| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | DH1 | 1,704,610 | 0 | A | G | 52.9% | 75.0 / inf | 392 | Q277Q (CAA→CAG) | ECDH1_RS08300 | galactitol permease IIC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (78/106); new base G (106/101); total (185/207) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.54e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 411 total aligned reads displayed.
GGTTTTGTGATGGGGCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGTTTGTGTGCCGGGTAA > DH1/1704461‑1704759 | ttttCTGATGGGGCTGAATATCGGCATCCTAGCGCGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAAAGGCCGCAGTGAAGCTGCTAATGCAACGGGTGAATAAACACATCATGTATGGTATAACGCCCATGGCTaaccaacc > 7:1119671/1‑148 (MQ=255) gtttGTGATGGGGCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCt < 4:586323/150‑1 (MQ=255) tttGTGATGGGGCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTc > 1:1748443/1‑151 (MQ=255) 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gtgATGGGGCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGt > 3:418235/1‑150 (MQ=255) gtgATGGGGCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTa < 7:883936/151‑1 (MQ=255) tgATGGGGCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGt > 8:558115/1‑149 (MQ=255) gATGGGGCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGt < 5:1871292/151‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTc < 3:1837996/151‑1 (MQ=255) aTGGGGCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGt < 2:772313/150‑1 (MQ=255) ggggCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCg < 7:1646121/150‑1 (MQ=255) gggCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGtt > 1:1020493/1‑151 (MQ=255) aTTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAgg > 3:16535/1‑151 (MQ=255) tATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGc < 4:771271/150‑1 (MQ=255) 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aaCGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGa < 5:100790/151‑1 (MQ=255) aCGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTACACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGAc < 6:1610989/151‑1 (MQ=255) aCGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGAc > 3:827314/1‑151 (MQ=255) aCGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGAc > 8:480478/1‑151 (MQ=255) cggcggCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAAGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACa < 6:1386596/151‑1 (MQ=255) 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gatggTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCAttt < 7:1856147/151‑1 (MQ=255) gatggTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCAttt < 7:1402293/151‑1 (MQ=255) tatattAACCCCCATCTCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAGGAGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCAtttt > 2:270595/5‑150 (MQ=255) ggTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTa < 2:1265514/150‑1 (MQ=255) tttAACGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAAtt > 1:785880/1‑151 (MQ=255) gttAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGGCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAAtt < 3:1220204/150‑1 (MQ=255) tAACGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTg < 7:531175/150‑1 (MQ=255) aaCGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCt > 8:1619685/1‑151 (MQ=255) aCGCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTg > 1:936466/1‑151 (MQ=255) cGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGt < 7:774070/151‑1 (MQ=255) gCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGtt < 8:1467875/151‑1 (MQ=255) gCCCATCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTATACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGATCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCCGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCCCTCACCATTTTAAtaccggtt > 4:1230355/1‑144 (MQ=255) gCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGtt > 1:542894/1‑151 (MQ=255) gCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGtt < 3:872621/151‑1 (MQ=255) cATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGTTtgt > 1:987542/1‑151 (MQ=255) tCGCTAAGCAGGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGTTtgtgt > 1:1431235/1‑151 (MQ=255) cgatAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGTTtgtgt < 6:763080/147‑1 (MQ=255) gCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGTTTGTGTGc > 8:791661/1‑151 (MQ=255) tAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGTTTGTGTGCCg > 5:1595635/1‑151 (MQ=255) tAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGTTTGTGTGCCg > 4:1613310/1‑151 (MQ=255) aagcTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGTTTGTGTGCCGGGTaa < 2:138619/151‑1 (MQ=255) | GGTTTTGTGATGGGGCTGATTATCGGCATCCTCGCGGGTTACGATGTCAAAGGTGTATTGCAGCTGGCGGTAAAAACGGCGGCAGTGATGCTGCTAATGCCACGGGTGATTAAACCCATCATGGATGGTTTAACGCCCATCGCTAAGCAAGCTCGTAGTCGTTTACAGGCGAAGTTCGGCGGTCAGGAGTTCCTGATTGGCCTTGATCCGGCGTTGCTGCTGGGACATACGGCGGTGGTATCGGCAAGCCTGATTTTTATCCCACTCACCATTTTAATTGCTGTTTGTGTGCCGGGTAA > DH1/1704461‑1704759 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |