Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | DH1 | 2,580,982 | 0 | T | C | 59.0% | 302.5 / inf | 469 | V209A (GTT→GCT) | adhE | bifunctional acetaldehyde‑CoA/alcohol dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (86/105); new base C (124/151); total (211/258) | |||||||||||
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Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.12e-01 |
Only 100 of 474 total aligned reads displayed.
CTGCCGGTGCTCCGAAAGATCTGATCGGCTGGATCGATCAACCTTCTGTTGAACTGTCTAACGCACTGATGCACCACCCAGACATCAACCTGATCCTCGCGACTGGTGGTCCGGGCATGGTTAAAGCCGCATACAGCTCCGGTAAACCAGTTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCTGTTGTTGTTGTTGACTCTGTTT > DH1/2580832‑2581131 | gggTGCTCCGAAATATCTGATCGGCTGGATCGATCAACCTTCTGTTGAACTGTCTAACGCACTGATGCACCACCCAGACATCAACCTGATCCTCGCGACTGGTGGTCCGGGCATGGTTAAAGCCGCATACAGCTCCGGTAAACCAGCTATc < 7:652905/150‑1 (MQ=255) cagTGCTCCGAAAGATCTGATAGCCTGGATCCATCAACCTTCTGTTGAACTGTCTAACGCACTCAAGCACCACCCAGACATCAACCTCAACCTCGCAACTGGACGACCGGGCATGCTTAAACCACCATACAGATACGGTAAACAAGTTATc > 2:2131826/3‑151 (MQ=255) ggTGCTCCGAAAGATCTGATCGGCTGGATCGATCAACCTTCTGTTGAACTGTCTAACGCACTGATGCACCACCCAGACATCAACCTGATCCTCGCGACTGGTGGTCCGGGCATGGTTAAAGCCGCATACAGCTCCGGTAAACCAGCTATCg < 5:643435/151‑1 (MQ=255) 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tGATCGGCTGGATCGATCAACCTTCTGTTGAACTGTCTAACGCACTGATGCACCACCCAGACATCAACCTGATCCTCGCGACTGGTGGTCCGGGCATGGTTAAAGCCGCATACAGCTCCGGTAAACCAGTTATCGGTGTAGGCGCGGGCa > 2:1935966/1‑150 (MQ=255) gATCGGCTGGATCGATCAACCTTCTGTTGAACTGTCTAACGCACTGATGCACCACCCAGACATCAACCTGATCCTCGCGACTGGTGGTCCGGGCATGGTTAAAGCCGCATACAGCTCCGGTAAACCAGCTATCGGTGTAGGCGCGGGCAac > 5:2026346/1‑151 (MQ=255) ggATCGATCAACCTTGTGTTGAACTGTCTAACGCACTGATGCACCACCCAGACATCAACCTGATCCTCGCAACTGGTGGTCCGGGCATGGTTAAAGCCGCATACAGCTCCGGTAAACCAGTTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAgt < 8:691338/151‑1 (MQ=255) ggATCGATCAACCTTCTGTTGAACTGTCTAACGCACTGATGCACCACCCAGACATCAACCTGATCCTCGCGACTGGTGGTCCGGGCATGGTTAAAGCCGCATACAGCTCCGGTAAACCAGTTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAg < 5:472409/150‑1 (MQ=255) gatcgatcAACCTTCTGTTGAACTGTCTAACGCACTGATGCACCACCCAGACATCAACCTGATCCTCGCGACTGGTGGTCCGGGCATGGTTAAAGCCGCATACAGCTCCGGTAAACCAGTTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAgtt < 1:909115/151‑1 (MQ=255) 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cATACAGCTCCGGTAAACCAGCTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCtgt > 5:354684/1‑151 (MQ=255) aTACAGCTCCGATAAACCAGCTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCtgtt < 1:1011826/151‑1 (MQ=255) cAGCTCGGTTAAACCAGTTATCGGTGTAGGAGCGGGCAAGACTCCTGTTGTTATGGATGAATCTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGAATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGAGAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCtgttgtt < 1:2132114/151‑1 (MQ=255) cAGCTCCGGTAAACCAGCTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCtgttgtt < 3:473675/151‑1 (MQ=255) ccGGTAAACCAGTTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCtgttgttgtt < 6:1503419/149‑1 (MQ=255) cGGTAAACCAGTTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCTgttgttgttgtt > 7:563074/1‑151 (MQ=255) tAAACCAGTTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCTGTTGTTGTTGTTGAc > 3:517147/1‑151 (MQ=255) aaaCCAGTTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCTAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCTGTTGTTGTTGTTGAct < 1:845221/151‑1 (MQ=255) aaaCCAGTTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCTGTTGTTGTTGTTGAct > 1:1178489/1‑151 (MQ=255) aCCAGCTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCTGTTGTTGTTGTTGActct < 8:954130/151‑1 (MQ=255) gTTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATAGCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCTGTTGTTGTTGTTGACTCTGttt < 3:1212977/151‑1 (MQ=255) ttATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCTGTTGTTGTTGTTGACTCTGttt > 5:193855/1‑150 (MQ=255) | CTGCCGGTGCTCCGAAAGATCTGATCGGCTGGATCGATCAACCTTCTGTTGAACTGTCTAACGCACTGATGCACCACCCAGACATCAACCTGATCCTCGCGACTGGTGGTCCGGGCATGGTTAAAGCCGCATACAGCTCCGGTAAACCAGTTATCGGTGTAGGCGCGGGCAACACTCCAGTTGTTATCGATGAAACTGCTGATATCAAACGTGCAGTTGCATCTGTACTGATGTCCAAAACCTTCGACAACGGCGTAATCTGTGCTTCTGAACAGTCTGTTGTTGTTGTTGACTCTGTTT > DH1/2580832‑2581131 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |