| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 1702500 | 254 (0.520) | 264 (0.560) | 176/292 | 1.9 | 52.9% | noncoding (5/1205 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 1703700 = | 223 (0.470) | noncoding (1205/1205 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
GCGGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1702347‑1702500‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATTA > DH1/1703700‑1703849 GCGGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGT < 6:124160/151‑1GCGGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGT < 3:537615/151‑1 GGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTA < 3:676898/151‑1 GGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTA < 1:813692/151‑1 GCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAG < 2:104057/151‑1 GCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAG < 2:93023/151‑1 CGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGT > 3:421535/1‑151 AAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCA < 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AATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGC < 7:728973/151‑1 ATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGC > 7:1684197/1‑150 AGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCAC > 1:676054/1‑142 GTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTT > 1:1636564/1‑151 TTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTT > 3:1236174/1‑150 TGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTAT > 3:625506/1‑151 CAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTG > 5:1341289/1‑151 CAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTG > 3:1438894/1‑151 AGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGG < 5:739372/151‑1 AATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTA < 6:1501231/151‑1 ATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTAT < 6:934211/151‑1 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8:851165/150‑1 CCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGTGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAG < 6:1053052/151‑1 CCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGA > 1:900289/1‑149 TGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGC > 7:277788/1‑150 GTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCAT < 3:1525297/151‑1 GTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGC < 5:1656292/149‑1 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TGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCC > 7:828239/1‑151 TCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACG > 6:1737931/1‑151 CGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTATGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGG > 7:1056614/1‑151 GTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGT < 8:183884/151‑1 TAGTTTTGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTG > 5:1832355/1‑151 TGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTG > 3:20433/1‑151 TGGCGATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCT < 8:66831/150‑1 ATATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGAT < 1:1030729/151‑1 ATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTG > 5:871367/1‑151 ATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTG < 5:364201/151‑1 ATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATT < 7:1807239/150‑1 ATTCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATT < 7:1405440/150‑1 TCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGT < 2:1181114/150‑1 TCCGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGT < 4:1578601/150‑1 CGTTAGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACATATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCAT > 8:1359624/1‑151 AGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATT < 4:1157643/151‑1 AGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATT < 4:1521664/151‑1 AGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATT > 5:1161701/1‑151 AGTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCAT < 4:421433/150‑1 GTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATT > 4:80708/1‑150 GTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATAGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTGATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATT > 4:179793/1‑150 GCGGCGGAAGAAATTAAAGAGTTGTGTCAGAATCATAATATTCCTGTTGAATTAATCCAGTGTCGGGTTAATGAAATAGAAACCTATATGGATGGTGTGCATTTGATATGCACCACTGCCAAAGTGGATCGTAGTTTTGGCGATATTCCGTTAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/1702347‑1702500‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttagTTCACGGCATGCCTTTTATTTCTGGTATCGGTATCGAAGCATTACAAAATAAAATTCTGACTATCTTACAGGGGTGACCTATGTTTTCAGAAGTCATGCGTTATATTCTCGACCTCGGCCCTACGGTGATGCTGCCGATTGTCATCATTA > DH1/1703700‑1703849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |