| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 4549889 | 276 (0.570) | 268 (0.570) | 174/290 | 1.8 | 50.1% | coding (1050/1266 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
| ? | DH1 | 4549896 = | 266 (0.560) | coding (1057/1266 nt) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB | |||||
Only 100 of 551 total aligned reads displayed.
ACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCCCGC > DH1/4549746‑4550046 | ttacccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCgg > 4:973662‑M2/147‑151 (MQ=255) ccgtggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCAc > 7:723951‑M2/143‑151 (MQ=255) aTCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCActc > 1:352165/1‑151 (MQ=255) tCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCActct > 7:841527/1‑151 (MQ=255) tCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCActct > 2:1889468/1‑151 (MQ=255) ggcgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCActct > 1:233112‑M2/139‑150 (MQ=255) ggATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTAt < 2:1628694/150‑1 (MQ=255) ggATATTCTGGTTGCCACCGAAGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTAt < 5:358881/150‑1 (MQ=255) cgatctggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATc > 5:1038598‑M2/137‑151 (MQ=255) atatTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATc > 7:347098/1‑149 (MQ=255) atTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGcc > 7:1116716/1‑151 (MQ=255) tCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCt < 4:1115012/150‑1 (MQ=255) ggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTg < 7:1024723‑M2/21‑1 (MQ=255) ggatattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTg < 1:908424‑M2/21‑1 (MQ=255) tattctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCg > 3:853421‑M2/128‑151 (MQ=255) tctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCgtg < 1:1866275‑M2/26‑1 (MQ=255) tctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCgtg < 7:632647‑M2/26‑1 (MQ=255) tctggttgccaccgacgttgccgcgcgtggtttgcatattccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCgtg < 4:226149‑M2/26‑1 (MQ=255) 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tCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTga < 8:1034109/150‑1 (MQ=255) attccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCt < 1:1319891‑M2/64‑1 (MQ=255) aGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGTAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCtat > 7:1275404/1‑151 (MQ=255) aGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCtat > 4:590503/1‑151 (MQ=255) ccggcagtgacgcacgtctttaactacgatttacccgatgactgtgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCtat > 8:1559972‑M2/85‑150 (MQ=255) 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aTTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCAtt > 4:500644/1‑151 (MQ=255) aTTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCAtt < 3:590356/151‑1 (MQ=255) tgaagattacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATtg > 6:268693‑M2/41‑151 (MQ=255) cGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATtgatg < 1:1124313/151‑1 (MQ=255) tacgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGAcc < 1:52368‑M2/117‑1 (MQ=255) acgttcaccgtattggtggtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTTTGGATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCg < 8:510210‑M2/118‑1 (MQ=255) cgttcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGAt > 7:1491873‑M2/32‑151 (MQ=255) tcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCt < 6:578980‑M2/122‑1 (MQ=255) tcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTg > 6:745543‑M2/29‑151 (MQ=255) tcaccgtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTg > 1:643210‑M2/29‑151 (MQ=255) gtattggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCaa > 4:87198‑M2/24‑150 (MQ=255) gTCGTACTGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCaat < 5:1294895/151‑2 (MQ=255) attggacgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTCAATTTGCCTGCTATAGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAAc < 2:1036273‑M2/130‑1 (MQ=255) gTACAGGTCGGGCAGGCGCAAGCGGTCACTATATCAGCCTGTCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAAcc < 6:1448004/151‑1 (MQ=255) gTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGGGGTCGCTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTGACTCAATTCCGGTAAGCAAATACTATCATGACGCATTGATGAGCGCTCTGCCAAAAcc > 6:912016/1‑151 (MQ=255) tggtcgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAAcc < 8:705636‑M2/131‑1 (MQ=255) aCAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCg < 3:1022160/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCt < 3:1849889/151‑1 (MQ=255) cAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCt > 4:705742/1‑151 (MQ=255) cgtacaggtcgcgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTgc < 5:1573215‑M2/136‑1 (MQ=255) gTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTgcg < 8:1497452/151‑1 (MQ=255) tCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTgcgc > 4:1845415/1‑151 (MQ=255) gcAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTc > 8:347253/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCAc > 3:1385785/1‑151 (MQ=255) cgcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATCTTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCTCTGCGCCTCACgcgc < 4:1696576‑M2/147‑1 (MQ=255) gcaAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGcc > 6:1643191‑M2/4‑151 (MQ=255) aAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCCCg > 5:495220‑M2/2‑151 (MQ=255) | ACCCGTGGCGATCTGGATATTCTGGTTGCCACCGACGTTGCCGCGCGTGGTTTGCATATTCCGGCAGTGACGCACGTCTTTAACTACGATTTACCCGATGACTGTGAAGATTACGTTCACCGTATTGGTCGTACAGGTCGCGCAGGCGCAAGCGGTCACTCTATCAGCCTGGCGTGTGAAGAGTATGCATTGAATTTGCCTGCTATTGAGACCTATATTGGTCACTCAATTCCGGTAAGCAAATACAATCCGGACGCATTGATGACCGATCTGCCAAAACCGCTGCGCCTCACGCGCCCGC > DH1/4549746‑4550046 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |