| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 490615 | 310 (0.620) | 218 (0.440) | 136/300 | 4.2 | 41.3% | coding (3110/3801 nt) | yhdP | DUF3971 domain‑containing protein |
| ? | DH1 | 2830574 = | NA (NA) | noncoding (5/773 nt) | repeat_region | repeat region | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
AACTTCCGTGGCTGGCCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/490467‑490615‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATACCGCTCA > DH1/2830574‑2830718 AACTTCCGTGGCTGGCCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACCGGTTTCTCGCGGCTGG < 1:530806/151‑1 tcggtgtcgGGCCGGACGCCCAAATACGATGCCAAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTCTCAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTA < 3:812479/140‑1 TCCGTGGCTGGCCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTA < 6:1756927/149‑1 CCGTGGCTGGCCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATG < 1:1319552/151‑1 CCGTGGCTGGCCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGCGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATG < 8:1421842/151‑1 GTGGCTGGCCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGAC < 6:194115/151‑1 TGGCTGGCCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACg > 8:456449/1‑150 TGGCTGGCCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACT > 3:1206698/1‑151 GGCTGGCCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTC < 3:110345/151‑1 GGCTGGCCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACT < 3:1933976/150‑1 CCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTT < 7:321347/151‑1 CGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTA < 7:1335702/151‑1 CGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTA < 3:1496439/151‑1 GGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTAT < 8:1056687/151‑1 CCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 2:1595906/1‑149 CCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGG‑AATGACTCCAACTTATTGATAGT > 8:1317519/1‑151 CAAATACGATGCACAGAGTGCTGGCTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:1247752/151‑1 ATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT > 3:229112/1‑151 ATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT > 1:1555872/1‑151 ACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT < 4:1343125/151‑1 GATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:365668/151‑1 ATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 1:1910519/1‑151 CACAGAGTTCTTGTTCTGGGGGCAAAAAATCCGTCTCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACTCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC < 6:810898/151‑1 ACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 5:1682245/151‑1 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5:314775/150‑1 gTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC < 2:1831599/150‑1 ggcTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC < 8:1978555/148‑1 GTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 7:1464060/1‑151 GTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 1:1381883/1‑151 GTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACAAATGGACTGATTGATACTGATTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 3:826705/1‑151 CTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 8:1350599/1‑151 TGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 8:623299/1‑150 TGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 7:1116713/1‑150 GGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG < 6:1035230/149‑1 GGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG < 7:794198/149‑1 GGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 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CCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTG > 3:1293053/1‑151 AATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCT < 4:702247/151‑1 AATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCT > 3:522782/1‑151 AATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCT < 7:280555/151‑1 AATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCT > 1:943591/1‑151 AATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCT > 5:1399745/1‑151 GGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCC > 5:1934294/1‑151 ACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTC < 2:1631858/151‑1 ACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTC < 3:1841285/151‑1 GATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAG < 4:1758375/150‑1 ATTGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTGCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGAAAGATGACTTTGTCATGCATCTCCACCGATTTTGAGAACTACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGAAAGGTGATGCCTC > 2:973009/1‑147 TGATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATT < 1:1749921/150‑1 ATACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAG < 1:1028346/151‑1 ACTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGT > 4:1634440/1‑151 CTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGCCTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTT > 6:1343893/1‑151 CTGGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTT > 4:1182807/1‑151 GGTTTCTCGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTT < 2:1287102/149‑1 CGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTC > 5:1267057/1‑151 CGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTC > 6:1806388/1‑151 CGCGGCTGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCT < 5:701454/150‑1 GCGGCTGCTAATGACTCGAACTAATTGAAACTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCA < 6:609587/151‑1 AACTTCCGTGGCTGGCCGGACGCCCAAATACGATGCACAGAGTGCTGGTTCTGGGGGCAAAAATTCGGTCGCATTGACAGTGATATCACCATTTCTGGCGATACGTTAACGCTGACCAATGGACTGATTGATACTGGTTTCTCGCGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > DH1/490467‑490615‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATACCGCTCA > DH1/2830574‑2830718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |