| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | DH1 | = 2478888 | 207 (0.410) | 250 (0.520) | 164/290 | 1.8 | 56.9% | noncoding (5/1204 nt) | repeat_region | repeat region |
| ? | DH1 | 2480088 = | 179 (0.370) | intergenic (‑73/‑63) | insH1/fnr | transposase/fumarate and nitrate reduction regulatory protein | |||||
Only 100 of 473 total aligned reads displayed.
AAGGTTATCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTTTTAG > DH1/2478738‑2479038 | ttATCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGactt > 7:1853811‑M1/1‑147 (MQ=255) ttttGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGc > 2:837681/1‑151 (MQ=255) tttGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGt < 1:1751283/148‑1 (MQ=255) tttGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTg < 4:923470/149‑1 (MQ=255) gTAAACATTAAACAATTTGTGCCATCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGCGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccct < 6:1590939‑M1/150‑16 (MQ=255) aaaCATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaa < 1:1639906‑M1/151‑19 (MQ=255) aaaCATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCg > 8:1458427/1‑151 (MQ=255) aaaCATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACAATTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGCTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaa < 6:1134071‑M1/151‑19 (MQ=255) aaCAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgtt > 4:335624‑M1/1‑125 (MQ=255) cAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaa < 5:1455844‑M1/151‑29 (MQ=255) aTTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaa < 7:230923‑M1/151‑31 (MQ=255) ttGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaatt > 5:850137‑M1/1‑119 (MQ=255) gtgCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCg < 6:257758/150‑1 (MQ=255) gCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgaca < 6:582805‑M1/151‑37 (MQ=255) ccAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgaca > 7:638045‑M1/1‑114 (MQ=255) ccAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTg < 3:699949/151‑1 (MQ=255) ccAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTg > 5:362228/1‑151 (MQ=255) cAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaa < 5:1676979‑M1/151‑39 (MQ=255) cAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTg > 5:1085629/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGa < 5:964117/151‑1 (MQ=255) aGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaat > 4:1026013‑M1/1‑112 (MQ=255) aGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGAc < 7:1165201/151‑1 (MQ=255) cTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatat > 7:887469‑M1/1‑110 (MQ=255) cTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatat > 7:42799‑M1/1‑110 (MQ=255) tgctcacACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatat < 6:859465‑M1/146‑42 (MQ=255) tGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAATGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTc < 7:1267943/149‑1 (MQ=255) tGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatc < 7:1656288‑M1/150‑43 (MQ=255) tGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatat < 8:136028‑M1/149‑42 (MQ=255) gTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatca < 1:189954‑M1/150‑44 (MQ=255) gTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGt > 1:1551458/1‑151 (MQ=255) ttCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaat > 7:1029210‑M1/1‑106 (MQ=255) ttCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTAGTCTGACTCAGtc > 4:1101748/1‑151 (MQ=255) cacaCTTTTATGTAAAGTTGCCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGtcat > 8:1048026/1‑151 (MQ=255) acacTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattac < 8:646358‑M1/151‑49 (MQ=255) cacTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacg < 2:649299‑M1/151‑50 (MQ=255) acTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacgg > 2:1289451‑M1/1‑101 (MQ=255) cTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggc > 5:498335‑M1/1‑100 (MQ=255) ttATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggctt < 8:756051‑M1/150‑54 (MQ=255) aTGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATttct > 3:1774214/1‑151 (MQ=255) tGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATttctt > 1:1457636/1‑151 (MQ=255) aGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGt < 1:1370964/151‑1 (MQ=255) ttACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctt > 4:1601721‑M1/1‑87 (MQ=255) tACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctat > 8:1832431‑M1/1‑86 (MQ=255) tACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTg > 8:453395/1‑151 (MQ=255) tACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTg > 3:1373315/1‑151 (MQ=255) cccTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatg > 1:1234267‑M1/1‑84 (MQ=255) ccTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAgg > 2:902607/1‑150 (MQ=255) ccTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTATTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGc < 1:316671/151‑1 (MQ=255) cTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGcc > 3:345320/1‑151 (MQ=255) tAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCg < 8:1568839/150‑1 (MQ=255) aacaacTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGa < 7:523097/150‑1 (MQ=255) acaacTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccgg < 6:775058‑M1/151‑74 (MQ=255) aacTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccgga > 4:1876976‑M1/1‑76 (MQ=255) ttAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaa > 4:1277581‑M1/1‑73 (MQ=255) aaGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcg > 1:1050936‑M1/1‑71 (MQ=255) aaGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagc < 3:1028420‑M1/150‑80 (MQ=255) aGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcg > 1:552591‑M1/1‑70 (MQ=255) ggTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCg < 3:1644024/151‑1 (MQ=255) tttCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattat > 6:1393492‑M1/1‑65 (MQ=255) cAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacg > 8:1253241‑M1/1‑62 (MQ=255) cAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATg > 4:438217/1‑151 (MQ=255) aaaTAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagattttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacgg < 4:67605‑M1/151‑91 (MQ=255) aaTAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGcc > 7:1440115/1‑151 (MQ=255) tagatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatactgcgc > 5:204022‑M1/1‑58 (MQ=255) tagatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCtt > 2:1455149/1‑151 (MQ=255) tagatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTCCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcacacctatgatcccggaaaagcgaattatacggagc > 6:1891911‑M1/1‑58 (MQ=255) agatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgca < 8:1137128‑M1/151‑95 (MQ=255) agatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgc > 5:1158810‑M1/1‑57 (MQ=255) agatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTg > 3:1859540/1‑151 (MQ=255) gatagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcat > 3:1506237‑M1/1‑56 (MQ=255) atagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGa > 1:67916/1‑150 (MQ=255) tagaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattc > 4:179441‑M1/1‑54 (MQ=255) agaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAAt < 6:1226312/150‑1 (MQ=255) gaCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCa < 6:361487/151‑1 (MQ=255) aCATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAg < 2:253323/151‑1 (MQ=255) cATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGc < 2:187458/151‑1 (MQ=255) tatatTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctg > 5:1584018‑M1/1‑48 (MQ=255) aTCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtg > 1:1014416‑M1/1‑39 (MQ=255) cTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTAGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGt > 5:285376/1‑151 (MQ=255) atatCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatc > 3:1237646‑M1/1‑34 (MQ=255) atatCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTttc > 2:39352/1‑151 (MQ=255) tatCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTttct > 3:1090847/1‑151 (MQ=255) atCGGAATTCTCTGGTGTTAAGGTTTGCTTAGGGTAGGTTCTAATAAGCTGGGAAATTCTTCTGGGCTGACTCAGTGTTTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCGGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGtttgt < 2:116991/150‑3 (MQ=17) cGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccatt > 4:1554186‑M1/1‑30 (MQ=255) cGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTttcttc < 3:1926221/150‑1 (MQ=255) ctgctgTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccagg < 5:739811‑M1/148‑128 (MQ=255) tgctgTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattg > 7:561728‑M1/1‑20 (MQ=255) tgctgTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGCTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTAATTTCATTTCTTCATGTTTGACCCGATTTTTTCTCACGTAAATGCATTGAATCACCATATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAgc > 8:1939183/1‑150 (MQ=14) tgTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGt > 3:529328/1‑151 (MQ=38) gTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagc > 7:1519365‑M1/1‑16 (MQ=255) gTTAAGGTTTGCTTAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcag < 4:216778‑M1/150‑135 (MQ=255) aaGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATc > 2:1302560/1‑151 (MQ=35) aGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATcc < 3:853299/151‑1 (MQ=34) ttGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCa < 8:24107/150‑1 (MQ=31) gCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGtt < 5:1833740/151‑1 (MQ=11) ttAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatcagccagctt > 8:1679260‑M1/1‑4 (MQ=255) ttAGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtcctatccattgccaggattgcagcatcagccagctt > 3:604355‑M1/1‑4 (MQ=255) aGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatcagccagctttg > 1:865251‑M1/1‑2 (MQ=255) aGacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacggcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatcagccagctttg > 7:908050‑M1/1‑2 (MQ=255) gacttacttgctccctaaaaagatgttaaaattgacaaatatcaattacagcttgagcagacctatgatcccggaaaagcgaattatacggcgcattcagtctggcggttgtgctatccattgccaggattgcagcatcagccagctttgc > 7:7827‑M1/1‑1 (MQ=255) | AAGGTTATCTTTTGCTGTAAACATTAAACAATTTGTGCCAGCTTGTTCACACTTTTATGTAAAGTTACCCTTAACAACTTAAGGGTTTTCAAATAGATAGACATATATTTACATCTAATATCGGAATTCTCTGCTGTTAAGGTTTGCTTAGGGAAGGTGCGAATAAGCGGGGAAATTCTTCTCGGCTGACTCAGTCATTTCATTTCTTCATGTTTGAGCCGATTTTTTCTCCCGTAAATGCCTTGAATCAGCCTATTTAGACCGTTTCTTCGCCATTTAAGGCGTTATCCCCAGTTTTTAG > DH1/2478738‑2479038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |