255) aattTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTtta < 2:1194429/151‑1 (MQ=255) attTACAATATAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTttat < 8:1320184/151‑1 (MQ=255) tACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgtt > 5:1649555‑M2/1‑106 (MQ=255) aCAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttgg > 4:734936‑M2/1‑105 (MQ=255) actAGAAATACTTTACATATCCAACAGGTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCaa < 8:258644/149‑1 (MQ=255) aaTAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggca > 5:1414996‑M2/1‑103 (MQ=255) aaTAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCaa < 8:1502531/151‑1 (MQ=255) aaTAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCaa < 2:665704/151‑1 (MQ=255) aGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATa > 8:792931/1‑150 (MQ=255) aaaTAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaa > 4:1147940‑M2/1‑98 (MQ=255) aataatTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAAGTTATTTATGATATGGACATTTtggcaccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgaagtgttggaagtcaa < 1:1071544‑M2/150‑54 (MQ=255) ataatTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTa < 5:497985/151‑1 (MQ=255) tattTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaact > 2:1853993‑M2/2‑94 (MQ=255) aatTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTaaa < 8:70424/151‑1 (MQ=255) aatTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTaaa < 3:84086/151‑1 (MQ=255) tttACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgt < 7:1620272‑M2/151‑60 (MQ=255) tttACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAAAATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACACTTtggccccaaatctttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgt < 3:1138075‑M2/151‑60 (MQ=255) ttACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtt < 1:668287‑M2/151‑61 (MQ=255) ttACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATc > 7:229284/1‑150 (MQ=255) tACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgttt < 1:1003798‑M2/151‑62 (MQ=255) cATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTGTTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttac > 3:1872242‑M2/1‑88 (MQ=255) cATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAAc > 6:1260011/1‑151 (MQ=255) cATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAAc > 5:1818311/1‑151 (MQ=255) tatCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttaca < 8:453911‑M2/150‑65 (MQ=255) atCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaa > 8:1824875‑M2/1‑85 (MQ=255) cAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaac < 2:431211‑M2/151‑69 (MQ=255) cAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaa > 8:1031706‑M2/1‑83 (MQ=255) cAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACctctt > 2:1503105/1‑151 (MQ=255) cAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACctct < 6:1479407/150‑1 (MQ=255) aaCAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACctcttct < 5:823182/151‑1 (MQ=255) aaCAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACctcttct < 8:639818/151‑1 (MQ=255) aGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagt < 3:248749‑M2/151‑74 (MQ=255) atattCTATTTGTCTTTTTTTTATATTTTTATGCTTTAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgta > 2:1640181‑M2/3‑74 (MQ=255) aTGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAAt > 6:772283/1‑151 (MQ=255) gCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacaga > 3:1708469‑M2/1‑70 (MQ=255) gCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAAtt < 3:346758/150‑1 (MQ=255) ttttGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaac > 4:1021595‑M2/1‑67 (MQ=255) ttGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgact < 2:275685‑M2/151‑87 (MQ=255) ttGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGt > 4:394861/1‑151 (MQ=255) gTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGttt < 7:757486/151‑1 (MQ=255) gTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATg > 6:1710461/1‑151 (MQ=255) ttttttAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggca > 3:1217659‑M2/1‑59 (MQ=255) tttttAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccat > 3:1325014‑M2/1‑58 (MQ=255) ttttAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgt < 1:800482‑M2/151‑95 (MQ=255) ttttAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATgag < 7:1853072/150‑1 (MQ=255) tAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGatt < 4:1255764/150‑1 (MQ=255) aaTATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTATGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGatta < 7:1151110/150‑1 (MQ=255) tatTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccaggtcgattt < 6:1544458‑M2/151‑101 (MQ=255) ttttATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgattt < 1:127971‑M2/148‑101 (MQ=255) ttttATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTAtttctt > 1:544624/1‑151 (MQ=255) ttttATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTAtttct < 7:1679397/150‑1 (MQ=255) tttATGCTTGATAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggcccaaaatgtttcatcatttgggggaaaactctgcagtgttggcagtcaaaatagtttacaaaacaaagtgtacagaaagaatgcccatctccatttaga < 1:918‑M2/150‑104 (MQ=255) gCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATAATTTCTTTCCCa > 5:931077/1‑150 (MQ=255) ttGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATa > 3:626636/1‑150 (MQ=255) tGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgatttagaaatagtt > 3:1403361‑M2/1‑39 (MQ=255) gagaAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgatttagaaatagttttt > 2:862620‑M2/1‑38 (MQ=255) gagaAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgatttagaaatagtttt > 1:1764566‑M2/1‑38 (MQ=255) gagaAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAAt < 7:669360/150‑1 (MQ=255) gagaAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATc > 6:352952/1‑151 (MQ=255) gagaAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATc > 1:270283/1‑151 (MQ=255) agaAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgatttagaaatagtttttt > 2:173135‑M2/1‑37 (MQ=255) aaaaTACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGc > 1:466588/1‑150 (MQ=255) aaaaTACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTAACAATAAGTTAAAACAAACCTCTTCTCTTTTAAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCAATAATCCCGc > 4:1615613/1‑150 (MQ=255) aTACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgatttagaaatagttttttgaaagga > 7:401478‑M2/1‑30 (MQ=255) aTACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgatttagaaatagttttttgaaagg < 3:1644961‑M2/150‑121 (MQ=255) tACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAAc > 7:1307284/1‑151 (MQ=255) aCGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAAc < 7:1466307/150‑1 (MQ=255) cGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgatttagaaatagttttttgaaaggaaag > 6:698269‑M2/1‑27 (MQ=255) cTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGagaagc > 3:533595/1‑151 (MQ=255) ttatttatGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGagcaga > 5:272070/1‑149 (MQ=255) tatttatGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCAATAATCCGGCAAAACGAGCAGCAt > 4:1341687/1‑151 (MQ=255) atGATATGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgatttagaaatagttttttgaaaggaaagcagcatgaaaat < 4:527852‑M2/151‑137 (MQ=255) atatGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgatttagaaatagttttttgaaaggaaagcagcatgaaaatta < 1:1392326‑M2/150‑139 (MQ=255) atatGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgatttagaaatagttttttgaaaggaaagcagcatgaaaatta < 2:1057508‑M2/150‑139 (MQ=255) atGGACAGTTtggccccaaatgtttcatcttttgggggaaaactgtgcagtgttggcagtcaaactcgtttacaaaacaaagtgtacagaacgactgcccatgtcgatttagaaatagttttttgaaaggaaagcagcatgaaaattaaa < 7:1765195‑M2/150‑141 (MQ=255) cAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAAc < 5:619756/151‑1 (MQ=255) aGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACg > 7:580482/1‑151 (MQ=255) | AGAAACGTTAGCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCAC > DH1/3970188‑3970488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |