| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | 3970034 = | 284 (0.580) | 278 (0.610) | 173/282 | 1.6 | 51.8% | intergenic (‑120/‑94) | fimA/ECDH1_RS19620 | type‑1 fimbrial protein, A chain/hypothetical protein |
| ? | DH1 | 3970348 = | 250 (0.540) | intergenic (+32/+48) | ECDH1_RS19620/fimE | hypothetical protein/tyrosine recombinase | |||||
Only 100 of 572 total aligned reads displayed.
GCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCACAGTATGGCG > DH1/3970198‑3970497 | gCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAAt > 1:761679/1‑151 (MQ=255) atatAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTg < 4:567895/151‑1 (MQ=255) ataGCGGATGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGta < 4:1564748/151‑1 (MQ=255) ataGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGt < 7:721313/150‑1 (MQ=255) aGCTGAGGTGATGTGAAATTAATTTAAAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCTTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATAAGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGtat < 2:1105566/150‑1 (MQ=255) tcctcattcttctctccaaaaaccacctcatgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGtattt > 5:109481‑M2/139‑151 (MQ=255) tcctcattcttctctccaaaaaccacctcatgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGtattt > 1:381266‑M2/139‑151 (MQ=255) tcctcattcttctctccaaaaaccacctcatgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGta < 3:442580‑M2/10‑1 (MQ=255) attcttctctccaaaaaccacctcatgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTg < 1:1855979‑M2/18‑1 (MQ=255) gATGTGAATTTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTATCTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCCTGTATTTATTTGtt < 8:570830/150‑1 (MQ=255) ttctctccaaaaaccacctcatgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGtttt > 7:1221943‑M2/130‑151 (MQ=255) tgtgAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGttttt > 8:725235/1‑151 (MQ=255) tctctccaaaaaccacctcatgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGtt < 4:821197‑M2/20‑1 (MQ=255) ccaaaaaccacctcatgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGttttttt < 5:1620826‑M2/25‑1 (MQ=255) aaaaaccacctcatgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACtt < 7:1049583‑M2/30‑1 (MQ=255) aaaaaccacctcatgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACtt < 7:1920316‑M2/30‑1 (MQ=255) taattTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACtt < 4:182601/150‑1 (MQ=255) aaaccacctcatgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTCGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACttt > 3:33234‑M2/120‑150 (MQ=255) tttACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTttatt > 3:1714646/1‑151 (MQ=255) tACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTttatta < 2:1592788/150‑1 (MQ=255) acctcatgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTtattat > 1:1264727‑M2/115‑150 (MQ=255) catgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAAt < 5:624781‑M2/40‑1 (MQ=255) atgcaatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATa > 2:528800‑M2/110‑150 (MQ=255) caatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGtt > 5:1183896‑M2/107‑151 (MQ=255) aatataaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGtt > 3:679721‑M2/106‑150 (MQ=255) taatTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTa > 6:193204/1‑150 (MQ=255) atTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAAt > 5:1341657/1‑151 (MQ=255) ttACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATAAGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATc > 6:552512/1‑150 (MQ=255) aaacatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATc > 7:577440‑M2/101‑150 (MQ=255) acatctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCaaa < 3:1594587‑M2/53‑1 (MQ=255) catctataaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAAc > 4:384894‑M2/98‑151 (MQ=255) cATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAAc < 5:1029891/151‑1 (MQ=255) cATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGGCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATAAATAATTTAAATAAAAc > 7:1433992/1‑151 (MQ=255) cAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACctctt > 6:1023441/1‑151 (MQ=255) cAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACctct < 8:1516985/150‑1 (MQ=255) aaataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACctcttc < 1:322060‑M2/60‑1 (MQ=255) aataaagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACctcttctc < 3:809977‑M2/62‑1 (MQ=255) gTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCttt < 1:100070/151‑1 (MQ=255) aagataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATAAAACCTCTTCTCtttt > 2:1747212‑M2/86‑151 (MQ=255) tAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATATATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAAACTCTTCTAttttt > 2:1405051/1‑151 (MQ=255) agataacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCttttt < 7:171388‑M2/67‑1 (MQ=255) taacaatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAAt > 5:747286‑M2/82‑151 (MQ=255) caatagaatattaagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAAtttt < 6:80640‑M2/73‑1 (MQ=255) ttatGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTCTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATAAATAAGTTAAATCAAACATCTTCTCATTATAAttttt > 2:984804/4‑150 (MQ=255) taagccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATg > 1:1159947‑M2/68‑149 (MQ=255) ttttAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATgag < 5:944605/150‑1 (MQ=255) tttAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATgaga < 4:304518/150‑1 (MQ=255) tttAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATg > 2:860814/1‑147 (MQ=255) agccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGat < 5:565808‑M2/86‑1 (MQ=255) cccaacaaataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGatt < 7:1849628‑M2/87‑1 (MQ=255) tAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGatt > 1:876260/1‑150 (MQ=255) aaTATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGatta < 7:1620300/150‑1 (MQ=255) atatTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGattatt > 6:1690867/1‑151 (MQ=255) aacaaataaactgaacaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcacaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGattatt < 8:1692480‑M2/90‑1 (MQ=255) tttATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTAtttcttt > 6:1357541/1‑151 (MQ=255) ataaactgaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATAAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTAtttcttt > 8:320164‑M2/57‑151 (MQ=255) gCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATTAGTTAAATCAAAGCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCAt > 6:1836607/1‑151 (MQ=255) gCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCAt > 2:451453/1‑151 (MQ=255) cTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCAt > 3:1265152/1‑150 (MQ=255) gaaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATaa < 3:1786072‑M2/102‑1 (MQ=255) tGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATa < 1:168463/149‑1 (MQ=255) aaaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAAt > 3:1635985‑M2/49‑151 (MQ=255) aaaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATc > 8:1365899‑M2/48‑151 (MQ=255) aaagtttgtccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTTTTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATcc < 5:1878331‑M2/105‑1 (MQ=255) aaaaaTACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGc > 3:1210420/1‑151 (MQ=255) aaaaTACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCa < 6:338083/151‑1 (MQ=255) aTACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCaaaa < 4:174031/151‑1 (MQ=255) tccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAAc > 4:1288480‑M2/39‑151 (MQ=255) ccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAAc < 8:105142‑M2/113‑1 (MQ=255) ccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAAc < 2:731539‑M2/113‑1 (MQ=255) ccgcgatgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACg > 3:249783‑M2/38‑151 (MQ=255) aaCTTATTTATGATATCGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGagc < 6:1252744/150‑1 (MQ=255) atgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGagcag < 4:707680‑M2/119‑1 (MQ=255) atgctttcctctatgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGagc > 4:133092‑M2/33‑149 (MQ=255) aCTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGagcag < 5:240642/151‑1 (MQ=255) cTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGagc > 8:902932/1‑148 (MQ=255) gctttgctctatgagtcaaaattgccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGagcagc < 2:107564‑M2/120‑1 (MQ=255) cctctatgactcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACt < 4:1048220‑M2/126‑1 (MQ=255) atgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTgg < 7:366329‑M2/128‑1 (MQ=255) atgagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCg < 2:125097‑M2/130‑1 (MQ=255) tgagtcaaaatggccccaaTTGTATTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTAGTTTATGATATTATTTCTTTACCATAATCCGGAAAAACGAGCAGAATTAATTGCGGt > 6:1567080‑M2/20‑151 (MQ=255) atGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGt > 1:14518/1‑151 (MQ=255) atGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGt < 6:1402357/151‑1 (MQ=255) gagtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGta < 5:1430082‑M2/133‑1 (MQ=255) agtcaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGtat > 8:1010155‑M2/18‑151 (MQ=255) agtcaaaatcgccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTGTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGtat < 6:396898‑M2/134‑1 (MQ=255) aaaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAAc < 4:225808‑M2/137‑1 (MQ=255) aaaatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACg > 4:1150409‑M2/14‑151 (MQ=255) aatggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGca < 1:1566941‑M2/140‑1 (MQ=255) ggccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGcac > 5:1750576‑M2/9‑149 (MQ=255) ccccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAACTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCACAGTa < 5:425891‑M2/145‑1 (MQ=255) cccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCACAGTAt < 1:529086‑M2/146‑1 (MQ=255) ccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCACAGTATg < 1:782769‑M2/147‑1 (MQ=255) ccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCACAGTATg < 8:1220309‑M2/147‑1 (MQ=255) ccaaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCACAGTATg < 6:1156847‑M2/147‑1 (MQ=255) caaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTTTCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATATCTCACAGTATgg < 8:1866279‑M2/148‑1 (MQ=255) caaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCACAGTATgg < 6:45518‑M2/148‑1 (MQ=255) aaTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAACCCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCACATAATCCTGAAAAACGAGAAGCATTACTGGCGGTATAAAGCAAAgtattcg > 7:1133833‑M2/3‑148 (MQ=255) aTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCACAGTATGGCg < 1:650536‑M2/150‑1 (MQ=255) aTTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCACAGTATGGCg > 2:302365‑M2/2‑151 (MQ=255) | GCTTTACATATAGCGGAGGTGATGTGAAATTAATTTACAATAGAAATAATTTACATATCAAACAGTTAGATGCTTTTTGTCGTTTTTTAATATTTTTATGCTTGAGAAAAAATACGTAACTTATTTATGATATGGACAGTTTGGCCCCAATTGTCTTGTATTTATTTGTTTTTTTAACTTTATTATCAATAAGTTAAATCAAACCTCTTCTCTTTTTAATTTTTCGTTTATGAGATTATTTCTTTCCCATAATCCGGCAAAACGAGCAGCATTACTGGCGGTATAACGCACAGTATGGCG > DH1/3970198‑3970497 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |